Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 42.9% | 115.6 / 24.6 | 70 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/6); new base C (0/30); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.60e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGT > NC_000913/1376355‑1376644 | cGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAaca < 1:115054/151‑1 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACAccc > 1:765966/1‑151 (MQ=255) ccgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTc < 2:106735/150‑1 (MQ=255) ccgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCg < 1:709914/151‑1 (MQ=255) cgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCg > 1:327550/1‑150 (MQ=255) cgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCg > 2:852813/1‑150 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGa > 2:156112/1‑150 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGAt < 2:487762/151‑1 (MQ=255) gACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGcc < 2:856461/151‑1 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 2:512181/1‑150 (MQ=255) gcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTAc > 1:7874/1‑151 (MQ=255) tAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc > 2:1003947/1‑151 (MQ=255) ccTGGCGGGCGCCCGAAAAATGGTGAGTTTTCCCCTGCGCGTACGGGAACAGGCCCCCGCGCTTACCGGACCC‑GTGTTT‑TTT‑CTCGACCCTTTAAC‑CCGCTACAAGGATCATATGAAAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc < 2:549086/148‑1 (MQ=255) gggACGGCGCCCGAAAAATGGTGAGTGATCCCCGGCGCGTCCGGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGACCCTTAAAC‑CCGCTACAAGGATAATATGACCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtc < 1:203427/148‑1 (MQ=255) gggcGGCGCCCACAAAGTGGTGAGTGTTTCCCTGCGGGTTCTGAAACAGGTCGCCGCGCGT‑CCCGAACC‑CGGGTGTTAT‑CTCGACCCTTAAAC‑CCGTTACCAGGATCATATGACCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtcg < 2:833197/146‑1 (MQ=255) ggcgggcgcccaaaaaaTGGGGAGTATTTCCCGGCGCGTACGGAAACGGGCCGCCCGGCGTCCCGGAACC‑GGGGTG‑TAT‑CTCAACCCTTAAAA‑CCGTTATCAGGATCAAAGGACCACCCCCCCCGCGGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGaa < 2:1029867/138‑1 (MQ=255) cGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc > 2:165772/1‑151 (MQ=255) ggCGCCCGTAAATTGGGGTTTGATCCCTTGGGATTACTGGAAGAGGTCGCGGGGTGTCCAGGAACT‑GGGGTG‑TAT‑TCCGAACCTTTAAC‑CCGTTATGAGAATCTTATAACCACCCCCCGAGCGAAAGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 1:313880/150‑1 (MQ=255) gACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATc > 2:720712/1‑151 (MQ=255) aCCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCt > 1:53225/1‑151 (MQ=255) ccGCAAAATGGTGAGTGATCCCCTGCGCGTACTGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCC‑GTGGTG‑TAT‑CTCAAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATAATATGATCAACCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGa < 1:673425/147‑1 (MQ=255) aaatgggTGAGTGTTCCCCGGCGGGTAGGGGAACAGTCCCCCGCGGGACCGGGACCC‑GTGTTG‑TCC‑CCCAACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGAAAACCACCGCCCCCAATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTa < 2:466526/143‑1 (MQ=255) aaaaTGGTGAGTTTCCCCCCGCCCTAACGGAAACGGGTCCCCGCGCGGCCCGGACGC‑GGGGTG‑T‑C‑CCCCAACCCTTAAACCCGTAACCAGTTTAATAGGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaa < 2:699665/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 1:571179/1‑150 (MQ=255) aaaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 1:445171/1‑150 (MQ=255) ggTGAGTGTTTCCCTGCGCTTACTGAAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCG‑GTGTTT‑TAT‑CTCGACCCTTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATAATAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGt < 1:967037/150‑1 (MQ=255) gtgagtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 1:151649/1‑151 (MQ=255) gggggtgtTTCCCGGCGCTTACTGGAACAGGCCCCCGCGCGTCCGGGACGG‑GTGGTG‑TCT‑CCCGACCCGTAAAC‑CCCCTATAAGGATCATATGATCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTa < 2:782683/146‑1 (MQ=255) gagtgaTCCCCGGCGCGTACTGGAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCG‑GTGGTT‑TAT‑CTCGAACCTTAAAA‑CCGCTATCAGGATAATATGACCAACACCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAg < 2:480910/151‑1 (MQ=255) gtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 1:871986/1‑147 (MQ=255) gtgaTCCCCGGCGCGTACTGAAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGACCCTTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATAAACCCCCCCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAg < 1:644133/149‑1 (MQ=255) tgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACGGGCCGCCGCGCGTACCGGACCC‑GTGGTG‑TAT‑CTCAACCCGTAAAC‑CCGCTATCGGGATCATATGACCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt < 1:445108/150‑1 (MQ=255) gaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAtt > 2:930796/1‑150 (MQ=255) ttCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc > 1:827558/1‑151 (MQ=255) ttCCCTGCGCGTACGGGAACAGTTCGCCGCGGGTACCGGACCC‑GGGGTG‑TAT‑CCCAACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGATCAACCCCCCCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTa < 1:839091/149‑1 (MQ=255) cctgccgcgTACTGGAAGTGGCCGGCGGGCTTACCGCACCC‑G‑GGTGTTAT‑CTAAAGCCTTTAAA‑CCCCTTCAAGGATAATATGACAACCCCCCTGGCTGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCgg < 1:933372/146‑1 (MQ=255) cccTGCGTGTAGGGGAACAGGCCGCCGCGCGTACCGG‑ACG‑GGGGGT‑TATGCTCAACCCGTAAAA‑CCGTAAACGGGATAATAGAAACAACCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt < 2:505053/145‑1 (MQ=255) cgcgTCCGGAAACAGGTCGCCGCGCGTGCGGGAACC‑GGGGTG‑TAT‑CTCGAACCTTAAAC‑CCGTTATAAGGACCATATGACAAACCCCCTCGCGGGTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAt < 1:743406/150‑1 (MQ=255) gTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt > 2:630398/1‑151 (MQ=255) aaCGGGTCGCCGCGCGT‑CCGGAACCGGTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcaca < 1:650555/150‑1 (MQ=255) aCAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 1:1045082/1‑151 (MQ=255) ggTCGCCGCGCGCCCCGGAACC‑GTGTTT‑TAG‑CTCGACCCTTTAAC‑CCGCTAAAAGAAACATATAACCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAat < 1:371532/151‑1 (MQ=255) cgcgcgTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATc > 1:271412/1‑148 (MQ=255) cgcgcgCCCCGGACCC‑GTGGTG‑TCT‑CCCGACCCTTAAAC‑CCGCTATAAGTAAAATATGATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAatat < 2:989572/147‑1 (MQ=255) cgaaaCC‑GTGGTG‑TAT‑CTCAAACCTTTAAA‑CCGTTACCAGAATAATAGGATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATa < 1:255348/146‑1 (MQ=255) accggtggtt‑TAT‑CTCG‑ACCATTAAACCCCCAATCAGGATCATATGAACAACCCCCCCGCCGAGCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt < 1:366354/146‑1 (MQ=255) cc‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCTTTAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg < 2:975478/150‑1 (MQ=255) tg‑tAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc > 2:338182/1‑151 (MQ=255) g‑tAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcg > 1:966099/1‑151 (MQ=255) tAT‑CTCGACCCTTTAAC‑CCGCTATAAGGATAATATAATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc < 2:1043619/149‑1 (MQ=255) ccggAACCTTAAAC‑CCGTTACAAGGATCATATAACAAACCCCCGCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGc < 2:982490/148‑1 (MQ=255) gAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg > 2:928244/1‑151 (MQ=255) accgtttAAC‑CCGTTATCAGTTTCATATGACAAACCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg < 1:249950/145‑1 (MQ=255) accctttAAC‑CCGCTATAAGAATAATATAACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCAt < 1:790940/144‑1 (MQ=255) aCCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGCTTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGa > 2:793443/1‑150 (MQ=255) cGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACa > 2:89321/1‑150 (MQ=255) ttAAC‑CCGTTATCAGGATCATTTGACAAACCCCCCCGCCAAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACaa < 2:511530/149‑1 (MQ=255) tAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcg > 2:110956/1‑151 (MQ=255) tAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcg > 2:443731/1‑151 (MQ=255) aacccGCTATAAGGTTAATATGACCAACCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAcc < 2:1057097/146‑1 (MQ=255) cGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 2:867009/1‑151 (MQ=255) tATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGc > 2:47487/1‑151 (MQ=255) cAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCg > 2:417360/1‑151 (MQ=255) ggATAATATGACCAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 2:215751/148‑1 (MQ=255) gATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc > 2:57514/1‑151 (MQ=255) tCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt > 1:812587/1‑151 (MQ=255) cATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtg > 2:436535/1‑151 (MQ=255) cATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtg > 2:326968/1‑151 (MQ=255) atatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 2:291763/1‑151 (MQ=255) atatGACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt < 2:430166/149‑1 (MQ=255) tataaccAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtg < 2:1054409/143‑1 (MQ=255) | CGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTG‑TAT‑CTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGT > NC_000913/1376355‑1376644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |