| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,033,087 | 0 | C | A | 42.6% | 97.9 / 27.2 | 61 | Q317K (CAA→AAA) | hyaA | hydrogenase 1, small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/6); new base A (0/26); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAGGGCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACATCAGCCAG > NC_000913/1032937‑1033234 | aaaGGGCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGc > 1:949538/1‑151 (MQ=255) aaGGGCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGc > 2:584974/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCa < 1:82360/151‑1 (MQ=255) gCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑g > 2:285011/1‑151 (MQ=255) tACCACCTATAACGCCTGTTCCTCAACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGt > 2:797601/1‑151 (MQ=255) accTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTc < 2:817330/151‑1 (MQ=255) tGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCAccgccg > 1:799530/1‑151 (MQ=255) gTTCCTCCACACGATGGAATGATGGCGTTTCTTTCGCAATCCAGACTGGTCACGGCTGCATGAGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTCCGAT‑CGCGGTTCGTTCTGCAGCCGCATGATCGAGATTCCGCAAAT‑GGGTACGCATTccgccg < 1:281097/147‑1 (MQ=255) tccACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCg > 2:539798/1‑151 (MQ=255) cacaCGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTc > 1:241682/1‑151 (MQ=255) acacGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCg > 2:549986/1‑151 (MQ=255) acGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGt > 2:1109162/1‑151 (MQ=255) tGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTa > 1:981656/1‑150 (MQ=255) tGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTa > 2:550222/1‑150 (MQ=255) tGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTa > 2:143867/1‑150 (MQ=255) aattgtgGTGTTTCTTCCCCAACCCAGTGGTGCCACGGCCGCCTGGGCGGGGGGGAAATTGT‑TTTCGGGGAT‑CGCGTTCCTTTCTCCAGCCGTGTGGTCTATTTCCCGAAAAG‑GGCTCCTCTTTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAAcc < 1:763676/145‑1 (MQ=255) aaTGTTGGGTTTTTTTTCCCAACCCAGTTGGTTCAGGGCCGCCGGGGTTGGGCGGAAAATGG‑TTTCGGGGAT‑CGGGTTCCGTTCAACACCCGTGTGTTCTATATCCCCAAATT‑GGGTCCTTTTCCCCCCGCCGATACCGTCGGTTTAACcg < 2:711878/151‑1 (MQ=255) ggCTTTTTTTCCCCAACCCAGTCTGGTCACGGCTGCCGGGGTTGTGGGAAAAATGT‑TTTCGGGGAT‑CGCGGTTCTTTCTACAGCCGGGTGGTCGATTTCCCGAAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACcgcg < 2:1186442/147‑1 (MQ=255) tttttcttccCCAACCCAGTCGGGTCAGGGCTGCGGGGGCTGTGCGAAAAATGG‑TTTGGGGGAT‑CGCGGTTCTTTCTACCGCCGCGTGGTCGATATTCCGAAAAT‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTgg < 2:52981/148‑1 (MQ=255) ttttttccCCAACCCAGGCGGGCCCCGGCTCCCGGGGGTGTGGGAAAATTGT‑TTTCGGGGCT‑CGCGGTTCGTTCTACGGCGGCGGGGTGAATATCCCAAAATG‑GGGTCCTCACCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTgg < 1:768079/148‑1 (MQ=255) ttttttcCCAACCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGGGGAAAATGT‑TTTCGGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCAATATCCCGCAAGT‑GGTTACTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgt < 2:857563/147‑1 (MQ=255) tctttcCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtgg > 1:228082/1‑151 (MQ=255) ttcCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGtggtgg > 1:1140170/1‑151 (MQ=255) cAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTg > 1:550835/1‑151 (MQ=255) aGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGt > 2:134710/1‑151 (MQ=255) gttcccGGCTGCCGGGGCTGGGGGAAAAATGT‑TTTTGGGGAT‑CGCGTTTCTTTCTACGGCGGGGTGGTCGTTATCCCGAAAGG‑GGTTCCTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTg < 1:1173043/143‑1 (MQ=255) ggTCGCGGCTGCGGGGGCTGGGCGAAAATTGT‑TTTCGGGGAT‑CGCGGTTCGTCCTACCGCCGCGTGGTCGATATCCCGAAAAG‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTgg < 1:169742/149‑1 (MQ=255) ggTCACGGCTGCCTGGGGTGTGCGGAAAATGT‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCTTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATCCCGAAATT‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGtt < 2:268434/147‑1 (MQ=255) aCGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGc > 1:510644/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCg > 1:776270/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGc > 1:673159/1‑151 (MQ=255) gggCTGTGCGAAAAGTGG‑TTTCTGGGCC‑CGCGGTTCTTCCCACGGCGGCGGGGTCGATATCCCGAAAAG‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTc < 2:402730/148‑1 (MQ=255) gggCTGTGCGAAAAATGT‑TTTCGGGGTC‑CGGGGTTCGTTCAACACCCGGGGGGTCGATATCCCGAAAAG‑GGGTACTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCg < 2:379853/149‑1 (MQ=255) gggCTGGGGGAAAAATGT‑TTTCGGGGAG‑CGGGTTTCTTTCTACGGCCGGGTGGTCAATATCCCGAAAAG‑GGGTCCTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAg < 2:903238/146‑1 (MQ=255) gggttgtgggAAAATGGTTTTCGGGGAC‑CGCGTTTCTTTCAACGGCGGGGGGGTCGATTTCCCGAAAAT‑GGGTCCTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGcc < 2:646485/143‑1 (MQ=255) ggCGGTGGGAAAATTGT‑TTTCGGGGAC‑CGCGTTTCTTCCTACAGCCGCGTGTTCGATATCCCGAAAGT‑GGGTACTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCa < 2:286188/151‑1 (MQ=255) cTGTGCAAAAAATTT‑TTTCTGGGGC‑GGCGGTTCGTTCCGCCGCGGCGTGGTCTTTTTTCCGAAATT‑GGGTCCTCATCCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCa < 1:271889/149‑1 (MQ=255) gtgCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGc > 1:1022111/1‑145 (MQ=255) tgCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGcc > 1:1176216/1‑151 (MQ=255) tgCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGcc > 1:579274/1‑151 (MQ=255) gAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTg > 2:1043691/1‑151 (MQ=255) aaaTGG‑TTTTGGGGGTCCGCGGTTCTTTCTACGGCGGGGTGGTCAATTTCCCGAAAGG‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGtt < 2:306015/149‑1 (MQ=255) aTGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGAcc > 1:521831/1‑150 (MQ=255) tGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGAc > 2:846268/1‑151 (MQ=255) aT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTc > 2:360421/1‑150 (MQ=255) gcgGTTCTTTCAACGGCCGGGGGTTCAATATCCCGAAAGG‑GGGTCCCCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATaa < 2:456714/151‑1 (MQ=255) ggTTCGTTCTCCAGCCGCGTGGCCGATTTCCCGAAATG‑GGGTACTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAAc < 2:64491/150‑1 (MQ=255) ttctttctACAGCCGGGTGGTCGATTTCCCGAAAAT‑GGTTACTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAAc < 2:58524/148‑1 (MQ=255) gttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCa > 1:475374/1‑150 (MQ=255) ttctccggcggggTGGTCGATATCCCGAAAGT‑GGGTACTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAAcc < 2:649094/133‑1 (MQ=255) ctacgcccGCGTGGTCAATTTCCCGAAAAT‑GGCTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAg < 1:797598/139‑1 (MQ=255) cTACAGCGGGGGGGTCAATATCCCGAAAAG‑GGTTCCCCACCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGc < 1:1168214/146‑1 (MQ=255) cggcggggTGGTCGATA‑TCCGAAAATGGGGTACCAATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAAcc < 2:731613/140‑1 (MQ=255) 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ggTCGATTTTCCGAAAAT‑GGGTCCTCATCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAAc < 2:1033553/147‑1 (MQ=255) cGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACAt > 2:257684/1‑151 (MQ=255) ttccccGAAAGT‑GGTTACTCACCCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACa < 1:865962/143‑1 (MQ=255) ttCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACATCAGcc > 1:1081205/1‑151 (MQ=255) cGCAAAT‑GGTTACTCTTCCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACATCAGCCAg < 1:291239/150‑1 (MQ=255) | AAAGGGCCTACCACCTATAACGCCTGTTCCTCCACACGCTGGAATGATGGCGTTTCTTTCCCAATCCAGTCTGGTCACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGG‑TTTCTGGGAT‑CGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAT‑GGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAACCAGCAACCTACAGAAACCGAACATCAGCCAG > NC_000913/1032937‑1033234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |