| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,423,294 | 0 | T | C | 43.3% | 80.9 / 18.8 | 60 | intergenic (+100/+129) | yhdZ/rrfF | putative amino acid ABC transporter ATPase/5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/26); new base C (26/0); total (34/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423145‑3423438 | aTCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTc < 1:750495/151‑1 (MQ=255) aTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCG‑Ccccccccc > 1:705838/1‑145 (MQ=255) cAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTCCCCC‑CCCCCCCCCCGGcc > 2:801580/1‑148 (MQ=255) agagCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCCCCCCCCCGGCCggt > 1:1203723/1‑148 (MQ=255) gagCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCC‑CCCCCCCCCcgggc > 2:119463/1‑144 (MQ=255) gTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCg < 2:494691/151‑1 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTTCCCC‑CCCCCCCCCCGGcccgttctttccaa > 1:590761/1‑138 (MQ=255) ttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCaaa < 1:657866/150‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCCCCCC‑CCCCCCCCCCCGCCCTTGCTTTT‑C‑AACGTTCTAAtactc > 1:221453/1‑147 (MQ=255) tCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCC‑C‑AACCTTTaaa > 1:597375/1‑145 (MQ=255) tCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCCCCCC‑CCCCCCCCCGTGGCCCCGTTTTG‑C‑AACGTTTaaa > 1:983894/1‑145 (MQ=25) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTCG‑C‑AACGTTCAAAAACGCTc > 2:839346/1‑151 (MQ=21) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAGAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCcg < 1:1004964/151‑1 (MQ=255) ggTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCcgg < 1:1046732/151‑1 (MQ=255) gTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCcggc < 2:306802/151‑1 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTGCCCC‑CCACCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAAACCGCcccccg > 2:524804/1‑145 (MQ=21) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCCGGCCGTTGCTTTG‑C‑AAAGTTCAAATACGCcccc > 1:716473/1‑145 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCC‑CCCCCCCCCCGGGCGGTGCCTTG‑C‑AAACTTCCAAACCGCCCCccgcggggtt > 1:1192951/1‑147 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAttt < 2:228574/150‑1 (MQ=255) aaTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCCCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCCTTGCTTCT‑C‑AACGCTCAAAATCGCcccccccggggttgttc > 1:516702/1‑138 (MQ=255) aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTGCCCG‑CCCCCCCCCGGGGCGTGGCTTTGCC‑AACG‑TCAAAACCGCCCCccgcggggtt > 1:886081/1‑142 (MQ=255) aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCt < 1:153435/151‑1 (MQ=255) ttGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCCCCCCC‑CCCCCCCCCCCGCCGTTGCTTCT‑C‑CACGGTCAAATACCCCCCccgcggggtttt > 1:868005/1‑141 (MQ=255) ttGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCG‑CCACCCCCCCGGCCGGTGCTTTC‑C‑AACGTTTAAAAACCCTCCCCGCGGGttttttct > 2:725233/1‑145 (MQ=18) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCTCCCC‑CCACCCTCCCGGGCGGTGTTTTT‑C‑AACATTCAAAACCCCCCCccgcggcggttt > 2:831568/1‑140 (MQ=255) aaTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTc < 1:75660/151‑1 (MQ=255) aaTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCT‑CAAACTTTCAAA‑ACGCTCCCCGCGGGttt > 1:912602/1‑142 (MQ=255) tGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑C‑AAAAGTCAAATCCCCTCCCCGCGGGGTTTTCCTACTccg > 2:1104166/1‑149 (MQ=17) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCTCCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGgag < 2:1251403/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGgag < 1:1154067/150‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCCGTGCCTTG‑C‑AACACTTAAAAACCCCCCCGGCGGGTTTGTTCtcccccggggagggt > 1:232917/1‑135 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGtt < 1:1233831/150‑1 (MQ=255) aaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTCT‑C‑AACGTTCAAATTCCCCCCCCGCGGGTTTTTTCTTCTCCGGGGAGGGtt > 2:940306/1‑149 (MQ=17) aaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGACCCTCCCC‑CCACCCCCCCGGCCCTTGATTTA‑C‑AACGTTTTAATCCGCCCCCGGCGGGTTTGTCCTCCCCGGGagaggggt > 2:879277/1‑144 (MQ=255) aGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaac < 2:154778/151‑1 (MQ=255) ggctttCCATTCGGCTGGCCTTTCGCTAGTTTTGATTTCTGGCAGTATATGGCGGAAGCACTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAAACCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaac < 1:1103426/145‑1 (MQ=14) ggCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaaca < 2:456972/151‑1 (MQ=255) ggCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑C‑CACCTTTAAATCCGCTCCCCGCGGGTTTTTTCTACTCCGGGGAGGGtttcccccc > 1:972164/1‑139 (MQ=14) gCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaacaa < 2:857791/151‑1 (MQ=255) gCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAAACCGCCCCCCGCGGGTTTTTCCTACTCCGGAGAGGGTTCACCGacaaaca > 2:887142/1‑150 (MQ=14) cATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAacaaca < 1:1204881/151‑1 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCCCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCCCCCCCCGCGGATTTTTCCTACTCCGGGGAGTGTTCACCCacaaaaaa > 2:867564/1‑147 (MQ=14) cTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCG‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTTG‑C‑AACGATCAAATTCCCTCCCCGCGGGATTTTCCTACCCCGGAGAAGGGTTACCCacaaaaaa > 2:884674/1‑145 (MQ=255) tCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTTG‑C‑CAACTTTAAATCCGCCCCCGGCGGGGTTTTCCTTCTCCGGGGAGGGTTCACCGCCAAACAAAAGAaaaa > 1:1024002/1‑150 (MQ=9) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaa < 2:83108/151‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaa < 2:5561/151‑1 (MQ=255) ggCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCC‑CCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACCTTCAAATCCGCCCCCGGCGGGTTTTTCCTACTCCGGGGAGGGGTCACCGCCCAACAACAGATAaaaaaaaa > 1:344105/1‑150 (MQ=255) ccTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGc < 2:127431/151‑1 (MQ=255) gCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGGCCG‑TGCTTCC‑C‑CACGCTCAAATTCGCCCCCCGCGGGTTTTTCCTTCTCGGGAGAGGGTTTACCCACCAACAACAAAAAAAAAAAAAAGGCCaagc > 1:547982/1‑148 (MQ=255) cTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCG‑CCCCCCTCCCGGCCCGTGCTTTG‑C‑AACGTTCAAATACCCCCCCCGCGGGTTTGTTCTACTCGGGAGAGGGGTTACCGACAAACAACACATAAAACaaaaaaccc > 1:304400/1‑141 (MQ=255) gatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTcc < 2:198143/151‑1 (MQ=39) gatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACt < 2:444162/150‑1 (MQ=38) gCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCtttt < 2:111902/151‑1 (MQ=37) cgggcgTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTg > 1:160546/1‑150 (MQ=38) ggcgTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATg < 2:364431/151‑1 (MQ=38) ccTGCCCG‑CCACCCTCCGTGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTgg > 2:290559/1‑151 (MQ=255) ccTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTgg < 1:898175/151‑1 (MQ=40) gCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGc < 1:524803/149‑1 (MQ=40) cccG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAg > 1:129310/1‑150 (MQ=40) ccG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGtt > 1:689714/1‑151 (MQ=40) ccACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTccc > 1:63124/1‑151 (MQ=40) | ATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCG‑CCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑C‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423145‑3423438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |