| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,743,611 | C→A | S52Y (TCT→TAT) | mdtK → | multidrug efflux system transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,743,611 | 0 | C | A | 98.6% | 245.4 / NA | 69 | S52Y (TCT→TAT) | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (29/39); minor base T (1/0); total (30/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGTATATCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTT > NC_000913/1743464‑1743756 | aGTATATCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTatat > 1:1256341/1‑151 (MQ=255)aGTATATCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTatat > 1:692926/1‑151 (MQ=255) atatCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTg < 1:873560/151‑1 (MQ=255) tatCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGCACTTTTATcctg > 2:984001/1‑148 (MQ=255) tatCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCAACGACATGGCGGCGGGCGCTATCGGGACTTATATCTg > 2:1216182/1‑150 (MQ=255) atCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTgg < 1:999905/150‑1 (MQ=255) cAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCGCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCt < 1:282162/150‑1 (MQ=255) cAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCtt < 2:1417764/151‑1 (MQ=255) cAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCt < 2:1280780/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTACCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCAAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCTGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCgg < 2:1298188/151‑1 (MQ=255) gcgTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATc < 2:523710/151‑1 (MQ=255) tGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCtt > 1:869131/1‑151 (MQ=255) ttattaGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGGCGGTATCGGGACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCttt > 2:1392563/1‑150 (MQ=255) attagcattagcAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTgg < 1:909650/150‑1 (MQ=255) tagcattagcaATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTc < 1:1293915/150‑1 (MQ=255) agcattagcaATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCa < 1:773482/150‑1 (MQ=255) gcattagcaATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACg > 1:1161113/1‑151 (MQ=255) attagcaATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGa < 1:1314155/151‑1 (MQ=255) attagcaATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCCATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCCCgg > 2:972332/1‑150 (MQ=255) aaTCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGActgctg > 1:1413460/1‑151 (MQ=255) ccGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTgg > 1:986671/1‑151 (MQ=255) ccGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTgg > 2:435751/1‑151 (MQ=255) ccGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTgg > 1:1538492/1‑151 (MQ=255) gTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTAAAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCAt > 2:891101/1‑151 (MQ=255) tctcGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACg > 1:1356610/1‑151 (MQ=255) cgcgCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGc < 1:830538/149‑1 (MQ=255) cgcAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCGGGt < 2:1532248/151‑1 (MQ=255) cAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATATTGCCACCGAAATGGGGGCGGTAGTTATCGGTAGCTATATCTGGCTTTCCGCGGTACTGTTTTGTTACGGGCTATTGCTGGCATTTATGGCGGtt > 2:1110978/1‑150 (MQ=255) aaaTCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTa < 1:275826/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTAt > 1:742277/1‑151 (MQ=255) aTCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATcg < 2:63421/151‑1 (MQ=255) tCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGGACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATcg > 2:1122763/1‑150 (MQ=255) cGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATcgcg < 2:1501769/151‑1 (MQ=255) gCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCgcgc < 1:493567/151‑1 (MQ=255) cAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTTGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAAAGCCGGTTATCGCGCAAt > 2:1235841/1‑151 (MQ=255) aaaCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAAtt < 1:403316/151‑1 (MQ=255) aaCTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTa < 2:517212/151‑1 (MQ=255) aTGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGtt < 1:961751/151‑1 (MQ=255) aTGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGtt < 1:1550823/151‑1 (MQ=255) tGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTc > 1:883891/1‑151 (MQ=255) ttttGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCgg < 1:3595/150‑1 (MQ=255) tttGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGt < 1:1125388/150‑1 (MQ=255) ttGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTc < 1:352580/150‑1 (MQ=255) ttGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTc < 1:262020/150‑1 (MQ=255) gTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGa < 2:766605/150‑1 (MQ=255) cGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGt < 2:918052/151‑1 (MQ=255) cGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGt > 1:508750/1‑151 (MQ=255) gATACAGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGGGGCGGTTGCTATCGGGACTTATATCTGGCTTTCGGCGATCCTCTTTGGTCCCGGGCTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGGCGatggg > 2:92110/1‑147 (MQ=255) 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gcTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAgg > 2:1260890/1‑150 (MQ=255) gcTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGt < 2:408037/151‑1 (MQ=255) ataGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTg < 1:851755/149‑1 (MQ=255) gTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGAc > 2:1009239/1‑150 (MQ=255) cACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGAGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAgg > 2:927252/1‑150 (MQ=255) cGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTc > 1:502478/1‑151 (MQ=255) gACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTct < 2:1256323/151‑1 (MQ=255) aCATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGGATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctg < 1:502503/151‑1 (MQ=255) aCATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctg > 2:1484702/1‑151 (MQ=255) aTGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctggc < 2:84660/151‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctggc < 2:1228124/151‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctgg > 1:575121/1‑150 (MQ=255) ggcggcGGTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTctggct < 2:822595/150‑1 (MQ=255) ggcggTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCtggctggc > 1:82297/1‑150 (MQ=255) gTCGCTATCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGtt < 1:364490/151‑1 (MQ=255) aTCGGTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGttt > 1:1125589/1‑151 (MQ=255) gTACTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGt > 1:885064/1‑151 (MQ=255) aCTTATATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCGGGCATTAGCGCCGGTTATCCCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGTGGTGGGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACATGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGtt < 2:1327055/150‑1 (MQ=255) | AGTATATCAGTGAAGCGCGTCTGTTATTAGCATTAGCAATCCCGGTGATTCTCGCGCAAATCGCCCAAACTGCGATGGGTTTTGTCGATACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTGGCTGGCAGGTTTTGTTTCCGTT > NC_000913/1743464‑1743756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |