| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 606,612 | 0 | G | A | 46.1% | 94.7 / 34.8 | 76 | Q258* (CAG→TAG) | ybdK | weak gamma‑glutamyl:cysteine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/10); new base A (0/35); total (31/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.92e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCG > NC_000913/606470‑606759 | cgacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATc < 1:1260491/151‑1 (MQ=255) gacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAAt < 2:1126204/149‑1 (MQ=255) gaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCCGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGAGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGc > 2:226928/1‑151 (MQ=255) gaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGc > 1:55766/1‑151 (MQ=255) gaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGc > 2:716417/1‑151 (MQ=255) aTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGcc > 2:896802/1‑151 (MQ=255) ccAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCg < 1:895498/145‑1 (MQ=255) ccAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCg < 1:943409/145‑1 (MQ=255) ccAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCa < 1:5337/148‑1 (MQ=255) ggggaggggTGAGGCCCCCTTCAACCCAATGGCGACGGGCGTGAAAA‑CGGTTGAA‑TTTATCAAGCAGGTATTTTTTTTCC‑TG‑ATTTTAAAC‑C‑GGGCTTTCCGTCATTACCCGGGGGGGGGTAGCATAAATTAATCCCGCCATATTTACTGc < 2:127240/144‑1 (MQ=255) tCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGc > 2:1193751/1‑151 (MQ=255) gggTGATGCCCCCTTCACCCCAAAAGCGACGGGCGTAAAAG‑GGGTTAAA‑TTTATACAGCAGGTATTTTTTTTCG‑T‑‑TTTTTTAAA‑CGGGGCTTTCCGTAAGTACCGGGGGGGGGGTAGCTTAAATAAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCt < 2:1027552/150‑1 (MQ=255) atgaCGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAggg > 2:1139802/1‑151 (MQ=255) atgaCGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAggg > 2:1219349/1‑151 (MQ=255) atgaCGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAggg > 2:937224/1‑151 (MQ=255) ccccTACAACCCCATAGCGAAGGGCCTGAAAA‑GGGTTAAT‑TTTATACAGCAGGTAATTTTTTCCC‑TG‑ATTTTTAAG‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTACCCGGGGGGGGGTAGCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAgg < 1:1094054/144‑1 (MQ=255) ccTTCAACCCCATAGCGAC‑GGCCGGGGAA‑GGTTTTAATTTTATACAGCAGGTATTTTTTTTCC‑TT‑TTTTTAAAG‑G‑GGGCTTTCCTTCAGTACCCGGGGGGGGGTACCCTAAATAAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAAc < 2:928257/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACggg > 1:1007474/1‑151 (MQ=255) ttCAACCCCAAAGCGACAGG‑CTGGAAAGGGGTTAAT‑TTTATACAGAAGGTATTTTTTTTCC‑TG‑ATTTTAAAG‑C‑GGGCTTTCCGTCAGAACCCGGGGGGGGGTGGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAAc < 1:720375/148‑1 (MQ=255) aaccccATAGCGACAGGCCGGAAAA‑CGTTTAAA‑TTTATACAGGAGGTATTTTTTTTCC‑TG‑ATTTTAAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTACCCGGGGGGCGGTAGCTTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTa < 1:1077876/140‑1 (MQ=255) cATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCAt > 1:327178/1‑151 (MQ=255) aTAGCGACAGGCTTGAAAA‑CGTTTAAT‑TTTATACAGCAGTTAATTTTTTCCC‑TG‑TTGTTTAAG‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTACCGGGGGGGGGGTAGCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATc < 1:812651/151‑1 (MQ=255) aTAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATc > 1:944115/1‑151 (MQ=255) aCAGGCTGGGAAG‑CGTTTGAA‑TTTATACGGCAGTAATTTTTTTTCG‑TT‑TTTTTTAAG‑C‑GGGCGTCCCGTAATTACCCGGGGGGCGGTAGCCTAAATAAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCAc < 2:932834/147‑1 (MQ=255) cgggCCTGGAAA‑CGTTTGAA‑TTTATACGGCAGGTAAT‑TTTTTCC‑TT‑GTTTTTAAAGG‑GGGCGTTCCGAAATTAACCGGTGGGGGGTGGCTTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGa < 1:690434/148‑1 (MQ=255) gggCTTGGAAG‑CGTTTGAA‑TTTAT‑CAAGATGTTATTTTTTTCCGTG‑GTTTTAAAC‑C‑GGGCGTCCCTCCAGAACCTAGGGGGGGGTAGCTAAAATTATTCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAAc < 1:1003103/150‑1 (MQ=255) aGGCATGGAAA‑CGTTTAAA‑TTTATACAGCAGTTATTTTTTTTCC‑TG‑ATTTTAAAG‑C‑GGGCTTTCCTTCAGTAACGGGTGGGGGGTAGCGTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCg < 1:730842/148‑1 (MQ=255) ggCGTGAAAA‑GGTTTGAT‑TTTATACAGCAGTTATTTTTTTTCC‑TG‑ATTTTTAAC‑C‑GGGCTTCCCGTCAGAACCGGGGGGGGGGTGGCCGAAATAACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAAcc < 2:960691/151‑1 (MQ=255) ggCCTGAAAA‑GGTTTAAT‑TTTATACAGGAGTTAATTTTTTTCC‑TG‑ATTTTAAAG‑G‑GGGCTTTCCTTAAGTACCCGGGGGGGGTTAGCCTAATTTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGaa < 1:1185455/149‑1 (MQ=255) gCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCt > 2:796348/1‑151 (MQ=255) aaa‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCg > 2:109135/1‑151 (MQ=255) agggttttattttATACAG‑AGGTTATTTTTTTCC‑AGTTTTTTTAAG‑C‑GGGCCTTCCTAAAGAACCCGGTGGGGGGCTCCAGAAATTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGt < 1:38146/141‑1 (MQ=255) cGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGc > 2:184984/1‑151 (MQ=255) tGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCaa > 1:468499/1‑150 (MQ=255) aa‑TTTATACAGCAGTTATTTTTTTTCC‑TG‑TTGTTAAAA‑G‑GGGCGTCCCGTCAGAAACCAGTGGGCGGTACCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAAt < 2:632578/151‑1 (MQ=255) ttATACAGCAGGTATTTTTTTTCT‑TG‑ATTTTAAAG‑C‑GGGCGTCCCGTCAGAACCCAGGGGGGGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGa < 1:202555/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACt > 1:29146/1‑151 (MQ=255) agGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTgggg > 1:487993/1‑150 (MQ=255) gttattttttttCT‑TG‑ATGTTAAAG‑C‑GGGCGTCCCGTCAGAAACCGGGGGGGGGTAGCCTAAATAAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCg < 2:506098/144‑1 (MQ=255) ggTAATTTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAG‑G‑GGGCTTTCGGTAAGTACCAGGTGGGCGGTCGCTTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCg < 1:1095635/151‑1 (MQ=255) tAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGa > 1:1235974/1‑150 (MQ=255) tttttCC‑TG‑TTGTTAAAC‑C‑GGGCGTCCCGTAAGTACCCGGGGGGGGGTGGCTTAAATTACTCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCg < 1:103735/144‑1 (MQ=255) tttttCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATcc > 1:740720/1‑151 (MQ=255) ttCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATccc > 2:684422/1‑149 (MQ=255) cc‑TG‑TTGTTAAAG‑G‑GGGCGTCCCGTCAGTACCCGGGGGGCGTTACCTTAAATAAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGt < 1:964002/150‑1 (MQ=255) cc‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCCGTg > 1:1145283/1‑151 (MQ=255) tG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGc > 2:610177/1‑150 (MQ=255) tttttAAG‑C‑GGGCGTTCCGTAAGTAACGGGTGGGGGGTACCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGc < 1:1259723/145‑1 (MQ=255) ttttAAACC‑GGGCTTCCCGTCAGTAACCGGGGGGCGGTAGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAg < 1:65046/143‑1 (MQ=255) ttttAAACC‑GGGCGTTCCGTAAGTAACCGGGGGGGGGGAGCCAGAATTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAg < 2:360338/148‑1 (MQ=255) ttttAAA‑CGGGGCGTCCCGTAAGAACCCGGGGGGGGGTAGCCTAAATAAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTg < 2:468497/145‑1 (MQ=255) tAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCttt > 1:1059203/1‑151 (MQ=255) aagc‑GGGCGTCCCGTCAGAACCGGGGGGGCGGTAGCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCt < 1:159217/145‑1 (MQ=255) aa‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTa > 2:40559/1‑150 (MQ=255) aacggggCTTTCCGTAAGTAACCGGGGGGGGGTAGCTTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTa < 1:1182017/147‑1 (MQ=255) gggCTTCCCGTCAATAACCGGGGGGCGGTCGCTTAAATTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTaa < 2:1257330/148‑1 (MQ=255) ggCTTTCCGTAAGAAACCGGGGGGCGGTAGCAAAAATTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGc < 1:850236/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGAAGCCTGAATTAATCCCGCCTTATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCt > 2:128102/1‑150 (MQ=255) ttCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCg > 1:1130751/1‑151 (MQ=255) ttCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCg > 1:208122/1‑151 (MQ=255) ttCCGTCAAAACCAAGGGGGGGGTGGCGTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGt < 1:1139817/149‑1 (MQ=255) ccGTAAGAAACCGGGGGGCGGTAGCGTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTg < 1:131769/146‑1 (MQ=255) taaggaacaggggggCGGTGACTTGATTTACCCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGatca < 1:555530/138‑1 (MQ=255) aGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCg > 1:208829/1‑151 (MQ=255) gTAACCAGGGGGCGGTGCCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCg < 1:443304/150‑1 (MQ=255) accttgTGGGGGGTACCCAAATTCAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCgt < 2:1006992/144‑1 (MQ=255) aaCCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCgtgg > 1:46584/1‑151 (MQ=255) gTGGGGGGTAGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTa < 1:857380/150‑1 (MQ=255) gggggttAGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCgtggtg < 2:45518/140‑1 (MQ=255) ggggggTCGCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACt < 1:1086989/151‑1 (MQ=255) ggggTAGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCa < 1:716421/149‑1 (MQ=255) gaaGCCTAAATTAACCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGAc < 1:86093/149‑1 (MQ=255) gTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCACCCGTCCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATACCCCAGTCCGGATCTTTAATCCTGTCGATAATGGTGGGGTaa > 1:703177/1‑144 (MQ=255) gTAGCCTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGAc < 1:786368/151‑1 (MQ=255) ccTAAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCg < 1:266305/151‑1 (MQ=255) cTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCg > 1:257944/1‑150 (MQ=255) | CGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAA‑CGGTTGAA‑TTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCC‑TG‑ATGTTTAAA‑C‑GGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCG > NC_000913/606470‑606759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |