| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 32,653 | 0 | T | C | 43.4% | 99.9 / 30.5 | 77 | S613P (TCC→CCC) | carB | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/5); new base C (0/33); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGCCCGAACCGTATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTACCGGTT > NC_000913/32517‑32799 | cggcCCGAACCGTATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTAc > 2:425861/1‑151 (MQ=255) ggcCCGAACCGTATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACt > 1:1126928/1‑151 (MQ=255) gAACCGTATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCg > 2:982657/1‑149 (MQ=255) tATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGt > 2:675911/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAAc > 2:502667/1‑150 (MQ=255) ggTCGGGGTATCGATTTCGACTACTGTTGCGTACCCGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACAAACCCTTTATGGTTAA‑CTGTAC‑CCCGG‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACCCTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAAc < 1:617647/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTATCGAATTCGACTCCTTTTGCGTACACCCCTCGCTGGCGCTGCGGGAAGACGGTTACGAACCCATTATGTTTAA‑CTGTAC‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTACGCCACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTaa < 1:884859/148‑1 (MQ=255) ggttATCGATTTCGACTACTGTTGCGTCCCCGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAACCCATTATGGTTAA‑CTGTAC‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCC‑CCGACTACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGa < 1:308480/147‑1 (MQ=255) gttaccaaaTTCGCCTCCTGTGCCGTCCCCGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGTTTACGAAACCTTTATGTTAAA‑CT‑TAA‑CCCGGAAAA‑CC‑GTCCCCC‑CCACCTACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAg < 2:1063196/144‑1 (MQ=255) tccgccttcttttGCGTCCACTCCTCGTGGGCGCTGCGCGAAGGCTGTTCCGAACCCATTTTGGTTAA‑CT‑TAA‑CCCCG‑AAA‑CCGGTCTCCA‑CCGACTACGACTCCCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTg < 2:309220/139‑1 (MQ=255) cGACTCCTGTTGCTACCCCCCCTCCCTGGCGCGGCGCGAAGACGGTTACAAAACCATTATGTTTAA‑CTGTAC‑CCCGA‑AAA‑CG‑GTCCCCC‑CCGACGACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGa < 2:1237851/150‑1 (MQ=255) ctactGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAATACCGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGCGCTGGAAAt > 2:785195/1‑150 (MQ=255) ctactGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATc > 2:407706/1‑151 (MQ=255) ctactGTGGCGTCCACCCCTCGCGGGCGCTGCGGGAAGACGGTTACAAACCCTTTATGGTTAA‑CTGTAC‑CCCGG‑AAC‑CC‑GTCTCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGaaa < 1:853923/149‑1 (MQ=255) tcctGTTGCGTCCCCCCCTCGCGGGCCCGGGGCGAAGCCGGTTACAAACCTATTATGGTAAA‑CTGT‑A‑CCCGG‑AAACCC‑GTCTCCC‑CCGACTACGCCACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGaaa < 1:444941/146‑1 (MQ=255) tactGTGGCGTACCCGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACAAACCCATTATGTTAAC‑CTTTAC‑CCCGA‑AAA‑CC‑TTCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGaaa < 2:812796/148‑1 (MQ=255) actGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGt > 2:704300/1‑151 (MQ=255) tttggcttcccccccTCGTGGGCGCTGCGCGAAGACGTTTACAAAACCATTATGTTTAA‑TTGT‑A‑CCCGG‑AAACCC‑GTCCCCA‑CCGACTACGCCCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGt < 2:1169906/136‑1 (MQ=255) gTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCg > 1:224201/1‑151 (MQ=255) ttGCGTCCCCCCCCCGCTGCCGCTGCGCGAGGGGGATTCCAAAACCTTTATGTTTAC‑CTGT‑A‑CCCGG‑AAACCC‑GTCCCCC‑CCCCCTCCGCAACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGc < 1:73609/149‑1 (MQ=255) ttGCGTCCACGCCCCGCGGGCGCTGCGCAAAGCGGGTTCGAAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAC‑CCCGG‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGATTACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTgg < 1:125564/140‑1 (MQ=255) ttGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGt > 2:484649/1‑151 (MQ=255) ttGCGAACCCCCCTCGCGGGCGCTGCGCGAAGACGTTTACAAACCCATTATGTTAAC‑CTGT‑A‑CCCGG‑AAACCC‑GTCTCCC‑CCGACTACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTg < 2:510413/148‑1 (MQ=255) cGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATc > 2:48567/1‑151 (MQ=255) gTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCg > 2:453570/1‑151 (MQ=255) acacGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCg > 2:1084152/1‑149 (MQ=255) acacGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCg > 1:332536/1‑149 (MQ=255) ccccccTCGCGGGCGTGGCGCGAAGCGGTTTACAAACCCATTTTGTTTAA‑CTGAAC‑CCCGA‑AAC‑CC‑CTCCCCA‑CCGATTACGACCCTCCGGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCgaga < 2:1081729/147‑1 (MQ=255) cgccgcGCTGGCGCTGCGCGAAGAGGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGAAC‑CCGGG‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACACTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGaa < 1:323688/150‑1 (MQ=255) ccTCGCTGGCGCTGCGCAAAGACGTTTACAAACCCATTAT‑GTTAA‑CCGGAACCCCGG‑AAC‑CC‑GTCTCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGc < 2:184934/150‑1 (MQ=255) ccTCGCGGGCGCTGCGCGAAGCGGGTTACAAACCCTTTTTGTTTAA‑CTGT‑A‑CCCGG‑AAACCC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCGGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTAt < 2:367090/142‑1 (MQ=255) ccTCGCGGGCGCTGCGCAAAGACGGTAAC‑AAACCCTTTTTGTTAA‑CTTGAA‑CCCCG‑AAACCC‑TTCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCGGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGcc < 2:827667/151‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGaa > 1:1150115/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGaa > 1:781170/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAgg > 1:339309/1‑151 (MQ=255) tGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAgg > 2:924259/1‑151 (MQ=255) ggcgcggcgcG‑AGGCGGTTCCAAAAACCTTTAGGTTAACCTGTAC‑CCCGA‑AAC‑CC‑GTCTCCC‑CCAGTTACAACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGc < 2:882483/151‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGc > 2:492072/1‑151 (MQ=255) tGCGCAAAGACGATAACAAAACCATTATGGTTAA‑CT‑CAC‑ACCGG‑TAA‑CC‑CGCTCCACCCGACCACTCCACTGCCCTCCGCCTCTCCTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAgg < 2:8751/145‑1 (MQ=255) cgggAAGCCGTTTACAAACCCATTATGGTTAC‑CTGTAC‑CCGGG‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CGGCCTAGACCCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTAt < 2:39989/146‑1 (MQ=255) gcgAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGt > 1:948343/1‑151 (MQ=255) gcgAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGt > 1:413236/1‑151 (MQ=255) ggcggtgccGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAC‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGCCACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGt < 1:72816/143‑1 (MQ=255) cGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTAc > 2:1046512/1‑151 (MQ=255) gtttaaaaacccATTATGGTAAA‑CTGTAC‑CCCGA‑AAC‑CC‑GCCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTa < 2:101031/139‑1 (MQ=255) ttACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTAcggc > 2:1238374/1‑151 (MQ=255) tACAAAACAATTATGGTTAC‑GTG‑CA‑CCCGG‑AAACCC‑GTCCCCC‑CCGACTACGCCCCTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTAcgg < 2:436333/149‑1 (MQ=255) gAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTc > 2:1106391/1‑151 (MQ=255) aaccctttttgttaaa‑CTGAAC‑CCCGA‑AAC‑CC‑GTCTCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTAcggcg < 1:1014374/133‑1 (MQ=255) aacccATTATGGTTAA‑CTGTAC‑CCCGA‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTCCGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTc < 1:433082/147‑1 (MQ=255) aaCAATTATGG‑TAA‑CTTGTA‑CCCGG‑AAACCC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAg < 1:360121/151‑1 (MQ=255) aTGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGc > 2:1189644/1‑151 (MQ=255) gTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTg > 2:176799/1‑150 (MQ=255) ttAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGAcccc > 2:616698/1‑145 (MQ=255) gttaacctgaa‑CCCGG‑AAACCC‑GCCCCCC‑CCGCCTCCGACCTTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGAcccc < 2:975688/138‑1 (MQ=255) tAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGaa > 2:185647/1‑150 (MQ=255) aa‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGaaa > 1:81258/1‑150 (MQ=255) cTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTg > 2:1208771/1‑151 (MQ=255) atctgaaacgagaaaa‑CC‑TTTTCCC‑CAGACTACGTCACTCCGGACCGCCTCTTCTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGaa < 1:1095535/136‑1 (MQ=255) tGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTgg > 1:135392/1‑151 (MQ=255) tttacccggg‑AAC‑CC‑GCCCCCC‑CCGACTCCGACCTTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGaa < 2:92927/138‑1 (MQ=255) accccGA‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTCCGCCCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGgc < 1:1160497/147‑1 (MQ=255) accccGA‑AAC‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGgcgc < 2:1226889/149‑1 (MQ=255) a‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGgcgcg > 1:537986/1‑151 (MQ=255) ccagaaaccc‑GCCTCCC‑CCGACTACCACCTTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTg < 1:387900/137‑1 (MQ=255) g‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGgcgcgcgcg > 2:695635/1‑150 (MQ=255) aaa‑CC‑GTCCCCC‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGgcgcgcgc < 1:14219/148‑1 (MQ=255) accc‑GTCCCCC‑CCGACTCCGCCACTCCCGCCCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTg < 2:75764/149‑1 (MQ=255) tcCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAgctg > 1:800125/1‑151 (MQ=255) ccA‑CCGCCTCCGACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAg < 2:494429/147‑1 (MQ=255) ccGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCCCACCCCGCTAAAACTGGCGCGCACGCTCGAAGCCGCTgg > 1:575391/1‑151 (MQ=255) cTACAACCCTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGctgctg < 2:24738/146‑1 (MQ=255) aCGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTAcc > 2:948100/1‑151 (MQ=255) cGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCCCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTAcc > 2:138896/1‑150 (MQ=255) cacTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTACCGGtt > 2:689190/1‑151 (MQ=255) cacTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTa < 2:239168/145‑1 (MQ=255) cacTCCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTACCGGtt < 1:441347/151‑1 (MQ=255) ttCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCCGGAAGATGTGCTGGAAATCGGGCGTATCGAGAACCCGAAAGGCGTAACCGTCCGGTACGGCGGGCCGACCCCGCTGAAACGGGGCGGCGCCCGGGGAGCCGCTGGCGTACCGGt > 2:673961/1‑147 (MQ=255) | CGGCCCGAACCGTATCGGTCAGGGTATCGAATTCGACTACTGTTGCGTACACGCCTCGCTGGCGCTGCGCGAAGACGGTTACGAAACCATTATGGTTAA‑CTGTAA‑CCCGG‑AAA‑CC‑GTCTCCA‑CCGACTACGACACTTCCGACCGCCTCTACTTCGAGCCGGTAACTCTGGAAGATGTGCTGGAAATCGTGCGTATCGAGAAGCCGAAAGGCGTTATCGTCCAGTACGGCGGTCAGACCCCGCTGAAACTGGCGCGCGCGCTGGAAGCTGCTGGCGTACCGGTT > NC_000913/32517‑32799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |