Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,604,237 | 0 | C | T | 46.0% | 65.4 / 30.2 | 64 | S64L (TCG→TTG) | lsrD | autoinducer 2 import system permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/26); new base T (29/0); total (38/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.31e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAA > NC_000913/1604091‑1604387 | cGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGttt > 1:519483/1‑151 (MQ=255) gTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GGCCATATTTTGttt > 1:74981/1‑150 (MQ=255) ttATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGttt > 1:1080584/1‑149 (MQ=255) tATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTgg < 1:167872/150‑1 (MQ=255) aTTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCa < 1:797020/151‑1 (MQ=255) tGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GTCGATATTTTGTTTGGTTCGACCCTc > 1:22180/1‑151 (MQ=255) cATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTTTTTGGtttgtccctccg > 2:430987/1‑138 (MQ=255) cATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCct < 1:1229584/151‑1 (MQ=255) ggggCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGGGATTGTCAGTGGCGGGTGTGGTTATTT‑GTTTTGTTCGACCagctggcgcag > 1:765349/4‑139 (MQ=255) gTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTgcgc < 1:631026/151‑1 (MQ=255) gTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTCATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑AATGATGTTTCCTTTTGTTCGCCCATCGGCCCCTgcg > 2:659423/1‑150 (MQ=255) aaTTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGGTATTTCGTTTTGGTTGACCCTCCGCCCCTTCGCcctt > 2:250470/1‑151 (MQ=255) tAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCcattgc < 1:362056/150‑1 (MQ=255) cccGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCcattgcatt‑g < 1:891532/151‑1 (MQ=255) cgcgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGTTCGACCATCGGGCTCTGCGCCCTTGTATT‑ggg > 2:1050805/1‑151 (MQ=255) cgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGGTCGACCATCGGCCTCTGCGCCCTTGCCTT‑tgg > 2:671267/1‑149 (MQ=255) cgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCg < 1:120610/151‑1 (MQ=255) tGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTa < 1:251894/149‑1 (MQ=255) ttAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGGTTGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑tgggggaat > 2:404310/1‑143 (MQ=255) aGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGtt < 1:1182599/150‑1 (MQ=255) aTCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTCTTTTTTTTGACCCTCGGCCCCCCCGCCATTGCATT‑GGGGGGACTGttt > 1:765679/1‑149 (MQ=255) tctcAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTTGTTTGACCATCGGCCTCTTCGCCCTTGCATT‑TGGCGTACTGttt > 2:694469/1‑148 (MQ=255) cAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTc < 1:87601/146‑1 (MQ=255) tGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GTCGATATTTCGTTTTGTTCGACCCTCGGCCTCTGCGCCACTGCATT‑GGGCGTGCTGTTTTTAAgtgg > 1:1061048/1‑148 (MQ=255) ttGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGGTATTTCTTTTTTTTCCACCCACCGCCTCTGGGCCCTTGCATT‑GGGCGCACTGTTTTaaa > 1:987909/1‑142 (MQ=255) tCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTTGGCCATCCGCCTCTGCGCCCATGCATT‑GGGGGGACTGTTTTTAAGTGGtgtg > 1:1246293/1‑143 (MQ=255) cAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GTCGGTATTTTGTTTGGTTTGCACATCGGCCTCCGCGCCCTTGCATT‑GGGGGGGCTGGTTTTAAGTGGTGGGCCGAT‑Gcc > 1:1118178/1‑150 (MQ=255) aGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTCGACCACCGGCCTCCGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTTAAAGTGGGGTGCCGAT‑GCCg > 1:1119078/1‑150 (MQ=255) cacccgttgcTTTATCTGCATTGGCCTTGTCGCCCTTCCGCTAACGAAGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCg < 1:1153132/139‑1 (MQ=255) cACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCCTTGCATT‑TGGCGGACTGTTTTAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGc > 2:197644/1‑149 (MQ=255) cACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGTTCGACCATCCGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGGGTACTGTTTCAAAGGGGGGGGCCGAT‑GCCGccg > 2:908620/1‑149 (MQ=255) aGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGa < 1:272006/151‑1 (MQ=255) aGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGAAATTTTCTTTTGTTCGACCCTCGGCCTCTGCGCCACTGCATT‑GGGGGTACTGGTTTAAAGTGGTGGGGCGAA‑GCCGc > 2:1143042/1‑145 (MQ=255) gTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGGTATTTTGTTTTGTTTGACCCACCGCCCCTTCGCCATTGCATT‑GGGGGGACTTTTTCTAAAGGGTGGGCCGGT‑GCCGCTGGCggt > 1:828077/1‑149 (MQ=255) tGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATTGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCCGCCTCTGCGCCCTTGCATT‑GGGCGGGCTGTTTTAAAGTGGGGTGCCGAT‑GCCGCCGGCggt > 2:359931/1‑148 (MQ=255) tGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTTGACCATCCGCCTCTGCGCCCTTGCCTT‑TGGCGGACTGTTTTCAAGAGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCg > 2:629945/1‑148 (MQ=255) aCTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCg > 2:379624/1‑146 (MQ=255) ttATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTcc < 2:519484/150‑1 (MQ=255) ttATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTc < 2:696907/149‑1 (MQ=255) aTCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GTTGACATTTTACTTCGCTCGGGCACAGGCCTCCGCCCCGCTGCATTAGGGCGTA‑TGTTTTAAAGGGGTGTCCCGGA‑GCCGCCGGCGGTAcccc > 1:1105245/1‑148 (MQ=255) aTCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGGGGGCTGTTTTAAAGTGGGGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGGTACTcc > 1:425934/1‑148 (MQ=255) tCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCCTTGCATT‑TGGGGTACTGTTTTAAAGTGGGGTGCCGAT‑GCCGCCGGCGATACTCCTTAc > 2:1030412/1‑151 (MQ=255) gcattggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑TGGCGGACTGTTTTAAAGTGGGGTGCCGAT‑GCCCCGGGCGGTACTCCTGAcc > 2:1177076/1‑149 (MQ=255) gcattggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCtt < 2:232831/151‑1 (MQ=255) attggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTAc < 2:303308/151‑1 (MQ=255) tggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACt < 2:332606/150‑1 (MQ=255) gcattgTCGCCCTACCGCTAACGCTGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGGTCGAACAACCGCCTCCGCGCCCTTGCATT‑GGGCGGGCTGGTTCCAAGAGGGGTGCCCAT‑GCCGCCGGCGGTACTCCTGGCCTTAc > 1:1181550/1‑147 (MQ=255) gcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt < 2:286854/151‑1 (MQ=255) attgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGGTTTGTTCGACCATCGGCCCCTGCGCCCTTTCATT‑GGGGGGGCTGTTTCTAAGTGGGGTGGCGGT‑GCCGCCGGCGAGAATCCTGGCCTTACTGc > 2:1240608/1‑148 (MQ=255) tgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCgg < 1:44999/150‑1 (MQ=255) cGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGgcgc < 1:1070819/150‑1 (MQ=255) cGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCa < 1:838233/151‑1 (MQ=255) gCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑GTCGATATTTTGTTTTGTTCTACCATCCGCCCCTGCCCCCTTTCATT‑GGGGGTGCTGTTTTAAAGAGGGGTGCCGCT‑GCCCCCGGCGGTACTCCCGACCTTTCTGCTCcgcggct > 1:1228958/1‑148 (MQ=255) gCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGGTATTTTGTTTTGTTTGACCAACGGCCTCTGGGCCATTTTCAT‑GGGCGGACTGGTTTAAAATGGGGTGCCCATGGCCGC‑GGCGATTACCCTGGCCCTACTGGTCgg > 1:825797/1‑146 (MQ=255) tACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGTTCGACCAACGGGCCCCGCGCCATTGCGTT‑GGGCGTACTTTTTTTAAGAGGGGGGCCCAT‑GCCGCCGGCGGTACTCCTGCCCTTTCTGCTCGGCGCGtt > 1:367442/1‑148 (MQ=255) aCCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATtgtg < 1:853814/150‑1 (MQ=255) gCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTTGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTTCGGCCTTTCATT‑TGGCGGACTGTTTTAAAGGGGGGGGCCGGT‑GCCGCTGGCGGTACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGGCTTGTGCggg > 1:1083682/1‑151 (MQ=255) aaCGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTg < 1:213600/151‑1 (MQ=255) gTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGGTTGACCAACGGCCTCTGCGCCATTTGATT‑TGGGGTACTGTTTTAAAGTGGTGTGTCGCT‑GCCCCTGGCGGTACTCCTGACCTTACTGCGCGGCGCATTTTGgggg > 1:1010987/1‑141 (MQ=255) ttGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCg < 1:1237686/150‑1 (MQ=255) cAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGatt < 2:748068/150‑1 (MQ=255) ggg‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCt < 2:237780/151‑1 (MQ=255) gg‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCt > 2:52253/1‑150 (MQ=255) atatTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCa > 2:568221/1‑150 (MQ=255) cGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTaa < 1:525062/151‑1 (MQ=255) cGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTa > 2:380999/1‑150 (MQ=255) | CGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGG‑ATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATT‑GGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGAT‑GCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATACCAAAGTTAA > NC_000913/1604091‑1604387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |