Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,547,772 | 0 | T | G | 42.9% | 101.8 / 15.1 | 64 | V367G (GTA→GGA) | murP | N‑acetylmuramic acid permease, EIIBC component, PTS system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (11/25); new base G (27/0); total (39/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGT > NC_000913/2547624‑2547917 | ggCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTAc < 2:328133/151‑1 (MQ=255) tATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAAACGCACAGTGCGCCACG‑CAGGCAGGGACGCggg > 2:93258/1‑151 (MQ=255) ccTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCACCGAGCGCTACG‑CAGTGAGGGAACCgggg > 2:1105290/1‑148 (MQ=255) aCCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCCCACTGCGCCCCG‑CAGGCCGGGGCGCGGGGGGgttatt > 1:619769/1‑149 (MQ=255) gcgTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCCCCGGGGGCCTCGCCAGTCAGGGCACCGGGGGGATTATTcc > 1:315997/1‑147 (MQ=255) gTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCctg < 1:957902/151‑1 (MQ=255) tAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCCCAGTGCGCTACG‑CCGTCAGGGACGCGGGGGGGTTTTTTCCCGcc > 2:1237713/1‑147 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAGTGGGCCACG‑CAGTCCGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCCGCCCGCTggg > 2:337221/1‑151 (MQ=255) ggACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGTGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCGACCCCACAGTGCGCTACC‑CCGCCCGGGACCCGGGGGGGGTATTTCCCGccccccgg > 1:303596/1‑143 (MQ=255) ggACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGc < 2:712761/151‑1 (MQ=255) cAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGtt < 1:1197227/151‑1 (MQ=255) cAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAACCGCACAGAGCGCCACG‑CAGTCCGGGACGCGGGGCGGTTATTTCCCGCCCGCTGGGGGTTgggg > 1:556728/1‑149 (MQ=255) gATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAAcc < 2:971793/151‑1 (MQ=255) aTTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCACAGTGGGCTCAG‑CAGTCAGGAAACCGGGGGGGTTATTCCCGGGCTGCTGGGCggttggggacc > 2:909413/1‑140 (MQ=255) tCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGGGCCACG‑CAGGCCGGGACGCGGGGGGGGTTTTTCCCGCCCGCCGGGCGGTGGGGGAcc > 1:810436/1‑148 (MQ=255) cAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTg < 1:639898/151‑1 (MQ=255) aaCAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGGCACCGCACAGTGCGCCACG‑CCGGCAGGGACGCGGGGGGGGTATTTCCGGCCTGCTGGGCGGTGGGGTAcc > 1:181759/1‑146 (MQ=255) aaCAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAATGCGCTACG‑CAGGCAGGGACGCGGGGGGGTTTTTTCCGGGCTGCTGGGGGGTGGTGGACCGccg > 1:1126996/1‑148 (MQ=255) aGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCCACCGCACAGTGCGCTACC‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCCGCCCGCTGGGCGGTGGGGGACCGCTGGttt > 1:1080776/1‑151 (MQ=255) gCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTa < 1:697177/151‑1 (MQ=255) gCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTa < 1:527884/151‑1 (MQ=255) aTTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGgt < 2:1238818/151‑1 (MQ=255) cccATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCCCAGGGGGCCACG‑CCGGCCGGGACGCGGGGCGGTTATTTCCCGCCCGCTGGGCGTTGGTGGACCGCCGATTTTCgg > 1:800914/1‑146 (MQ=255) tCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAATGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGGTTATTCCCCGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGGGTCAccc > 2:955290/1‑150 (MQ=255) ccTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCAACGCACAGTGCGCCACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGATTATTCCCCGCCTGCTTGGCGTTGGTGTACCCCTGTTTTTCGGGGTTAccc > 2:419442/1‑149 (MQ=255) ccTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCt < 1:1202068/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTg < 2:963429/151‑1 (MQ=255) tCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGccc < 2:810438/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGc < 2:152092/151‑1 (MQ=255) aTGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCACAAGGCGCCACC‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGGTTTTTTCCCGCCCGCCCGGGGGTGGGGGACCGCCGGTTTTCGGTGGCACCCCGccccccc > 1:648575/1‑148 (MQ=255) tGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCCCAGGGCGCCACC‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGGGTATTTCCGGCCCGCTGGGCGTTGGTGAAACGCCGATTTACGGGGTTACCCTGcccccc > 1:997692/1‑147 (MQ=255) ggCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCAt < 2:218987/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGGTTATTTCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTTCGGTGTCACCCCGCCCCGCATg > 2:336126/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCCCAGGGCGCGACC‑CCGGCAGGGACGCGGGGCGGTTTTTTCCGGCCCTCTGGGGGGTGGGGAACCCCTGATTTACGGGGTCACCCTGcccc > 1:660278/1‑143 (MQ=255) cgcgGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAATGCCCTACG‑CCGTCAAGTACGCGGGGCGGTTTTTTCCCGCCCTCTGGGCGTTGGGGGAGCGCTGATTTTCGGGGTGACCCTGCCCCGCATGAAgg > 2:236928/1‑148 (MQ=255) gggCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCCCAGTGCGCTACG‑CAGGCCGGGACGCGGGGGGGTTATTCCCGGCCTGCCGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTTCGGTGTCACCCTGCCCCGCCTGAAGCCGgtt > 2:474688/1‑151 (MQ=255) ggCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGGTTATTTCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGGGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGttt > 2:934679/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGGGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCCGCCCGCTGGGCGTTGGGGGACCGCTGGTTTACGGGGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGttt > 2:973006/1‑150 (MQ=255) cAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CCGTCAGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCGGCCCGCTGGGGGTTGGGGAACCGCTGATTTACGGGGTTACCCCGCCCCGCCTGAAGCCGgttgtt > 2:129820/1‑150 (MQ=255) cAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGGGGGCTACG‑CAGGCAGGTACGCGGGGCGATTATTTCCGGCCCGCTGGGGGTTGGGGGACCGCTGATTTTCGGGGTCAACCCGCCCCCCCTGAAGCCGTTTGtt > 1:564780/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAGGGCGCCACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGGGGTTTTTTCCCGCCTGCTGGGGGGTGGTGGACCGCTGGTTTACGGGGTCACCCCGCCCCGCCCGAAGCCGgttgtt > 1:770394/1‑149 (MQ=255) gcggcgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGtt < 1:298918/151‑1 (MQ=255) gcgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAg < 2:865063/151‑1 (MQ=255) gcgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGCGGTTATTCCCGGCCTGCTGGGGGTTGGGGAACCGCTGATTTACGGGGTCACCCCGCCCCGCATGAAGCCCTTTGTTACCGCCTGttttg > 2:992645/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACACTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGATTATTTCCCGCCCGCTGGGCGTTGGGGAACCGCCGATTTTCGGGGTCACCCTGCCCCGCCTGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGttt > 1:685559/1‑148 (MQ=255) gcTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCGGCCTGCCGGGCGTTGGGGGAACGCCGATTTTAGGGGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGGTTGTTACCGCCCGttt > 2:28180/1‑147 (MQ=255) gcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGGACGCGGGGGGGTTATTTCCCGCCTGCCGGGGGTTGGTGAACCGCTGGTTTACGGGGTCACCCTGCCCCGCCTGAAGCCGGTTGTTACCGCCTGTTTAgg > 2:89042/1‑150 (MQ=255) tGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGGGGTTATTTCCCGCCCGCTTGGCGGTGGTGAACCGCCGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCCCATGAAGCCGGTTGTTACCGCCTGTTTTggcgg > 2:1036531/1‑151 (MQ=255) ggCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAggcggc < 1:987663/151‑1 (MQ=255) ggCACTCTACGGGGGGGGTCAGCCGAACATGGCGCTACG‑CAGTCAGGTGCGCGGAGCGAATATTCCCGGCCTGTTGGGCGTTGGTGACCCGGTAATTTACGGTGTCGCCCTGCCCAGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTGggcggc < 1:343227/151‑1 (MQ=255) gCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGgcggcg < 2:562170/151‑1 (MQ=255) tGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCggcgggcg > 2:1188687/1‑151 (MQ=255) tGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCggcgggcg > 1:574653/1‑151 (MQ=255) cgggcgCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtt < 2:1249207/151‑1 (MQ=255) gggcgCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgttt < 2:683967/151‑1 (MQ=255) gggcgCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgttt < 2:1011484/151‑1 (MQ=255) gcAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtttgttt > 1:730720/1‑151 (MQ=255) cAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtttgttt > 1:760520/1‑150 (MQ=255) caGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTg > 2:1260001/1‑151 (MQ=255) aGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGa < 2:1045911/151‑1 (MQ=255) gcgcTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATa < 2:880721/150‑1 (MQ=255) cG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCtggt < 2:638004/151‑1 (MQ=255) aGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTggg > 2:965205/1‑151 (MQ=255) cAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGt > 1:775107/1‑150 (MQ=255) | GGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACG‑CAGTCAGGTACGCGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGT > NC_000913/2547624‑2547917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |