Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 1,915,293 | Δ5 bp | coding (238‑242/699 nt) | proQ ← | RNA chaperone, putative ProP translation regulator |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1915292 | 3 (0.040) | 60 (0.760) | 57/294 | 0.5 | 95.3% | coding (243/699 nt) | proQ | RNA chaperone, putative ProP translation regulator |
? | NC_000913 | 1915298 = | 3 (0.040) | coding (237/699 nt) | proQ | RNA chaperone, putative ProP translation regulator |
GCAGTTGCGGCAGCTTCGCGTTTTTTCGCTTGCTGTTCAGCACGCTGTGCCTGAACACGCGCTTTCGCTTCTTCAAGCTGCTTGCGAGCATGCTCTACATGTTGCTCGTCCAGCTCACCGCATGGGTTGCCGTCAAGATCGACACGCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGATTTTCAGCGGACGCGCT > NC_000913/1915152‑1915445 | caccagcagttgcggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTg < 2:549148‑M2/5‑1 (MQ=255) cagttgcggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCgg > 1:312572‑M2/141‑151 (MQ=255) agttgcggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCggg > 1:56206‑M2/140‑151 (MQ=255) gttgcggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGt < 1:1252968‑M2/13‑1 (MQ=255) tgcggcagcttcgcgttttttggctttctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaacctgcttgcgagcatgctctacatgttgccagtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGGCGGGtt > 2:951620‑M2/137‑150 (MQ=255) tgcggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcgtgcgagcatgctctacatggtgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGttt > 2:1206372‑M2/137‑151 (MQ=255) tgcagcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGtt < 1:829714‑M2/14‑1 (MQ=255) cggccgcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGctt > 2:240095‑M2/135‑149 (MQ=255) cggcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTaa < 1:921975‑M2/17‑1 (MQ=255) gcagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAaca < 2:1164794‑M2/19‑1 (MQ=255) cagcttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacacgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaacgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAaca > 2:486652‑M2/132‑150 (MQ=255) ttcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGt > 2:118241‑M2/128‑150 (MQ=255) tcgcgttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTa > 2:825068‑M2/127‑150 (MQ=255) gttttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTaa > 2:1224032‑M2/123‑147 (MQ=255) gttttttcccttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctcttcatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccttctagatcgCTTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGa < 1:1088109‑M2/28‑1 (MQ=255) ttttcgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAAc > 1:484572‑M2/120‑151 (MQ=255) cgcttgctgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGcc < 2:646987‑M2/35‑1 (MQ=255) tgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGa > 1:885421‑M2/109‑150 (MQ=255) tgttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGa > 2:370914‑M2/109‑150 (MQ=255) gttcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGa < 1:933176‑M2/42‑1 (MQ=255) tcagcacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAgtg > 1:792552‑M2/106‑151 (MQ=255) cTGTGCCGGAACACGCGCTTTCGCTTCTTCAAGCTGCTTGCGAGCATGCTCTACATGTTGCTCGTCCAGCTCACCGCATGGGTTGCCGTCAAGATCGACACGCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAgtgt > 2:1086547/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCTGAACACGCGCTTTCGCTTCTTCACGCTGCTTGCGAGCATGCTCTTCATGTTGCTCGTCCAGCTCGCCGCATGGGTTGCCGTCAAGAT‑‑‑‑‑CGCGTTGCGACGGGTTTAACCCCGTAAAGATAACGCCATTGCGAAGTGTAgaga < 2:1246700/149‑1 (MQ=255) cacgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAgtgt > 1:40393‑M2/102‑148 (MQ=255) cgctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTagag < 1:624648‑M2/51‑1 (MQ=255) ctgtgcctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGCAGAGACg > 2:259957‑M2/98‑151 (MQ=255) ctgaacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGc > 2:549038‑M2/92‑151 (MQ=255) aacacgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGa < 1:599247‑M2/63‑1 (MQ=255) acgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCg > 2:1109543‑M2/86‑151 (MQ=255) cgcgctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGc > 1:686310‑M2/85‑151 (MQ=255) gctttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAAt > 1:1084720‑M2/82‑151 (MQ=255) ttcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTg < 2:615650‑M2/72‑1 (MQ=255) tcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAGGCGGATCGCAATTGc < 1:107226‑M2/73‑1 (MQ=255) tcgcttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCg > 1:214977‑M2/78‑151 (MQ=255) ttcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGtttt > 1:142217‑M2/74‑151 (MQ=255) tcttcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGtttt < 2:645582‑M2/78‑1 (MQ=255) tcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTg < 2:172721‑M2/79‑1 (MQ=255) tcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTg < 2:366157‑M2/79‑1 (MQ=255) tcaagctgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCt < 1:999928‑M2/81‑1 (MQ=255) tgcttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGtt > 1:258631‑M2/64‑150 (MQ=255) cttgcgagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCAt > 1:117517‑M2/62‑151 (MQ=255) gagcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTccc > 2:895701‑M2/57‑151 (MQ=255) agcatgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTcccc < 1:922542‑M2/96‑1 (MQ=255) catgctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTcccc > 1:561149‑M2/54‑149 (MQ=255) ctctacatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAac > 2:1126590‑M2/50‑151 (MQ=255) acatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAaca < 2:367404‑M2/103‑1 (MQ=255) acatgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACg < 2:966316‑M2/105‑1 (MQ=255) catgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGAt > 1:537304‑M2/45‑151 (MQ=255) catgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGAt < 1:1201914‑M2/107‑1 (MQ=255) atgttgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATc < 2:787072‑M2/108‑1 (MQ=255) tgctcgtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGAc < 1:776705‑M2/111‑1 (MQ=255) gtccagctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATc < 1:649549‑M2/117‑1 (MQ=255) cACCGCATGGGTTGCCGTCAAGATCGACACGCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCt < 1:445750/150‑1 (MQ=255) agctcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTg > 1:93198‑M2/31‑150 (MQ=255) tcaccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGaaa > 2:66046‑M2/28‑150 (MQ=255) ccgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATa < 2:320568‑M2/127‑1 (MQ=255) cgcatgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATAc > 2:1088047‑M2/24‑151 (MQ=255) atgggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCg > 1:1126308‑M2/21‑150 (MQ=255) tgggctgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAAAGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGAAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGa > 2:558573‑M2/20‑150 (MQ=255) gggttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGAt < 1:624434‑M2/132‑1 (MQ=255) gttgccgtcaagatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGAtttt < 1:567590‑M2/135‑1 (MQ=255) agatcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGATTTTCAGCGGAcgc < 1:118243‑M2/145‑1 (MQ=255) tcgCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGATTTTCAGCGGACGCGCt > 2:738209‑M2/4‑151 (MQ=255) | GCAGTTGCGGCAGCTTCGCGTTTTTTCGCTTGCTGTTCAGCACGCTGTGCCTGAACACGCGCTTTCGCTTCTTCAAGCTGCTTGCGAGCATGCTCTACATGTTGCTCGTCCAGCTCACCGCATGGGTTGCCGTCAAGATCGACACGCGTTGCGCCGGGTTTAACACCGTAAAGATAACGCCAGCTCGAAGTGTAGAGACGTAAAGCGGATCGCAATTGCGTTTTGCTCAGGTTCATTTCCCCAGCAACACGATCGACCAAATCCTGAAAAATACCGATTTTCAGCGGACGCGCT > NC_000913/1915152‑1915445 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |