| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,764,785 | 0 | T | A | 41.5% | 89.8 / 34.2 | 65 | intergenic (‑399/+149) | sufA/ydiH | Fe‑S cluster assembly protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/10); new base A (0/27); total (28/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.52e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTAAGTCAGGATC > NC_000913/1764636‑1764935 | ttAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCAt > 1:1152402/1‑150 (MQ=255) tAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATa < 1:1216800/150‑1 (MQ=255) agaTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCt < 2:1146330/151‑1 (MQ=255) gaTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTa < 1:824591/151‑1 (MQ=255) tAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTaa < 1:859780/150‑1 (MQ=255) tAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAAc > 1:1162501/1‑151 (MQ=255) aGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAAcc < 2:245799/151‑1 (MQ=255) aaaaaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACccgcc > 2:794029/1‑151 (MQ=255) aaaaaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTAACCCATCA‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACccgcc > 2:535680/1‑151 (MQ=255) aaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGtt > 1:1082923/1‑151 (MQ=255) gTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGtttt > 1:950460/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTa > 1:918883/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTa > 1:325702/1‑150 (MQ=255) cGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAAcaca > 1:1157858/1‑150 (MQ=255) cAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTg > 1:122461/1‑151 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaCCCCTAAAGTCTGTGCGACACAGGTTAAAGGT‑TTTCTCCCCCACCC‑GGCTTTTATCCCCGCCCCTCTCGGGGGCTTAGCTTTTGAA‑GGGGC‑AATAAGAAAAATCTCAAAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGc < 2:625683/149‑1 (MQ=255) aGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGc > 2:358055/1‑151 (MQ=255) aaaaaaaacCCCTTAAGTCTGTCCGACGGGGGGTAAGGGC‑TTTCTCCCCAACCG‑GGACCTAACCTCCGCGTCCCTCGGTGTCTACGCTATTGAG‑GGGGA‑AATAAAAATAAACTAAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGAtt < 1:864232/146‑1 (MQ=255) aTAAAAAACCCCTAAAGTCTGTGCGACACGGGCTAAGGGT‑TTTCTCCCCCACCC‑GGCGCTTATCTCCGGCCCTCGCAGTGGCTTAGCTTTTGAA‑GGGGC‑GAAAAAAATAATCTCAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGAtt < 1:58537/151‑1 (MQ=255) tAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGAtt > 1:1123841/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTAATTTTGGGCCACCCAGGCTTAAGGG‑TTTCTCCCCCACCC‑GGCCTTTATCCCCGGCCCTCCCAGTGTCTTTCCTCTTAGA‑GGGGC‑AATAAGAATAACCTCAAAAAACTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGAtt < 2:909651/146‑1 (MQ=255) aaGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGGGAt > 2:352924/1‑148 (MQ=255) aaaaCCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtat > 1:80615/1‑151 (MQ=255) aaaCCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtatt > 1:1212372/1‑151 (MQ=255) aaaCCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑CTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtatt > 2:349225/1‑151 (MQ=255) accctttAAGTCTGTGCCACACAGGTTTTAGGG‑TTTCTCCCCCACCC‑GGCGTTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAG‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTAATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtatta < 1:856143/146‑1 (MQ=255) ccTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttt > 1:1239146/1‑151 (MQ=255) tAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg > 1:430544/1‑151 (MQ=255) aggTCTGTGCGAAACAGG‑TTAAGGGTTTTCTACCCCACCC‑GGCGCTTATCCCCGCCACTCTCAGTGGCTTACCTTTGGAG‑GGGGC‑AATAAAAATAATTTAAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttttt < 2:1143832/147‑1 (MQ=255) aGTCTGTGCGACACAGGCTAAAGGG‑TTTCCCCCCCACCC‑GGCTCTTATCCCCGGCACTCTCAGGGGTTTAGCTTTTGAG‑GGGGA‑GATAAAAATAATCTCAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGaa < 1:920709/151‑1 (MQ=255) tCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCACTCGCA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAATCTGCGCTTAGTATTATTTTTGAAc > 2:4112/1‑150 (MQ=255) cTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACa > 1:97251/1‑150 (MQ=255) gtgCGACACGGGCTTAGGGG‑TTTCTCCCCCACCC‑GGCTTTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGTTTAGCTTTTGAA‑GGGGA‑AAAAAAAATAATCTAAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttttt < 1:874658/143‑1 (MQ=255) acacAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAgg > 2:201705/1‑151 (MQ=255) caGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCgg > 1:187683/1‑151 (MQ=255) ttAAGGG‑TTTCCCCCCCATCC‑GGCGTTTATCCCCGCCACCCTCAGTGGCTTAGCTTTTGAG‑GGGGC‑AATAAGAATAATCTAAAAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGt < 1:406324/147‑1 (MQ=255) aagcttttcacccccAGCC‑GCCGCTTATCCCCGCCCCCCTCTGTGGTTTACTTTTGGAA‑GGGGC‑AAAAAAAATAATTTTAAAATTCCCCCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGa < 2:1027169/137‑1 (MQ=255) gg‑TTTCCTCCCCCTCCGGGCGCTTATCCCCGGCACTCTAAGTGTTTTAGCTTTTGAA‑GGGGC‑AATAAAAATAATCTCAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGc < 2:549562/151‑1 (MQ=255) ccccACCC‑GGCGTTTATCTCCGGCCCTCGCAGTGGTTTAGCTCTTGAG‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCAAAAAACTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTAtt < 2:933945/148‑1 (MQ=255) cccACCC‑GGCTCTTATCCCCGGCACTCTCAGTGGTTTAGCTC‑TGAA‑GGGGCGGATAAAAATACTCTAAAAAAGTTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTa < 1:677839/145‑1 (MQ=255) cccACCC‑GGCGCTCATCCCCGGCCCTCCCGGTGGCTTTGCTCTGGAA‑GGGGC‑AAAAAGAATAATCTCATAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTaaga < 2:288525/151‑1 (MQ=255) aTCC‑GCCGCTTATCCCCGCCACTCTCAGTGGTTTGGCTTTTGAA‑GGGGC‑AAAAAAAAAAATCTAAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTaagaag < 2:1221472/150‑1 (MQ=255) cc‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTc > 2:266104/1‑151 (MQ=255) cc‑GGCGCTTATCCCCGGCCCTCTCGGTGGTTTAGCTTTTGAA‑GGGGC‑AAAAAAAAAAACCAAAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAgg < 1:299628/149‑1 (MQ=255) gcgcTTATCCCCGCCACCCTCGGTGGTTTACCTCTGGAA‑GGGGC‑AATAAAAATAATCCAATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTc < 1:866686/148‑1 (MQ=255) ttATCTCCGGCCCTCTAAGTGGTTTACTTCTTAAA‑GGGGC‑GAAAAGAAAAATCAAAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGaa < 2:830652/150‑1 (MQ=255) tATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAAcc > 1:200536/1‑151 (MQ=255) ccGCCACTCTCAGTGTTTTAGCT‑TTGAAGGGGGA‑AATAAAAATAATCTAAAAAAGCAACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCt < 2:459800/147‑1 (MQ=255) ccGACACTCTGAGTGGTTTAGCTCTTGAG‑GGGGC‑AATAAGAATAATCAAAAAAATTAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCt < 1:238292/147‑1 (MQ=255) cAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAAt > 2:56081/1‑151 (MQ=255) tGGTTTAGCTTTTGAG‑GGGGC‑TATAAGAATAATCTAAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATcc < 1:658807/150‑1 (MQ=255) gttttATCTCTTGAA‑GGGGA‑GAAAAAAATAATCTAAAAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCa < 1:1027628/147‑1 (MQ=255) ggCTTAGCTCTTGAG‑GGGGC‑GAAAAGAATAATCTAAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATcc < 1:602857/149‑1 (MQ=255) ggCTTAGATCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATcc > 2:141157/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGAt > 2:280251/1‑151 (MQ=255) ttGAA‑GGGGC‑GATAAAAAAAATCTAATAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGAttt < 1:401812/149‑1 (MQ=255) tGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGc > 2:468625/1‑151 (MQ=255) agggggC‑AATAAAAATAATCTCAAAAAGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCg < 1:702773/140‑1 (MQ=255) gggC‑GATAAGAATAATCTAAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACt < 1:500215/151‑1 (MQ=255) aaaaaaataatCTCAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGc < 1:963513/144‑1 (MQ=255) aaaaataatCTCAAAAAGCAAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTg < 2:1008736/143‑1 (MQ=255) aaaaataatCTAAAAACGCTACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGc < 2:1117894/144‑1 (MQ=255) aaaaataacCTAAAAAATCTAGCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTg < 2:557001/143‑1 (MQ=255) aGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCAt > 1:823455/1‑151 (MQ=255) aatattCACATAAAGTTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCAtt < 1:1103043/150‑1 (MQ=255) aataatCTCAAAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTa < 2:1152381/151‑1 (MQ=255) tAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTAAGTCAGGATc > 2:1149004/1‑151 (MQ=255) | TTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCC‑GGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAA‑GGGGC‑GATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTAAGTCAGGATC > NC_000913/1764636‑1764935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |