| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,781,645 | 0 | A | C | 42.1% | 127.7 / 18.5 | 76 | V361G (GTT→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/9); new base C (0/32); total (35/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCA > NC_000913/2781517‑2781792 | tttccccGCCTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCCGTTTTTATTTTTGGTGCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTTTGTGTGCCCCAATTATTTTTGTTTTTTGGC‑GCTTTTCCTAAACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCggg < 2:598256/146‑1 (MQ=255) tttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCg < 1:503717/147‑1 (MQ=255) ttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg > 1:1161103/1‑151 (MQ=255) gccgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATc > 2:239801/1‑150 (MQ=255) cgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc > 2:1080958/1‑151 (MQ=255) gcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCt > 1:478340/1‑151 (MQ=255) cTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCtt > 2:257015/1‑151 (MQ=255) ttttGATTTTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCtt < 1:45032/150‑1 (MQ=255) ttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 1:84977/1‑149 (MQ=255) gATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGc > 1:904466/1‑150 (MQ=255) ttttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGTTATCCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCCCCATTATTTATGGTTTTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCAtt < 2:760801/149‑1 (MQ=255) ttttGCGTCCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTg < 1:288698/150‑1 (MQ=255) ttggctttCCGCTTTTGATATTGGGCCCTGTGCCTATCCCATATTTATAAATTTCCTGGTTGCCCCCATTATTTATGTTATTTGCC‑GCGTTTCCTGCACCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg < 1:577336/144‑1 (MQ=255) ttgttttCCGTTTTTGATTTTGGTCCTTTTGGTTATGCAATATTTATTAATATTTTGTGTGCCACAATTAATTATGGTTTTTGTC‑GTTTTTCCGGCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGt < 2:46878/145‑1 (MQ=255) tGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt > 2:354047/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt > 1:740157/1‑151 (MQ=255) ccGTTGTTAATATTGGTGCTTGGGGTTATCCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCATTATTTATGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACACCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg < 1:825710/151‑1 (MQ=255) cGCTGTTGATGTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGCC‑GCGTTTGCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg > 2:755729/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGAc > 1:873238/1‑151 (MQ=255) tGTTGATATTGGTGCTTGTGGTTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCTTTAATTATGGTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGAc < 1:360355/149‑1 (MQ=255) tGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt > 1:106843/1‑151 (MQ=255) ttGATTTTGGTCCTTGTGGCTATGCAATATTTATTAATATTTTGTGTGCCCCCATTATTTATGGTTTTTGTC‑GTTTTCCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt < 2:420171/149‑1 (MQ=255) ttGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTCCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt < 1:769788/149‑1 (MQ=255) gATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGtt > 2:687022/1‑151 (MQ=255) tatGGGTCCCTGTGCCTGTGCCATATTTTTTAATTTTTTGTGTCCCCCCTTTATTTATGTTGTTTGTC‑GTGTTTCTGTCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAtt < 2:638026/146‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTGGCTTTGCCATAATTATTATTATTCTGTGTGCCCCAATAATTTATGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTa < 1:1185852/151‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGGCTATGCCTTAATTATAAATTTCCTGTGGGCCACATTTATTTATGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTAt < 2:937927/151‑1 (MQ=255) tGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTAt > 2:649898/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCttt > 2:182933/1‑150 (MQ=255) gtgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCttt > 2:189047/1‑149 (MQ=255) gtgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACAATTAATTATGGTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCttt < 1:791453/149‑1 (MQ=255) gtttATGCCATAATTATTAATATTCTGTGGGCCGCTATTAATTATGGTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc < 2:957653/141‑1 (MQ=255) ggttATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTta < 1:273871/145‑1 (MQ=255) ggCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATTTTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaata < 1:1123794/151‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATATTCTGTGAGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATc > 2:942169/1‑149 (MQ=255) caaTAATTTTTAATATTCTGTGTCCCCCATTTATTTATGTTTTTTGTC‑GGTTTTCCTGAACCATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt < 2:229830/147‑1 (MQ=255) aTAATTATTATTTTTTTGTGTCCCACCATTAATTATGTTTTTTGTC‑GGTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCg < 2:1083069/146‑1 (MQ=255) aaTTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGtt > 2:994438/1‑151 (MQ=255) ttattaATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 1:819954/150‑1 (MQ=255) ttattaATATTCTGTGTCCCACAATAAATTATGGTTTTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 2:5585/150‑1 (MQ=255) tattaATATTGTTTGTGCCCCCATTAATT‑TGGTTTTTTTCGGTGTTTCCTGCAACACCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 1:1052949/149‑1 (MQ=255) aaTATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGa > 1:801003/1‑150 (MQ=255) aaTATTCTGGGTGCCACTATTAATTAGGGTTTTTGCC‑GCGTTTCCTGCAACATCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGcc < 1:947892/148‑1 (MQ=255) atatTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAc < 1:731651/151‑1 (MQ=255) atTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAcc > 2:1029041/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGTGCCACCTTTATTTATGGTTTTTGTC‑GCGTTTCCTCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAc < 1:1663/148‑1 (MQ=255) ttCTGTGTGCCACCATTATTTATGTTTTTTGGC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAcc < 2:996474/149‑1 (MQ=255) ttCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat > 2:519112/1‑151 (MQ=255) tCTGTGCCCCCCCATTAATTGTGTTTTTTGGC‑CCTTTTCCTGAATCTCCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGa < 2:52570/145‑1 (MQ=255) gtgtgCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat < 1:1139145/147‑1 (MQ=255) tgcgCCACCATAAATTATGTTTTTTGTC‑GCTTTCCCGGAAACATCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATg < 1:723381/146‑1 (MQ=255) gccccaccaTTAATTTTGTTTTTTGTC‑GCTTTCCCTCAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCata < 2:220493/143‑1 (MQ=255) tgCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGtt > 1:381425/1‑151 (MQ=255) ccaccaTTAATTATGGTATTTGCC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTa < 1:682443/151‑1 (MQ=255) ccaTTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt > 1:491944/1‑151 (MQ=255) caTTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTc > 1:1090451/1‑151 (MQ=255) caTTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTc > 1:294/1‑151 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 1:89611/1‑151 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 1:191326/1‑151 (MQ=255) ttatttttgttttttGTC‑GCGTTTCCTCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt < 2:469193/136‑1 (MQ=255) ttaTGTTATTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTa < 1:116064/147‑1 (MQ=255) ttaTGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATg > 1:998410/1‑151 (MQ=255) ttaGGGTTTTTGTC‑GCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAAt < 1:742826/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTTGGTC‑GTTTTTCCTACAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGa < 1:103149/150‑1 (MQ=255) tGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGacc > 2:179593/1‑151 (MQ=255) gTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGaccac > 1:536629/1‑151 (MQ=255) tttC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt > 1:1069007/3‑151 (MQ=255) tGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt > 1:725643/1‑151 (MQ=255) tGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt > 2:544522/1‑151 (MQ=255) gTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGc > 2:443035/1‑151 (MQ=255) tttCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCa < 1:747621/148‑1 (MQ=255) tttCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt < 1:879103/144‑1 (MQ=255) aaCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACAtt < 1:869191/150‑1 (MQ=255) aCATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGt > 2:350600/1‑151 (MQ=255) cATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTg < 2:414630/145‑1 (MQ=255) aTACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCa < 1:880909/151‑1 (MQ=255) | CTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTC‑GCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCA > NC_000913/2781517‑2781792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |