| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,080,856 | 0 | T | G | 40.3% | 125.6 / 10.0 | 73 | intergenic (+43/‑500) | putP/efeU | proline:sodium symporter/ferrous iron permease (pseudogene) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/34); new base G (29/0); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGTTATTATGT > NC_000913/1080710‑1081004 | ttAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTgc < 2:569898/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGCTTTGTTTTGGTTTCG‑CAGCGGGTTgcgc > 2:9051/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTTGCTTTAA‑CAGCGGGGTGCGCTccc > 1:891273/1‑151 (MQ=255) cTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGGTTCAG‑CCGCGGGGTGCGCccccct > 2:415948/1‑148 (MQ=255) gggTAAGGCGCCGTCAGCGGTGATGCAAAAACTCTTTGCCGAGGCCGATGCTCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTaa < 2:28828/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCt < 1:2616/151‑1 (MQ=255) gcgcCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTTCCTc < 2:997384/151‑1 (MQ=255) cGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCa < 1:1301695/151‑1 (MQ=255) gTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGcc > 1:709996/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGGTTCAG‑CCGCGGGGTGCGCTCCCTTTATGTGCCTCGcc > 1:853667/1‑148 (MQ=255) cAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCata < 1:308366/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCTTCAG‑CCGCGGGGTGCGCCCCCTTAATGTGCCTCCCCatat > 2:808537/1‑150 (MQ=255) gcggcgATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATaa < 1:515602/151‑1 (MQ=255) cggcgATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTCTTCGCTTTAGTCAGCGGG‑CGCGCCCCCTTTAttcgccccccc > 2:1008424/1‑134 (MQ=255) cgATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGCTTTTTTTTGGTTTAG‑CAGCGGGTTGGGCTCCCCTTATGTGGCCTGGCATATaaaat > 2:515876/1‑148 (MQ=255) gATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGa < 2:160865/151‑1 (MQ=255) gATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGa < 1:847808/151‑1 (MQ=255) cAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTTGCCTCAG‑CAGCGGGGTTCGCTCCCCTAATGTGTCTCGCCCTATAAATTGAAttg > 1:430989/1‑149 (MQ=255) aaaaCGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTg < 2:660122/151‑1 (MQ=255) aaaCGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGc < 1:1211633/151‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCa < 2:550084/151‑1 (MQ=255) aCGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCCTCAG‑CAGCGGGGTTCGCTCCCCTTATGTGCCTCGCCATATAAAATGAATAGTg > 1:61227/1‑148 (MQ=255) cTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTTAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCCTTATTTGCCCCCCCCTATAAAATTAATGGGGCAggg > 1:406248/1‑150 (MQ=255) ttGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAg < 1:232642/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAgcgc < 2:1303280/151‑1 (MQ=255) gCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAgcgc < 2:253093/151‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCCTTATTTGCCTCCCCCTATAAATTGAATGGTGCAGGGAggg > 2:81862/1‑147 (MQ=255) gAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCCCCCTTAATGTGCCTCTCCATATAAATTTAATGGGGGAGGGGgcgc > 2:513798/1‑148 (MQ=255) gAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCCCCCTATAAATTGAATGGTGCAGGGAgcgc > 1:704369/1‑148 (MQ=255) gAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCa < 2:938219/151‑1 (MQ=255) ggCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAgg < 2:1180757/151‑1 (MQ=255) cGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGGTTCAG‑CCACGGGGTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAAAGGGGCAGGGAGCGCGCAggggg > 1:1196555/1‑151 (MQ=255) cGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAggggg < 2:741987/151‑1 (MQ=255) cGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAggggg < 1:702721/151‑1 (MQ=255) gATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGggc < 2:5355/151‑1 (MQ=255) gcgcACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCCTATAAAATGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGggcgg > 1:616504/1‑150 (MQ=255) tCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTCAG‑CAACGGGGTGCGCTCCCTTAATGTGGCTCGCCCTATAAATTGAATGGGGCAGGGGGGGCGCAGGGGGCGGCCCATcgcc > 1:698354/1‑151 (MQ=255) cATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTTCG‑CAGCCGGGTGCGCTCCCTTAATGTGCCCCGCCATATAAATTGGATGGTGCAGGGGGCGCGCCGGGGGCGGCCAATcgcc > 2:310146/1‑150 (MQ=255) aTTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCCTAATGTGCCTCGCCATATAAATTTAAAGGGGGAGGGAGCGCGCAGGGGGGGGCCAATcgccgc > 2:25864/1‑151 (MQ=255) ttCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTTGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCCTTATTTGCCCCGCCCTATAAATTGAATGGGGCAGGGGGCGGGCAGGGGGGGGGCAAAcggcccc > 2:1225294/1‑146 (MQ=255) tCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCTCCCTTAATTTGCCTCGCCCTATAAATTGGATGGGGCCGGGGGCGCGCAGGGGGGGGGCCAAccccgcc > 2:88005/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTTGCTTCCG‑CAACGGGGTGCGCCCCCTTAATGTGGCTCCCCCTATAAAATTAATTGGGCAGGGAGCGCGCAGGGGGGGGCCAAAcgccgcccc > 2:419537/1‑149 (MQ=255) cTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCCTCCG‑CCGCGGGGTGCGCCCCCTTTAAGTGCCTCGCCCTATAAAATGAAAGGGGGAGGGGGCGGGCAGGGGGCGGCCCATTCCCGCCGcccc > 2:494104/1‑151 (MQ=255) tCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGCTTCTG‑CCGCGGGTTTCGCTCCCCTAAATTGGCTCGCCCTATTAAATGTATGGGGGAGGGGGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCcccccccccc > 2:1282345/1‑151 (MQ=255) tCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCCCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGGGCGCAGGGGGCGGCCAATCgcccccgccccc > 2:606867/1‑151 (MQ=255) tCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCCCCCCTAATGTGGCTCGCCATATAAATTTAATGGGGCAGGGAGCGCGCCGGGGGCGGCCCATCGCcccccccccc > 2:1024281/1‑151 (MQ=255) cgccgTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCctg < 2:683460/151‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGCTTCCG‑CAGCGGGTTGGGGTCCCCTAATGTGCCTCCGCATATAAATTGAATGGGGCAGGGAGCCCGCAGGGGGCGGCCCATCGCCGCCCCCCCccgcgtttccgg > 2:731630/1‑143 (MQ=255) tGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTTAG‑CAGCGGGGTGGGCTCCCTTAATGTGCCCCGCCCTATAAATTGAATGGGGGAGGGGGGGCGCCGGGGGGGGCCAATCCCCCCCGCCCCCCGCTGTCCCgggc > 2:652094/1‑148 (MQ=255) cAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTc < 1:198230/151‑1 (MQ=255) aGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGCGCCCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGGGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAAACGCCGCCCCCCCCCGCTGTCCCGGCC‑TTCgggg > 1:1167634/1‑149 (MQ=255) cTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGGTTTTTTTTGCTTCAC‑CAGCGGGGTGCCCGCCCTTAATGTGCCTCGCCCTATAAATTTTATGGTGCAGGGGGGCCGCAGGGGGCGGGCCAACGCCGCCGCCCCCCGCTGTCCCGGCC‑CTCgggg > 1:8971/1‑147 (MQ=255) tAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAAc < 2:1160164/149‑1 (MQ=255) aaGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGc < 1:636249/150‑1 (MQ=255) aGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTGGGTTCAA‑CAACGGGGTGCGCTCCCCTAATGTGCCTCCCCCTATAAATTTGATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGGCAAACGCCGCCCCCCCCCGCTGTCCCCGCC‑TTCgggggaagcct > 2:388442/1‑144 (MQ=255) gACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGGTGGGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGGGGAGGGAGCGCGCCGGGGGGGGGCCAACGCCCCCGCCCCCTCCTGTCCCCGCC‑CTCGGGGGACGc > 2:1056775/1‑146 (MQ=255) ttAGCCTGCGGCGGTTTTTTTTTGGTTCAA‑CAACGGGGTGCGGTCCCTTTAAATGGCTCGCCCTTTTAATTTAATGGTGCATGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAAACGCCCCCCCCCCCCGCTGTCCCCGCCTTTCGGGGAACCCtacggg > 2:900083/1‑145 (MQ=255) gcggcgGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGGC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGAc < 1:1267461/151‑1 (MQ=255) gcggcgGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGAc < 1:824499/151‑1 (MQ=255) cggcggTTTTTTTTGGGTTCAG‑CAACGGGTTGCGCCCCCCTAATGTGCCTCGCCCTATAAATTGAATGGTGCAGGGGGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCCGCTGTCCCGGCC‑CTCGGGGGACGCTTCAGCGGTTTTGAc > 2:1524/1‑150 (MQ=255) cggcggTTTTGTTTTGCTTTAG‑CAGCGGGGTGCCCCCCCTTAATGGGCCTCGCCCTATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAAACGCCGCCGCCCCCCGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGGACGCCTCAGCGAattt > 2:1290320/1‑147 (MQ=37) ggcggTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGc < 1:1302970/151‑1 (MQ=255) ggTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGccac > 2:1147289/1‑151 (MQ=255) gTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGccacc > 2:159101/1‑151 (MQ=255) tgtttgGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAac > 2:335402/1‑150 (MQ=255) tgGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACAccc < 2:1035490/150‑1 (MQ=255) ggCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCg < 2:810174/150‑1 (MQ=255) tCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGc < 2:662100/149‑1 (MQ=255) tCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGc < 2:215496/149‑1 (MQ=255) ag‑cagcGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGACCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGtt < 2:215268/151‑1 (MQ=255) g‑cagcGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGtta < 2:913408/151‑1 (MQ=255) cagcGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGttat > 2:73351/1‑151 (MQ=255) ggTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGTTATTATGt < 2:881811/151‑1 (MQ=255) | TTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGTTTTGTTTGGCTTCAG‑CAGCGGGTTGCGCTCCCTTAATGTGCCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACACCCGAGCTGTTATTATGT > NC_000913/1080710‑1081004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |