Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 39.7% | 106.4 / 20.8 | 63 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/10); new base C (0/25); total (28/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.93e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCAT > NC_000913/1376356‑1376648 | gCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAacac > 2:910968/1‑151 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAacac < 1:87592/149‑1 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAacac < 1:128012/149‑1 (MQ=255) tACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACAccc < 1:923374/150‑1 (MQ=255) tACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCt > 1:288700/1‑151 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCt < 2:1083996/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCt < 1:334151/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTc < 1:543419/151‑1 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGcc < 1:1032132/151‑1 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGcc < 2:23799/151‑1 (MQ=255) ccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCg > 2:1353211/1‑151 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGAt > 1:697569/1‑151 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATg > 1:383655/1‑151 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATg < 1:443296/151‑1 (MQ=255) cTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccgc > 2:380148/1‑151 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 1:1030824/1‑150 (MQ=255) cgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTAc > 1:872548/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc > 2:1133869/1‑151 (MQ=255) gggacccGAAAAAGGGGGGGTGTTCCCCGG‑CCCGTACGGAAACAGGTCGCCGCGCTTCCGGGAACCGTGTTTTTTCTCG‑ACCTTTAAACCCGTTATAAGGATAAAATGATCACCCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 2:707963/145‑1 (MQ=255) gcgcCCGAAAAATGGTGAGTCTTCCCCTG‑CGCGTCCGGGAAAAGGCCGCCGCGCCTGCGGGACCCGGGGTGTGTCCGGAACGTTTAAA‑CCGCTATCGGGATAATATGATCACCCCCCTCGCTAATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 1:1340320/149‑1 (MQ=255) ccGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt > 1:27360/1‑151 (MQ=255) ccGAAAAATGGTGAGTGTTCCCCTG‑CGCGTACTGAAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTGTATCTCGACCTTTTAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGAt < 1:949803/148‑1 (MQ=255) cAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaa > 2:198148/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGTGGGTG‑TTCCCGGTCGCGTGGTGAACCAGGCCGCGGCGGGTCCGAGAACCGGGTTGTATCTCAAACAGTAAAA‑CCCCTATCAGGAAATTATGAACAACCCCCGGGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaaa < 2:609163/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGTGAGTATTCCCCTG‑CGCGTACGGGAACAGGTCGCCGCGCTTCCGGGACCCGTGGTGTATCTCAACCCTTTAAC‑CCTCTATCAGAACCATATATTAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt < 1:865660/147‑1 (MQ=255) aaaTGGGGAGTGTCCCCCTG‑CGCTTCCTGGAAAGGGCCGCCGCGCGTCCCGGAACGGTGGTTTATCTCAAACATTAAAC‑CCCCTACCAGGATCATATGACCACCCCCCTCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACa < 2:909089/151‑1 (MQ=255) gggTGAGTGGTTCAGGG‑CGTGTAGGGGAACAGGTCGCGGCGGTAACAGGACCGGGGGTGTCCCTGGAGCCATAACC‑CCGTTATCAGTAACATATCATCACCCCCCGCGCCATAGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGa < 2:352325/138‑1 (MQ=255) ggTGAGTGTTTCCCTG‑CGGCTGTTGGAAGAGGCCGCCGCGGGTCCCGGACCCGGGGTTTTTCTAGAGCGGATAAC‑CCGCAAACGGAATCATATGAACACCCCCCTCGCAGGTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATg < 2:1301355/149‑1 (MQ=255) ggTGAGTGATCCCCGG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGt < 1:1330229/150‑1 (MQ=255) gagtgtTTCCTGG‑CGCGTACGGGAACAGGCCCCCGCGCGTCCCGGAACCGGGGTGTATCTGGATCCTTTAAA‑CCGCTATCAGGATAAAATGATCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACa < 2:915300/150‑1 (MQ=255) gttccccGG‑CGCGTGCTGGAAGGGGTCGCCGCGCGCACGGGACCCGTGGTTTATCTCGACCTGTTAAC‑CCGATATCGGTATAATATGATAAACACCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt < 2:787583/145‑1 (MQ=255) aTTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTAt > 1:280516/1‑151 (MQ=255) cccTG‑CGCGTCCGGGAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGAACGGTGGTGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTa < 1:313931/147‑1 (MQ=255) cccTG‑CGCGTACTGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCCGGGGTGTATCTCGACCCGTTAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc < 1:310453/149‑1 (MQ=255) cccGG‑CGCGTTCTGGAAGGGGTCGCCGCGCTTCCGGGACCCGTGGTGTATCTAGAACCGTTAAC‑CCTCTATAGGGTACAAATAACAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc < 2:780383/149‑1 (MQ=255) ccTG‑GGCGTACTGGACCAGTCCGCCGCGCTTACCGGACCCGGGGTTTATCACAACCCTTAAAA‑CCGCTATAAGGAACAAATGATCACCCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCgg < 2:629856/150‑1 (MQ=255) tG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCg > 2:1189996/1‑150 (MQ=255) gcgTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAttt > 2:273991/1‑151 (MQ=255) cgggacagggTCGCCGCGCGTACCGGACCGGTGGTGTATCCCGACCCTTTAAC‑CCGTTTTCAGGATCATATGAACAACCCCCCCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc < 1:64154/143‑1 (MQ=255) cTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc > 1:1233515/1‑151 (MQ=255) ggaaggggTCCCCGCGCGTACCGGACCGGTGGTTTATCGCGACCCTTTAAC‑CCGCTATCAGAATAATATAACCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTa < 2:747174/141‑1 (MQ=255) gAACGGGCCCCCGGGGGTACGGAACCCGTGGTGTCTCGCGACCCTTAAAC‑CCCCTATCAGCATAATATAAACAACCCCCTCCCAGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAttt < 2:668115/143‑1 (MQ=255) aCAGGTCCCCGCGCGACCCGGACCCGTGGTTTATCTCGAACCGTTAAC‑CCGCTATCAGGATCAAATGACCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACAt < 2:280243/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGa > 1:437641/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCTCTTACCGCACCTGGGGTGTATCTCGAACCTTTAAC‑CCGCTATGTGGTTATTAGCATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAata < 2:288994/150‑1 (MQ=255) gccgcGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg > 2:1052033/1‑151 (MQ=255) gccgcGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg > 2:279008/1‑151 (MQ=255) gccgcGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg > 2:674820/1‑151 (MQ=255) gcgcgTCCCGGACCCGTGGTTTATCTCGACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATAATATAATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaa < 1:577135/150‑1 (MQ=255) gTACCGGACCCGTGTTTTTTCTCGACCCGTTAAC‑CCGCTTTCAGGATCAAATGAACACCCCCCTCGCCAATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga < 1:293792/148‑1 (MQ=255) ccGGAACGGTGGTTTTTCTCGACCCGTTAAC‑CCGCTATCAGAATAATATGACCAACCCCCCCGCCGGTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAagaaga < 2:1240818/148‑1 (MQ=255) ccGGAACCGTGGTGTATCTCGACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGAt < 1:486259/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTATCCCGACCCTTTAAC‑CCGCTATCAGAATCATATGATCACCCCCCGCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt < 2:1239315/148‑1 (MQ=255) tggtgTATAGCGACCCGTTAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGACCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgc < 1:677931/148‑1 (MQ=255) tctcAAACCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATAATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcg < 2:527316/148‑1 (MQ=255) ctcGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt > 2:352129/1‑149 (MQ=255) aaCCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg > 1:988475/1‑150 (MQ=255) gTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAc > 1:1198640/1‑151 (MQ=255) a‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgcg > 2:309576/1‑150 (MQ=255) aTCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt > 2:943905/1‑149 (MQ=255) aTCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc > 2:1104592/1‑150 (MQ=255) atatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 2:522284/1‑151 (MQ=255) atatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 1:424486/1‑151 (MQ=255) tGATCAACACACTCGCCGATGCGCGCCTTCACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATCTACAGATTATAGGCGATTTCTATCACATCAATATCTACGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAGCGCGACCTGCTCGGCCAt > 2:817476/1‑146 (MQ=255) gATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCat > 1:1268026/1‑151 (MQ=255) aaCACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGc < 1:1106494/145‑1 (MQ=255) | GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCAT > NC_000913/1376356‑1376648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |