| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,423,290 | 0 | A | C | 43.1% | 88.0 / 27.9 | 72 | intergenic (+96/+133) | yhdZ/rrfF | putative amino acid ABC transporter ATPase/5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/27); new base C (30/1); total (44/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423141‑3423438 | gcgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTCCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCAc < 1:126391/151‑1 (MQ=255) cgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCAcc < 2:579461/151‑1 (MQ=255) tCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑cccccccccccc > 1:598577/1‑151 (MQ=255) aaTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGcc < 2:919091/151‑1 (MQ=255) cAGAGCGTACGAAGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGC‑CCGCCCCCCTccccggcgtt > 1:676504/1‑143 (MQ=37) cGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCCCCCCCCCGGCCGGTGcct > 1:127019/1‑148 (MQ=255) tACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCCGTGCt > 1:708037/1‑147 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGC‑CCGCCCCCCCCCCGGGCGGGTCTTCG‑Caa > 1:825052/1‑150 (MQ=255) gggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGTGGTCCGC‑TCCCCCCCCCCCCGGCCGTttcttccaaaa > 2:724666/1‑144 (MQ=255) ggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTTG‑CAACGtt > 1:1258079/1‑151 (MQ=25) aTTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCaa < 2:1031868/151‑1 (MQ=255) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAAt < 2:155518/150‑1 (MQ=255) ttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGAGCCCCGC‑CCGCCACCCCCCCCGCCGCTGGTTCG‑CCAAGTTTAAAAcc > 1:464675/1‑151 (MQ=255) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTCC‑CCCCCCCCCTCCGGGCCGTTTCTTCG‑CAACCTTCAAATCCGCTc > 1:1101847/1‑151 (MQ=255) gCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGCCCTGCGCCCCCCCCCCCCGGGCC‑TTGCCTCC‑CGACGGTCTAATCCg > 1:429112/1‑147 (MQ=21) ggTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCCCCACCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAAACCCCTccc > 1:52863/1‑149 (MQ=255) aaTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCcggcg < 1:861168/150‑1 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCCGCCCGC‑CCCCCCCCCACCACGCCGCTGCTTTGCCAACGttgtaacagcctgc > 2:1136292/1‑133 (MQ=255) ccATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAt < 1:1189541/150‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGACCCTC‑CCCCCACCCTCCTGGCCGTTGCTTTC‑GAGCGTTCCAATCCGCAccccgggggctt > 1:1023578/1‑142 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAttt < 2:927341/151‑1 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTg < 1:305953/151‑1 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGC‑CCCCCCCCCTCCCGGCCGGTGGTTCT‑CAACCTTCAAAACCCCTCCccgcgggatt > 2:222027/1‑146 (MQ=255) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCCCCACCCCCCCCGCCCTTTCTTTC‑CAACCTTTAAAACCCCCCCccgcggggttttcc > 2:995900/1‑140 (MQ=18) ttAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTTC‑CCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCCCCCCGCGGGTTTGTCCTACTCggg > 1:629520/1‑150 (MQ=17) gTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCCCCACCCCCCCGGGCCTTTCTTCT‑AAACGATCTAATACGCCCCCCGCGGGGTTTTCCTACTCCGgag > 2:828424/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCTC‑CCCCCCCCCTCCCGGCCGTTGCTTTG‑CAACCGTCAAAACCCCCCCCCGCGGGGTTGTCCCCCTCCCGCGAgtgt > 2:991013/1‑150 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTc < 2:814917/151‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCGCCACCCCCCGGGCCGGTGCTTCG‑CAAAGTTTAAATCCCCTCCCCGCGGGGTTGTTCTACTCCGGGGAgtggt > 1:576794/1‑148 (MQ=255) aaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTCC‑CCGCCCCCCCCCCGGGCGTTGCTTTC‑CCACGTTCAAATACGCCCCCCGCCGGGTTTTCCTTCTCCGGGGAGGGtt > 2:1182472/1‑149 (MQ=255) aGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTC‑CCCCCACCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑CAACGGTCAAATACGCTCCCCGCGGGTTTGTTCTACTCCGGGGAGGGTTCAcc > 1:688516/1‑151 (MQ=14) gCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTCT‑CAACCTTCAAATCCGCCCCCGGCGGGTTTGTCCTACTCCGGAGGGGGTTTAcc > 2:357732/1‑150 (MQ=14) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTTCTCC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTCT‑CAACCTTCAAATCCGCCCCCCGCGGGTTTTTTCTACTCCGGggaggggttaccc > 2:241174/1‑140 (MQ=14) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCCCCCCCCCCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATACGCCCCCCGCGGATTTTTTCTTCTCCGGGGAAGGTTTAcc > 1:193796/1‑148 (MQ=14) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGGTTCG‑CCACCTTCAAATCCGCTCCCCGCGGGGTTTTCCTCCTCCGGGGAGGGTTTAcc > 2:779026/1‑148 (MQ=255) aaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTGCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCCGTGCTTCT‑CAACCTTCAAATCCCCCCCCCCCGGGTTTTTCCTACTCCGGAGGGGGTTTAcccccca > 2:773482/1‑145 (MQ=9) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTCG‑CAAAGTTTAAAACCCCTCCCCGCGGGTTTGTCCTACTCGGGAGAGGGTTTACCGACAAacaac‑a > 1:944370/1‑150 (MQ=17) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCTC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTTAAATCCGCTCCCGCCGGATTTTTTCTACTCCGGGGAGGGGTCCCCGACAAaaaac‑aa > 1:1159606/1‑149 (MQ=14) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCAGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATa < 1:713793/149‑1 (MQ=255) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACaa < 1:543351/151‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACaaa < 2:121895/151‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCGCCACCCCCCCGGCCGGTGCTTCG‑CAACCTTCAAATACCCCCCCGGCGGGTTTGTCCTTCTCCGGAGAGGGTTCTCCGCCAAACAAC‑AGAAAAAACaa > 2:541625/1‑150 (MQ=14) gCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGC‑CCGCCCCCCTCCCGGCCGGTGCTTCG‑CCACCTTCAAATCCGCTCCCCGCGGGTTTTTCCTACTCGGGGGAGTGTTCACCCACAAACAAC‑AGAaaaaaaaaaa > 2:297594/1‑149 (MQ=14) ccTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCTC‑CCGCCACCCCCCCGGCCCTTGCTTCC‑CCACGTTCAAATCCGCTCCCCGCGGCTTTTTCCCACTCGGGAGAGTGGTTACCGCCAAACAAC‑AGATAAAAAAAAAgg > 1:501667/1‑150 (MQ=14) cttctgCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGC‑CCGCCCCCCTCCCGGCCCTTGCTTCG‑CAACCTTCAAAACCCCCCCCCGCGGGTTTGTCCTTCTCCCGAGAGCGGTTCCCCCCAAACaaa‑aaaaaaaaaaaaa > 2:817271/6‑147 (MQ=0) cTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTTC‑CCGCCCCCCTCCCGGCCGCTCGTTCG‑CAACGTTCAAAAACGCCCCCGGCGGGGTTTTTCTTCTCGGGAGAGTGGTTTCCCCCAAAAAAC‑AGATAaaaaaaaa > 1:576546/1‑147 (MQ=255) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGCCCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCCGTGGTTTT‑CAACACTTAAATTCCCCCCCCGCGGGGTTGTTCCACTCCGGAGGGGGGTCACCGACAAACAAC‑AGACAaaaaaaaaaaccc > 2:609247/1‑144 (MQ=2) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCCGCCTGC‑CCCCCCCCCTCCGGGCCGTTTCTTTT‑GAACGTTTAAATACGCTCCCGGCGGGTTTTTCCCTCTCCGGGGAGAGGTTCCCGCAAAAAAAC‑Aaaaaaaaaaaaa > 2:725652/1‑144 (MQ=255) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCAGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCa < 2:315798/150‑1 (MQ=255) cGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGt < 1:140706/151‑1 (MQ=40) aatttgatGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCCTTGGTTTT‑CAACCTTCAAATCCGCCCCCCGCGGGCTTTTTCTTCTCCCGAGAGCGGTTCCCGACAAAAAAC‑AGAAAAAAAACAAAGGCCAGTcct > 2:427202/2‑147 (MQ=0) atttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCg < 1:17958/151‑1 (MQ=38) gatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTg < 2:1158122/151‑1 (MQ=38) atGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGCGACTGC‑CCGCCCCCCTCCGGGGCGGTTCTTCG‑CAACGGTCAAATCCGCCCCCCCGGGGGTTTTCCTACTCGGGAGAGCGTGCCCCCCCAAACAAC‑AGATAAAAAAAAAAGCCCAGTccttccaca > 2:677679/1‑141 (MQ=255) tgccTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCCCCCCCCCGGCCCTTTCCTCGCCAACCTT‑AAAACCCCCCCCCGCGGGGTTTTCCTACCCCGGAGAGGGGTCACCCACAAAAAAC‑AAATAAAAAAAAAAGGCCaagcttttcgct > 2:783342/4‑137 (MQ=0) tGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCG‑CCACATTCTCAATCGCCCCCCCCGGGGTTTTTCTACTCCGGGGGGGGTTTACCCACAAACAACAAAAAAAAAAAAAAGGccccgcttcccac > 2:256549/1‑137 (MQ=255) tCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTTG‑CAACGTTCAAAACCGCTCCCCGCGGGGTTTTCCCACTCGGGGGAGGGTTTTCCGACAAACAAA‑AGATAAAACAAAAAGCCCAGTCTTCCCACTGAGcc > 2:1227895/1‑151 (MQ=11) ggCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCttt < 1:1096160/151‑1 (MQ=35) ggCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCtt < 2:617588/150‑1 (MQ=35) aTGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTAt < 1:624071/151‑1 (MQ=38) ggcgggcgTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTAttt < 2:1088626/151‑1 (MQ=38) ggcgggcgTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTAttt < 2:1213073/151‑1 (MQ=38) ggcgggcgTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTAtt < 1:471438/150‑1 (MQ=38) gcgggcgTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTg < 1:303824/151‑1 (MQ=38) ggcgTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATg > 1:1172210/1‑151 (MQ=38) ccTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTgg > 1:468015/1‑151 (MQ=40) gC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGc < 2:127017/149‑1 (MQ=40) gC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGc < 2:944359/149‑1 (MQ=40) gC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCa < 1:1005704/150‑1 (MQ=40) c‑ccGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGt > 1:1095365/1‑151 (MQ=40) c‑ccGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGt < 2:1153707/151‑1 (MQ=40) ccGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGtt > 2:854147/1‑151 (MQ=40) ccACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTccc > 1:800198/1‑151 (MQ=40) | GCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGC‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCG‑CAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAAC‑AGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423141‑3423438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |