Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,547,772 | 0 | T | G | 40.6% | 105.9 / 19.9 | 65 | V367G (GTA→GGA) | murP | N‑acetylmuramic acid permease, EIIBC component, PTS system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (11/27); new base G (26/0); total (38/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.65e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGTCTGCC > NC_000913/2547623‑2547922 | gggCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTa < 1:715898/151‑1 (MQ=255) ttATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTAcg‑c < 2:900205/149‑1 (MQ=255) aTTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑Cgggg < 2:876995/151‑1 (MQ=255) cTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCAACGCACAGTGGGCCCCCCCGTCCGGGACG‑CGGGGCg > 1:425885/1‑149 (MQ=255) gTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGatta < 2:286221/151‑1 (MQ=255) ttACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCACAGGGCGCTACCCAGGCAGGGACG‑Cggggggggtatt > 1:867171/1‑143 (MQ=255) cTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCCACGCAGGCCGGGACG‑CGGGGGGGTTATTtcc > 1:555593/1‑150 (MQ=255) gcgTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGGCACCCCACCATGCGCCACGCAGGCACGGACG‑CGGGGGGGTTTTTTCCCGcc > 1:467977/1‑151 (MQ=255) gTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCctg < 1:872910/151‑1 (MQ=255) ttAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCAACCCCCAATGCGCCACGCCGGCAGGGAAG‑CGGGGGGGTTATTTCCCGcccg > 1:484971/1‑148 (MQ=255) aaTGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCctgctg < 2:328210/151‑1 (MQ=255) aaTGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCctgctg < 1:342531/151‑1 (MQ=255) aGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCCACCGCCCCGCGCGCCACGCCGGCCGGGACG‑CCGGGCGGTTATTTCCCGCCTGCTGGGGGTTg > 1:918590/1‑151 (MQ=255) cAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTg < 1:934110/151‑1 (MQ=255) cAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTg < 2:470555/151‑1 (MQ=255) cAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGGGGGCTCCCCAGTCAGGGAAG‑GGGGGGGGTTTTTTCCCGCCCGCTgg > 1:530012/1‑142 (MQ=255) aGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCACAGGGCGCCAAGCCGGCAGGGACG‑CGGGGGGGGTTTTTCCCGCCCGCCGGGCGTTgg > 1:97640/1‑148 (MQ=255) cAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAATGCGCTACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGCGATTTTTTCCGGCCCGCTGGGCGTTGGTGAAcc > 2:807871/1‑147 (MQ=255) gCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAACCGCACAGGGCGCTACGCCGTCCGGGACG‑CGGGGGGGTTATTTCCGGCCTGCTGGGGGGTGGTGAAACGCCGAttt > 1:837296/1‑150 (MQ=255) cTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAAACGCACAGTGCGCTACGCAGGCAGGTACG‑CGGGGCGGGTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGAttt > 2:593397/1‑149 (MQ=255) ttATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCTCCCAGAGCGCTACGCCGTCAGGGGCGCCGGGGGGATATTTCCCGGCC‑GCCGGGCGGTGGGGGACCGCTGGttt > 2:656545/1‑148 (MQ=255) ttATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAGGGCGCTACGCCGGCAGGGACG‑CGGGGGGGTTATTTCCGGCCTGCTGGGCGGTGGTGAACCGCTGATTTACg > 2:485546/1‑151 (MQ=255) cccATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAAACGCAACGTGCGCGACGCAGGCCGGCGCG‑ACGGGGGATTATTTCCCGCCTGGTCGGCGGTgggggaaccctggatt > 1:474174/1‑128 (MQ=255) ccTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCCCCGCACAGTGCGCCACGCCGGCCGGGACG‑GCGGGCGGTTTTTTCCGGCCCGCTGGGGGTTGGGGGACCGCCGAATTTTGGTGTGAccc > 1:446876/1‑149 (MQ=255) ccTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCt < 2:536289/150‑1 (MQ=255) cTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAACCGCCCAGTGCGCCACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGCGGTTTTTTCCCGCCTGCTGGGCGGTGGGGGACCGCCGGTTTTCGGTGTCAcccc > 1:838672/1‑148 (MQ=255) tCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGCGGTTTTTTCCGGCCTGCTGGGCGGTGGTGGACCGCTGGTTTTCGGGGTCACCCCGcccc > 2:953678/1‑151 (MQ=255) cAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCg < 1:775113/151‑1 (MQ=255) aTGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGGGCAACCCCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGGGGTTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGGACCCCCGATTTACGGGGTCACCCTGcccc > 2:553531/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCTGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAg < 2:552138/151‑1 (MQ=255) aGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAATGCGCCACCCAGTCAGGGACG‑CGGGGCGGTTATTTCCGGCCTGCTGGGGGGTGGTGGAACGCTGGTTTAAGGGGGCACCCCGCCCCCCCTGaa > 2:494711/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCCCAGAGCGCTACGCAGTCAGGGGCG‑CGGGGGGGTTTTTTCCGGCCCGCTGGGCGTTGGGGGACCGCCGGTTTTCGGGGTCACCCTGCCCCCCCTGAAg > 2:338517/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCCGTCAGGGACG‑CGGGGCGGTTATTTCCCGCCTGCTGGGCGGTGGTGGAACGCTGATTTTCGGTGTCACCCTGCCCCGCCTGAAGcc > 2:228980/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGGGATTATTCCCCGCCTGCTGGGCGGTGGTGAAACGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGgtt > 2:499956/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGGACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCCGCTGGGCGGTGGTGAACCGCTGATTTTCGGGGTCACCCTGCCCCCCATGAAACCGttt > 2:941519/1‑150 (MQ=255) cAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCGCACAGGGCGCTACGCCGTCAGGGAAG‑CGGGGCGGTTATTTCCCGCCCGCTGGGGGTTGGGGGAACGCTGATTTACGGTGTCCCCCCGCCCCGCCACAAGCCGGTtttt > 1:733018/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCCCACAGTGCGCTACGCGGTCCGGGAAG‑CGGGGCGGTTATTCCCCGCCTGCTTGGAGGTGGTGGACCGCTGATTTAACGTGTCACCCTGCCCCGCCTAAAGCCGgttgtt > 1:234526/1‑149 (MQ=255) cgcggcgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCCACCCCACACCCCACTACGCAGGCAGGGAAG‑CGGGGGGATTATTCCCCGGCTGCTGGGCGGTGGGGAACCGCTGGGTTACGGTCTGCCCCTGCCCCCCATGAAAGCGTTTGtt > 1:142477/1‑142 (MQ=255) ggcgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCCGTCAGGGACG‑CGGGGCGATTATTTCCCGCCTGCCGGGCGTTGGGGAACCGCTGATTTTCGGTGTCACCCTGCCCCGCCTGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGttt > 1:671472/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGGCAGGGACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGGAACGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATTAAGCCGTTTTTTAACGCCTGTTTTgg > 2:562409/1‑151 (MQ=255) ggCCCTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAggcgg < 2:704635/150‑1 (MQ=255) ggCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGCTTAggcg < 2:724117/149‑1 (MQ=255) ctctACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGgcggcgcg < 2:241102/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCggcgggcg < 2:867181/150‑1 (MQ=255) cgggcgCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGCTTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGgcgggcgg > 1:364088/1‑149 (MQ=255) gggcgCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgttt < 2:162141/151‑1 (MQ=255) gcgcAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtttgt < 2:749093/151‑1 (MQ=255) cgcAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTGCG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGGGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCATGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtttgtt < 2:901257/151‑1 (MQ=255) cgcAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGgtttgtt < 2:908030/151‑1 (MQ=255) cAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTa < 1:97318/151‑1 (MQ=255) aaCCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTAt > 2:587589/1‑151 (MQ=255) aCCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATc < 2:708674/151‑1 (MQ=255) cacaGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGcc > 1:91923/1‑151 (MQ=255) caGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTg < 2:50622/151‑1 (MQ=255) aGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGa < 2:1437/151‑1 (MQ=255) tGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGAt > 2:945319/1‑150 (MQ=255) gcTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATa < 2:61244/148‑1 (MQ=255) gcTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGcc < 1:606440/151‑1 (MQ=255) cTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCt > 2:472390/1‑151 (MQ=255) tACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCtg > 2:808033/1‑151 (MQ=255) tCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTgggg > 1:479434/1‑150 (MQ=255) cAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTgggg > 1:91941/1‑149 (MQ=255) cAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGt > 2:494188/1‑150 (MQ=255) cAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGTc < 1:257582/151‑1 (MQ=255) gTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGTCTGc > 2:669747/1‑151 (MQ=255) tACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGTCTGcc > 2:872056/1‑151 (MQ=255) | GGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGCTGGCACTCTACTGGCGGGCGCAACCGCACAGTGCGCTACGCAGTCAGGTACG‑CGGGGCGATTATTCCCGGCCTGCTGGGCGTTGGTGAACCGCTGATTTACGGTGTCACCCTGCCCCGCATGAAGCCGTTTGTTACCGCCTGTTTAGGCGGCGCGGCGGGCGGTTTGTTTATCGGCCTGATAGCCTGGTGGGGTCTGCC > NC_000913/2547623‑2547922 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |