Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,258,974 | 0 | T | G | 42.5% | 125.4 / 10.6 | 73 | G411G (GGT→GGG) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/32); new base G (31/0); total (41/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.90e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTG > NC_000913/4258827‑4259120 | ccAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGgttt > 2:287225/1‑151 (MQ=255) aTTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTgc > 1:286991/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCt < 2:842552/150‑1 (MQ=255) cagcagCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTtcgc > 2:422022/1‑148 (MQ=255) agcagcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGgttt > 1:263374/1‑143 (MQ=255) gcagcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACg > 1:946338/1‑151 (MQ=255) agcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGGCGCCGCCCCAGGTTTTGCGATg > 1:453021/1‑146 (MQ=255) gctggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTc < 2:252728/151‑1 (MQ=255) gctggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTc < 2:623349/151‑1 (MQ=255) ggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTGGGCCGACGCTccct > 1:867622/1‑149 (MQ=255) ggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCtt < 2:847657/151‑1 (MQ=255) ggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCt < 1:443194/150‑1 (MQ=255) ccGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTACGc > 2:679560/1‑149 (MQ=255) ccGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCCCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCCTACGc > 2:913195/1‑149 (MQ=255) cGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTg > 2:333405/1‑150 (MQ=255) gCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGCCGCTCCTTACGCTGcc < 1:804403/151‑1 (MQ=255) cTATCTTATCTGGCGGGTGATTGTGCCGGTGGTTGGGGTCTGCTGTTATCTGCGGGGCGGCGTGTTTATGGGCGCGACGCGTGCCGCGGAAATGCTTAACAGGATGGCGGTGGCAGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGc < 1:936648/149‑1 (MQ=255) atcttatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGt < 1:618972/150‑1 (MQ=255) atcttatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGt < 1:778092/150‑1 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCCTACGCCGCCGGGGCt > 2:440246/1‑150 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTgg < 2:892353/148‑1 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCt < 1:1003120/150‑1 (MQ=255) atctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTTCGCCGCCgtgggtgg > 1:504460/1‑151 (MQ=255) atctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCCCCCCAGGGTTTGCGCGGGCGCTCCCTTTGCTGcccggggtgg > 1:870687/1‑143 (MQ=255) aGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGCGGCTGGGGAAt > 2:902061/1‑149 (MQ=255) gATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGc < 2:218482/150‑1 (MQ=255) gATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGc > 2:299920/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTtg < 1:299270/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGGTTTGCGCTGGCGCCCCTTTCGCTGCCGGGGCTGGGGAATCATGGttt > 2:666484/1‑148 (MQ=255) tGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTtg < 1:83194/149‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCCCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCCGCCGCGGCTGGGGAATCATGCTTtgt > 2:837221/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtgg < 2:576878/151‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggct < 1:59712/151‑1 (MQ=255) ggtggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggctg < 2:825142/151‑1 (MQ=255) gtggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGGTGGGGAATCATGCTTTGtggctgg > 2:175119/1‑151 (MQ=255) tGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGATTTGTGGCTGGCAtt > 1:560061/1‑150 (MQ=255) ggCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTaa < 2:843914/151‑1 (MQ=255) tCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGGGGCCGCCGCCGGGTTTGCGCTGACGCCCCCTTCGCTGCCGCGGCTGGGGAATCATGCTTTTtggctgggaattaac > 2:840663/1‑141 (MQ=255) cTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGAGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGTTTTTTGGCCGGGAtttaac > 1:210045/1‑144 (MQ=255) tgtTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGTTTTTCGCTGAAGCTCCTTAAGCTGCCGGGGCGGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTTAACCTCttt > 1:196776/1‑150 (MQ=255) ttATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCt < 1:320938/150‑1 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCg < 2:324311/148‑1 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGtt < 2:380006/150‑1 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCCCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCCTCTTTCTGGCggt > 1:625847/1‑148 (MQ=255) ggACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTgcgc < 1:469377/151‑1 (MQ=255) ggCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAAACGTCTTTTTGGCGTTGCGCggg > 2:884648/1‑150 (MQ=255) gCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCt < 2:325439/151‑1 (MQ=255) aTGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCCTTTACCCTCTTTTTGGCGTTGCGCGGGCttt > 2:809741/1‑151 (MQ=255) tttATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCCCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATAATGCTTTTTGGGTGGCATTAACCCTCTTTCTTGCGTTTCGCGGGCttt > 1:1015039/1‑148 (MQ=255) ataGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTTAGCTGCCGTGGGTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGGATTAAACGTCTTTTTGGCGGTGCGCGGGGTTTCTCTgg > 2:811259/1‑151 (MQ=255) gcgcAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCCGGGCTGGGGAAACATGCTTTTTGGCTGGCCTTTACCCTCTTTTTTGGGTTGCGCGGGCTTTTTCTggcgg > 2:506616/1‑150 (MQ=255) gcgcAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTggcggc < 2:946511/151‑1 (MQ=255) aaCGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGCTGGCATTAAACGTCTTTCTGGCGGTTCGCGGGGTTTCTCTTGCGGCTATc > 1:298990/1‑151 (MQ=255) aCGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCt < 2:691171/151‑1 (MQ=255) cgcgTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTTCGCTGCCGTGGGTGGGTAAACATTCTTTGTGGCTGGGATTTAACGTCTTTTTTGCGTTTCGCGGGGTTTTTTTGGGGGCTATCt > 2:718782/1‑150 (MQ=255) cgTGCCACCGAAATGCGTAACTGTATGGCGGGGGCCGCTGCAGGGTTTGGGCTTGAGCTCCCTAAGCCGCCGTGGCTTGGGAATCATGTTTTGTGGGTGGTAGTTAACGGCTTTCTTGCGTAGGCGGGGGTTTTTCTAGCGGGTTTCtttg > 1:207696/1‑148 (MQ=255) gTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggcg < 2:286995/151‑1 (MQ=255) gTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggc < 1:566902/150‑1 (MQ=255) tGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGCTGGCATTAAACGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGGTTTCTCTGGCGGCTATCttg > 2:468583/1‑146 (MQ=255) ccACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGCGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCCGACGGACCCTACGCTGGCGGGGGTGGGGAAAACTGCTTTTTGGCTGGCCCTTACAGGCTTTCTGGCGTTTGGCGGGGCTTTTCTGGGGGGTATCTtgcgg > 1:224292/1‑149 (MQ=255) aCCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTc < 1:472288/151‑1 (MQ=255) ccGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTAAGCTGGCCGGGCTGGGGGATAATGCCTTGTGGGTGGGCTTTACCCTCTTTTTTGCGGTGCGCGGGGCTTTTCTGGCGGGTGTCttg > 1:715164/1‑141 (MQ=255) aaTGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTTCGCCGACGCCCCTTACGCTGCCGGGGCTGGGGAAAAATGCTTTGTGGGTGGCATTTACCGGCTTTTTGGGGTTTCGCGGGGCTTTTCTGGGGGGTATCTTGGGGGGTCCCTg > 1:908371/1‑150 (MQ=255) aTGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGgc < 2:335391/151‑1 (MQ=255) gTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGGCCCTGgcg > 2:642126/1‑148 (MQ=255) aaCAGTATGGCGGTGGCCGCCCCCGGGTTTGCGCCGACGCTCCTTACGCTTCCGGGGGGGGGGAATCCTGCTTTGTGGCTGGGCTTAAACGTCTTTCTGGGGTTGCGCGGGCCTTTTCTGGGGGCTATCTTGCGGGGTCACTGGCGCAAt > 1:419612/1‑150 (MQ=255) gTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTAc < 1:474278/151‑1 (MQ=255) aTGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCt < 2:676308/151‑1 (MQ=255) ggCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTg < 2:370572/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCTGTGGCTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGGGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGcc > 1:127115/1‑151 (MQ=255) ggCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGcc > 2:421638/1‑151 (MQ=255) ggCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGcc > 2:679542/1‑151 (MQ=255) gcAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGt > 1:341174/1‑151 (MQ=255) cAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCTCTGGCGCAATGGTCCCTGGTTTGCCGCAACGTg > 1:726930/1‑151 (MQ=255) aGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTg > 1:525309/1‑150 (MQ=255) | CCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTG > NC_000913/4258827‑4259120 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |