Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 42.6% | 115.5 / 19.0 | 68 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/6); new base C (0/29); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGC > NC_000913/1376356‑1376646 | gCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAa‑cac > 2:410061/1‑151 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAa‑cac < 1:941966/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTc < 2:1040130/151‑1 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGcc < 1:55301/151‑1 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATg < 1:1162336/151‑1 (MQ=255) cgccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCccgccg < 2:660740/151‑1 (MQ=255) cgccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCccgccg > 2:1214173/1‑151 (MQ=255) gccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGt > 1:1029555/1‑151 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 2:352782/1‑150 (MQ=255) ggACGGCGCCCAAAAAATGGGGGGTAATCCCCTGCGCGTACTGGAACAGTCCGCCGCGCGTCCCGGACCG‑GTGGTGTATCTC‑AACCCTTAAACCCGT‑TATCAGTATAAAATGACCAC‑CCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtcg < 1:841855/149‑1 (MQ=255) ggACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGa > 2:1337518/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 2:301978/1‑151 (MQ=255) aaaaGGGGGAGTGATCCCCTGCGCGTACGGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGACCC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTAAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaaa < 2:214254/150‑1 (MQ=255) aaaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 1:1256511/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACAt > 2:922008/1‑151 (MQ=255) ggggagttaTCCCCGGCGGGTTCTGAAACGGGCCCCCGCGCGTCCCGGACCC‑GTGTTGTATCCCGACCCGTTAAC‑CCCC‑TATCAGGATCATATGACCAC‑CCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGt < 1:987282/147‑1 (MQ=255) gagttaTTCCCGGCGCTTTCGGAAACAGGTCGCCGCGCGTACGGGACCG‑GGGGTGTATCTCGACCCGTTAAC‑CCGC‑TATGATTATTATATAATCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACa < 1:1259536/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTTACTGGAACAGGCCCCCGCGCG‑ACCCGAACCGGGGGTTTACCTCGAACCGTTAAC‑CCCC‑TACCAGAATCAAATGACCAC‑CCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGc < 1:175820/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCg > 2:1073180/1‑151 (MQ=255) gcgcGTACGGGAACAGGGCGCCGCCCGTACGGGACCC‑GTGGTTTATCTCAACCCTTTAAC‑CCGT‑TATCAGGATAATATTTACAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCg < 2:734457/149‑1 (MQ=255) cgcgTACGGGAACAGGCCCCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTTTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGT‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGa < 2:307217/149‑1 (MQ=255) cgTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAttt > 1:18223/1‑150 (MQ=255) tatggcaaagggcccccgcGCGTGCGGCAGCG‑GTGGTTTATCCCAACCCTTTAAC‑CCGC‑TATAAGGTTCATAGGATCAC‑CACCCCCGCAGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt < 1:1148730/135‑1 (MQ=255) tagggaaaCAGGTCCCCGCGCGTCCCGCACCG‑GGGTTTTATAACGAACCTTAAAC‑CCGC‑TATAAGAATCTAATGATCAC‑CACCCTCGCTGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGa < 2:831379/139‑1 (MQ=255) aCTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGACCC‑GTGGTGTATCCCGAACCGTTAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTAt < 2:881059/151‑1 (MQ=255) aaCAGGCCCCGGCGCGTCCCGGAACG‑GGGTGGTTCCCCGACCCGTAAAC‑CCGT‑TATCAGGATAATATGACCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcaca < 1:262475/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGCGCGTACCGGACCC‑GTGGTGTATCCCGACCCGTAAAC‑CCGT‑TAAAAGGATAATATGACAAC‑CCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAat < 1:770268/151‑1 (MQ=255) cgTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:15524/1‑149 (MQ=255) cccgaaccc‑GTGGTGTATCTCAAACCTTTAAC‑CCGT‑TATCAGGATCATATAATCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATa < 2:583372/144‑1 (MQ=255) cggaagccttggttTACCTCG‑ACCGTTAAA‑CCCCTTTTCAGATAAATATGATCAC‑CCCCCCCGCCTATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAata < 2:148122/129‑1 (MQ=255) ggAACC‑GGGGTTTATCCCGACCCTTTAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATa < 2:963792/148‑1 (MQ=255) aaCG‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTg < 2:598007/151‑1 (MQ=255) aCC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg > 2:733757/1‑151 (MQ=255) cc‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgc > 2:566902/1‑151 (MQ=255) gtggtgTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcgc > 1:88960/1‑151 (MQ=255) ggggtgTCTCCCAAGCCGTTAAC‑CCGC‑TATAAGAAAAATATAACCAC‑CCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATaa < 1:135362/141‑1 (MQ=255) gtggtatacctccaCCGTTAAACCCAT‑TATCAGTATAATAGGATCAA‑CCCCCCCTCCTTGTCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt < 1:591820/133‑1 (MQ=255) tgtATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc > 2:778968/1‑151 (MQ=255) tATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcgc > 2:989522/1‑151 (MQ=255) aTCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt > 1:1164317/1‑151 (MQ=255) tcGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTg > 2:162605/1‑149 (MQ=255) ccgaacGTTAAACCCGA‑TATCGGGAT‑AAATGAACAACCCCCCCCGCCGTGCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCa < 1:873306/146‑1 (MQ=255) caaCCCTTAAA‑CCCCTTATAGGAATAATAGGAACAC‑CCCCCCCCCCGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt < 1:1055213/146‑1 (MQ=255) aaCCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg > 1:1158442/1‑150 (MQ=255) aCCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGAc > 1:643022/1‑151 (MQ=255) aCCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGAc > 1:146476/1‑151 (MQ=255) cGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACa > 1:718930/1‑150 (MQ=255) cGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACa > 1:150663/1‑150 (MQ=255) aaccccc‑TACCAGAATCATATGAACAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAc < 1:73878/142‑1 (MQ=255) aacccgttacaaGGATAATAGAACCAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcg < 1:298915/139‑1 (MQ=255) a‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgcg > 2:141759/1‑150 (MQ=255) agccgttacaaGGAACATATGACAAA‑CCCCCTCGCGGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgc < 2:345025/140‑1 (MQ=255) ccGC‑TATCAGTATAATATGACCAA‑CCCCCTCGCCTATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgc < 1:4245/148‑1 (MQ=255) cGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 1:651618/1‑151 (MQ=255) gC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCt > 2:499497/1‑151 (MQ=255) aGGATCAAATGACAAC‑CCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTg < 2:902315/146‑1 (MQ=255) ggATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt > 2:474474/1‑151 (MQ=255) ggATCATATGACCAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 2:706704/148‑1 (MQ=255) ggATCATATAATCAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCt < 1:1311091/147‑1 (MQ=255) aTCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc > 1:970803/1‑150 (MQ=255) aTCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc > 2:937456/1‑150 (MQ=255) cATAGGATCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtg < 2:542471/151‑1 (MQ=255) atatGATCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 2:731656/143‑1 (MQ=255) atatGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 2:682712/1‑151 (MQ=255) atatGACCAC‑CCCCCCCCCCGACGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 1:210828/143‑1 (MQ=255) tatGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgtg > 1:307116/1‑151 (MQ=255) tatGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgtg > 1:594021/1‑151 (MQ=255) tatGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtg > 2:941619/1‑149 (MQ=255) atGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGc > 1:212818/1‑151 (MQ=255) tGATCAA‑CCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgtg < 2:836667/149‑1 (MQ=255) | GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGC > NC_000913/1376356‑1376646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |