| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,903,692 | 0 | C | A | 42.5% | 122.9 / 55.8 | 88 | intergenic (+318/+1055) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/41); new base A (37/0); total (47/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.26e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
ACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGA > NC_000913/2903548‑2903842 | aCAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTc < 2:1014331/150‑1 (MQ=255) cAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑t < 2:805932/151‑1 (MQ=255) aGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTa < 1:504796/151‑1 (MQ=255) gAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACACTCA‑tt > 2:317097/1‑148 (MQ=255) tatTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACACCCA‑TTAgtc > 2:297273/1‑147 (MQ=255) tAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTTACCT‑c > 2:528361/1‑148 (MQ=255) tAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACAACCA‑TTTACCT‑c > 1:1128650/1‑148 (MQ=255) aaCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑Caaaa < 1:762685/151‑1 (MQ=255) aaCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑Caaaa < 2:1299879/151‑1 (MQ=255) cTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAAACACCCA‑TTAACCT‑Caaaa > 2:339796/1‑149 (MQ=255) acacTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTGTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑aaa < 1:482982/151‑1 (MQ=255) cacTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAg < 1:1115809/151‑1 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAAACAACCA‑TTAGCCT‑CAAAAA‑AAAGACa > 1:116479/1‑150 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACa < 1:501042/150‑1 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTTAAAACACTCA‑TTTTACT‑Caaaaa‑aaaaaaaa > 1:458201/1‑145 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACaaa < 1:384419/151‑1 (MQ=255) tttAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTAACCT‑Caaaaa‑aaaaaaaaa > 1:169067/1‑145 (MQ=255) ttAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCa < 1:318256/150‑1 (MQ=255) tAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGATA‑TTTAAAAACACTCA‑TTATACC‑Caaaaa‑aaaaaaaaaacttc > 1:389614/1‑143 (MQ=255) aGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAAACAATCA‑TTTTCTT‑CCAAAA‑AAAAACAAA‑At‑ttccca > 1:101419/1‑145 (MQ=255) aGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGAt < 2:1233848/151‑1 (MQ=255) aaaaGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAAAACTCA‑TTATACT‑CAAAAA‑AAAAACAAA‑AT‑TCCAGAttttt > 1:390336/1‑148 (MQ=255) aaaaGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATttat < 1:246612/150‑1 (MQ=255) aaaaGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATttat < 2:165386/150‑1 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTTAAAACACCCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCCGATTTTTT‑A‑Att > 2:1093056/1‑150 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAAAAATCA‑TTTAACT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AC‑TCCaacatttt > 1:682005/1‑138 (MQ=255) aTACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAAAACTCC‑TTATCCT‑CAAAAA‑AAAAACAAA‑AC‑TCCACATTTATT‑A‑CTTaa > 2:879321/1‑149 (MQ=255) aTACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCC‑TTAGCCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑CA‑TCCAGATTTTTT‑A‑CTTaa > 2:43948/1‑149 (MQ=255) gAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACCCA‑TTATTCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑CC‑TCCAGATTTATT‑T‑ATTTACCaa > 1:1081811/1‑149 (MQ=255) aTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGaa < 1:1019484/151‑1 (MQ=255) cGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAAt < 2:1155778/150‑1 (MQ=255) cGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAAt < 1:1046500/150‑1 (MQ=255) gCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGCAAAAACACCCA‑ATATACA‑CCAAAC‑AAAGACAAA‑ATCTCCGGATTT‑TT‑A‑CTTTACCaaagga > 2:1277468/1‑144 (MQ=255) gCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATaa < 1:540823/151‑1 (MQ=255) cACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTAACCT‑CAAAAC‑AAAAACAAA‑AA‑TCCCGATTTATT‑A‑ATTAAACAAAGAATaa > 2:398930/1‑150 (MQ=255) aCTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTC‑TGTTAAAAAACCCC‑TCACCCG‑CAAAAA‑AAAAACAAACCT‑TCAACGTTTA‑T‑A‑CTTAAACaaaaa > 2:556662/1‑142 (MQ=255) aCTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACACCCA‑TTTTCCTCCAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCC‑GATTTTTT‑T‑CTTTAACaaaaaaaaa > 1:33493/1‑142 (MQ=255) cTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTTATCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCCAATTTTTT‑T‑ATTTAACAAAGAATAACa > 2:600836/1‑150 (MQ=255) tttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTATCCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCTGAATTATT‑T‑CTTAACCAATtaataataa > 2:1295709/1‑150 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAACAACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAA‑AAAAACAAA‑AA‑TCCAGATTTTTT‑A‑CTTTACCAATGaaaaaaaa > 2:952539/1‑149 (MQ=255) aTCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAA‑AAAAACAAA‑AT‑TCCAGATTTTTT‑T‑TTTTAACAAAGAATAAAAAACtt > 2:264531/1‑151 (MQ=255) cAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTaa < 1:275118/151‑1 (MQ=255) aTTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAACACCCCA‑TTATACT‑CAAAAA‑AAAAACAAA‑AA‑TCCAGGTTTTTT‑A‑TTTTAACAATGAAAAAAAAGCTTtaa > 2:1233252/1‑150 (MQ=255) ttttCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑ATTAAAAAAAAACA‑TTAAACC‑CCAAAA‑AAAAAAAAA‑AA‑TCCCGAATTATT‑A‑ATTTAACCATCAATAAAAAAATTaaa > 1:443751/1‑149 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAatat < 1:55716/151‑1 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAata < 2:170696/150‑1 (MQ=255) tAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAc < 2:1101801/149‑1 (MQ=255) aaGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACCCC‑TTATCCT‑CCAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TTCCGATTTTTT‑T‑CTTAAACAAAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAATAATGtt > 2:717830/1‑151 (MQ=255) gTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAAACACTCA‑TTTGCCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AC‑TTCAGAATTTTT‑T‑CTTAAACAAAAAAAAAAAAAGTTaaaaaaaaaaatttttt > 2:1335308/1‑140 (MQ=255) aTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑tt < 1:382834/150‑1 (MQ=255) aTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑tt < 2:772625/150‑1 (MQ=255) gAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAAACACTCA‑TTAGGCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AA‑TTCCGATTTATT‑T‑TTTAAACAAAGAAAAAAAAAATTAAAAAAAATAATGTTA‑tttt > 2:688154/1‑148 (MQ=255) aaCTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTTAAAAAACCCA‑TTTACCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AA‑TTCAAATTTTTTAA‑ATTAACCATATAAAAAAAAACTTAAAAAA‑ATAATGTtt‑tttt > 1:513849/1‑147 (MQ=255) aCTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTaaa < 2:377108/151‑1 (MQ=255) ggATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGaa < 2:1046926/151‑1 (MQ=255) ggATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGa < 1:869992/150‑1 (MQ=255) atatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCC‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAAAAAAA‑AA‑TTCCGATTTTTT‑T‑TTTTACCAAAGAAAAAAAAACTTAAAAAAAATACTTTTT‑TTTTTaaaaaa > 2:1325141/1‑150 (MQ=255) tatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTGTAAAA‑AACTCC‑TTTGACT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AA‑TCCAGAATTATT‑A‑TTTAACCAAAGAATAAAAAACTTAAAAAAAATAATGTTT‑TTTTaaaaaaaa > 2:1047346/1‑150 (MQ=255) ttCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTTAAAAAACACATTTACCCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑T‑CAGATTTATT‑A‑CTTTAACAAAGAAAAAAAAACTTTAAAAAAATAATTTTT‑TTTTTAAAAAAAAAATAACa > 2:341497/1‑150 (MQ=255) ttCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACACCCA‑TTTACCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TTCCGATTTTTT‑T‑ATTTAACAAAGAAAAAAAAAATTTAAAAAAATAATGTTT‑TTTTTAAAAAAAAAATa > 2:651243/1‑147 (MQ=255) aTAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCa < 2:596978/151‑1 (MQ=255) tAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAAACACTCA‑TTAGCCTCCAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCA‑ATTTATT‑T‑CTTAAACAAAAAAAAAAAAACCTTAAAAAAATACTTTTT‑TTTTTAAAAAAAAAATaa > 2:14861/1‑144 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTa < 1:684102/151‑1 (MQ=255) gAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTaa < 2:812942/151‑1 (MQ=255) aaCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAt < 1:456510/151‑1 (MQ=255) aCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAAACACCCA‑TTAACCT‑CCAAAC‑AAAAAAAAA‑AT‑TTCAGATTTTTT‑T‑CTTTAACAAAGAAAAAAAAACTTTAAAAATATAATTTTA‑TTTTTAAGAAAAAAATAAAAAGGATTaa > 2:588322/1‑149 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TTTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CCAAAA‑AAAAACAAA‑AA‑TCCCGATTTATT‑T‑CTTAAACAAAAAAAAAAAAACTTAAAAAAAAAAATTTTT‑TTTTAAAGAAAAAAATAAAAAGCATTaa > 2:801029/1‑146 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTTTCCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑CA‑TACAGATTTATT‑A‑AATAAAACAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAATAATGTTT‑TTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGCATTaa > 1:134392/1‑146 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTc < 2:772072/149‑1 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCa < 2:6348/150‑1 (MQ=255) tcatcaACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTTAAAACAACCA‑TTTTCCT‑CAAAACAAAAAAAAAA‑AT‑TCCA‑ATTTTTT‑T‑TTTTACCAAAGAATAAAAAAATTTAAAAAAATAATTTTATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATTAAt > 1:749626/1‑146 (MQ=255) tcatcaACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTATCCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCCGATTTATT‑T‑CTTTAAAAAACAATAAAAAACTTAAAAAAAATAATTTTT‑TTTTAAAAAAAAAAATAAAAAGCAATaaattaa > 1:436145/1‑144 (MQ=255) tcatcaACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAat < 1:715835/150‑1 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTT‑TGTAAAAACACTCA‑TTATCCT‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AA‑TTCAGATTTATT‑A‑CTTAAACAAAGAAAAAAAAACATAAAAAAAATAATGTTA‑TTTTAAAAAAAAAAATAAAAAGGATTaaatta > 1:195119/1‑142 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TTTAAAAACACTCA‑TTACCCT‑CCAAAA‑AAAAACAAA‑AA‑TCCAGAATTTTT‑ATTTTAACCAA‑AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATATTT‑TTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGGATTAATTTAata > 1:1060230/1‑149 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAAACACCCA‑ATAACCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AC‑TCCAAATTTATT‑T‑ATTTAACAAAGAAAAAAAAACATTAAAAAAATAATGTTA‑TTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCAATAATTTAAAAtt > 2:870502/1‑151 (MQ=255) caACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTTAAAACACCCA‑ATTTCCC‑CAAAAA‑AAAAAAAAA‑AT‑TCCACAATTTTT‑T‑ATTTACCAATTAAAAAAAAAATTAAAAAATAAAATTTTA‑TTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCCTTaa > 1:1128025/1‑140 (MQ=255) caACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTa < 1:28486/150‑1 (MQ=255) ataGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaataat < 1:291450/151‑1 (MQ=255) gagGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGa < 1:897480/151‑1 (MQ=255) ggCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAtt < 1:913106/151‑1 (MQ=255) gCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTa < 1:879195/151‑1 (MQ=255) ggTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaaa < 2:186721/151‑1 (MQ=255) tAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt > 1:566855/1‑151 (MQ=255) tAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTCAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt > 2:632481/1‑151 (MQ=255) aaaaCCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt > 1:1307723/1‑150 (MQ=255) aaCCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAAc < 2:102890/151‑1 (MQ=255) aCCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACg < 2:118453/151‑1 (MQ=255) ccACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACg < 2:858233/150‑1 (MQ=255) ccACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGa < 2:1021025/151‑1 (MQ=255) | ACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTA‑TGTAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑CAAAAC‑AAAGACAAA‑CT‑TCCAGATTTATT‑A‑CTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTA‑TTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGA > NC_000913/2903548‑2903842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |