| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,425,236 | IS5 (–) +4 bp | coding (1455‑1458/1458 nt) | trkG → | Rac prophage; potassium transporter subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1396044 = | NA (NA) | 81 (1.130) | 67/296 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1425236 = | 0 (0.000) | coding (1455/1458 nt) | trkG | Rac prophage; potassium transporter subunit | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 100 (1.380) | 85/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1425239 | 0 (0.000) | coding (1458/1458 nt) | trkG | Rac prophage; potassium transporter subunit | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAA > NC_000913/1425089‑1425388 | gggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTaa < 2:519887‑M2/4‑1 (MQ=255) gacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAata < 1:260934‑M2/6‑1 (MQ=255) tatGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAgg < 1:319802‑M2/150‑3 (MQ=255) acaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgattcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAatat > 2:240722‑M2/145‑151 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAatatat > 1:334980‑M2/143‑151 (MQ=255) gATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtg > 1:82215‑M2/1‑143 (MQ=255) aaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGc > 2:569186‑M2/140‑151 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGAt > 1:86936‑M2/136‑151 (MQ=255) aGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcga < 2:638850‑M2/150‑12 (MQ=255) tttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaata < 2:1054027‑M2/149‑15 (MQ=255) tGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcg < 1:391028‑M2/151‑19 (MQ=255) tGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagc > 2:936374‑M2/1‑133 (MQ=255) ggggCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcgg < 1:856385‑M2/151‑20 (MQ=255) tctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATtgtg > 2:1051555‑M2/124‑150 (MQ=255) tACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaa < 2:867719‑M2/150‑24 (MQ=255) aCTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaat < 1:860638‑M2/151‑26 (MQ=255) cTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaat > 1:1005319‑M2/1‑125 (MQ=255) gacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGt < 1:603870‑M2/30‑1 (MQ=255) gCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaatt > 1:1102435‑M2/1‑123 (MQ=255) acggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGttt > 2:227474‑M2/120‑151 (MQ=255) cggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTa < 1:1027006‑M2/33‑1 (MQ=255) gcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAat > 1:148587‑M2/117‑151 (MQ=255) cacttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAata < 2:384009‑M2/36‑1 (MQ=255) gcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAatat > 2:852921‑M2/115‑151 (MQ=255) ttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAAtatt > 2:467782‑M2/113‑150 (MQ=255) aTTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggct < 1:1094964‑M2/151‑37 (MQ=255) actgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAAtattat < 2:690675‑M2/40‑1 (MQ=255) actgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactaatgatgaaccctgttctatggctccagatgacatacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATg > 2:443118‑M2/111‑151 (MQ=255) tCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctg > 2:446958‑M2/1‑113 (MQ=255) tCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTC‑TAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgac < 1:909570‑M2/151‑40 (MQ=255) cGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgac > 2:453332‑M2/1‑112 (MQ=255) ggAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgact < 2:643787‑M2/151‑41 (MQ=255) aGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactca > 2:814008‑M2/1‑109 (MQ=255) gTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcag > 2:800164‑M2/1‑108 (MQ=255) tGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt < 1:665228‑M2/151‑45 (MQ=255) aattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGactc > 2:824251‑M2/104‑151 (MQ=255) ttAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcat < 2:417698‑M2/151‑48 (MQ=255) cggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGa < 1:525687‑M2/57‑1 (MQ=255) aTTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcattt < 1:881307‑M2/150‑55 (MQ=255) tGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttct > 2:232444‑M2/1‑94 (MQ=255) gaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCa > 2:123762‑M2/90‑150 (MQ=255) gCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttc < 1:721687‑M2/151‑59 (MQ=255) cAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttc < 2:654475‑M2/150‑59 (MQ=255) ggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATAc < 1:375244‑M2/65‑1 (MQ=255) aagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCt > 1:365611‑M2/84‑150 (MQ=255) aagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCt < 1:1081161‑M2/67‑1 (MQ=255) aagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTa < 1:1011348‑M2/68‑1 (MQ=255) agttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTaa < 2:1103342‑M2/69‑1 (MQ=255) gtgCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgat > 1:575089‑M2/1‑79 (MQ=255) gactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTAcc < 2:603816‑M2/76‑1 (MQ=255) tgCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgatt < 1:219648‑M2/151‑74 (MQ=255) actcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTAcc > 1:743791‑M2/75‑150 (MQ=255) gCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattt > 2:438244‑M2/1‑77 (MQ=255) gCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgatt > 2:577637‑M2/1‑77 (MQ=255) gatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAac > 1:758161‑M2/69‑150 (MQ=255) gaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCCGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCt < 2:1131309‑M2/86‑1 (MQ=255) aaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTc > 2:680601‑M2/65‑151 (MQ=255) gATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgt < 1:555903‑M2/151‑85 (MQ=255) ttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcccc > 1:1120595‑M2/58‑151 (MQ=255) ggTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcc > 2:1108511‑M2/1‑60 (MQ=255) ggTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcc > 2:777142‑M2/1‑60 (MQ=255) gCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttg < 2:55254‑M2/150‑95 (MQ=255) ggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAg < 1:96131‑M2/99‑1 (MQ=255) tGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatc > 1:89523‑M2/1‑52 (MQ=255) tGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatc < 2:366417‑M2/150‑99 (MQ=255) aaTTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcc < 1:833374‑M2/151‑103 (MQ=255) gatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgct > 2:747337‑M2/45‑151 (MQ=255) tgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgctgc > 1:724521‑M2/43‑151 (MQ=255) gactgTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctattt < 2:981952‑M2/148‑108 (MQ=255) ccTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctattt < 2:845975‑M2/149‑108 (MQ=255) aacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgggg > 1:646853‑M2/38‑151 (MQ=255) gTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagacc > 1:99072‑M2/1‑39 (MQ=255) atgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGc < 2:148570‑M2/117‑1 (MQ=255) attatATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtt > 2:878448‑M2/1‑36 (MQ=255) tatTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttctt < 2:1076462‑M2/151‑120 (MQ=255) catatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt > 2:263082‑M2/28‑151 (MQ=255) catatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt < 1:433622‑M2/124‑1 (MQ=255) atTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttctt > 1:810342‑M2/1‑31 (MQ=255) atatcagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAtt > 2:173577‑M2/27‑151 (MQ=255) cagggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCAt < 1:562268‑M2/128‑1 (MQ=255) ttCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccat > 2:780495‑M2/1‑25 (MQ=255) tCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccattt < 2:1070858‑M2/151‑128 (MQ=255) tCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatt > 2:319760‑M2/1‑24 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATaaa < 1:486318‑M2/131‑1 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATaaa < 1:183069‑M2/131‑1 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATaaa < 2:69885‑M2/131‑1 (MQ=255) cAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccattta > 2:336485‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaagg < 1:160077‑M2/151‑132 (MQ=255) gTTTTTTTTGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaagg < 1:1045407‑M2/151‑132 (MQ=255) ttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCa > 1:576839‑M2/16‑149 (MQ=255) ttgttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCa > 2:732678‑M2/16‑149 (MQ=255) gttcgcacctttcCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGc > 1:341095‑M2/14‑151 (MQ=255) gttcgcaccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAgg < 2:889919‑M2/137‑1 (MQ=255) tttGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat < 2:1013953‑M2/151‑138 (MQ=255) tttGGCGCTCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat < 2:3677‑M2/151‑138 (MQ=255) ccttccCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGa < 1:227504‑M2/145‑1 (MQ=255) cCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCgag < 2:1090270‑M2/150‑1 (MQ=255) cTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttt < 2:102487‑M2/151‑148 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttttta > 2:495124‑M2/1‑2 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttt > 2:721589‑M2/1‑2 (MQ=255) | TAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAA > NC_000913/1425089‑1425388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |