Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,781,626 | 0 | G | T | 41.3% | 94.6 / 25.6 | 63 | N367K (AAC→AAA) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (25/12); new base T (0/26); total (25/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.06e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
ACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCA > NC_000913/2781477‑2781774 | ccaacCTGCCGGCTCCCGGCGGATCTACTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCCTTTCATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATCTTGGTGCCCGTGGCTATGCCATAATTATTAATCTTCTGTGTGCCACCATTACTTCTGGTATTTGTCGCGt > 1:586804/2‑151 (MQ=255) acaccCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGt < 2:932354/151‑1 (MQ=255) caacCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGtt < 2:201393/151‑1 (MQ=255) cggcgcgCTCCGGGAGGATATAGTTGTTGTTTAAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTc < 1:936609/143‑1 (MQ=255) ccGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCa < 2:262266/151‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGAGGTTTTAATTGTTGTTTCAGCTTCCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTg < 2:116792/147‑1 (MQ=255) ccGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATcc > 2:695858/1‑150 (MQ=255) ggaTATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAAcc < 1:377535/151‑1 (MQ=255) gttgtGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTAt > 1:87252/1‑151 (MQ=255) tCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTc > 1:776025/1‑151 (MQ=255) tttccccGCCGTTTTTGATATTTGGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCGGCAACACCCATACCCCCGCCAt < 1:314562/134‑1 (MQ=255) ttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg > 1:1021433/1‑151 (MQ=255) ccccGCCCTTTTTGATATTTTGCTTCCCGTTTTTAATATTGGTGCTGGTGGTTATGCAATATTTATAAATATTCTTTGTCCCACCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGc < 1:957293/150‑1 (MQ=255) cggtttttGATATTTTGCGTCCCGTTGTTGATATTGGTCCCTGTGGCAATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACAATTAATTTTGGTTTTTGTCGATTTTCTGGAAACATCTAGACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAg < 2:761724/147‑1 (MQ=255) ttaattttttGCGTCCCGTTGTTGTTTTTGGTGCCTGTGGTTATGCCATATTTATTAATATTCTGTGTGCCCCCTTTAATTATGGTTTTTGTCGGTTTTCCGGCAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTa < 2:459917/144‑1 (MQ=255) tatTTTGCTTTCCCCTGTTGATTTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATATTTTTTAATATTCTGTGTCCCCCCATAAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTCCACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCAt < 2:469180/150‑1 (MQ=255) ttttGCGTCCCGTTTTTGATATTGGTCCTTGTGGTTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTATTTATGTTTTTTGTCGCGTTCCCTCCAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTg < 1:895635/150‑1 (MQ=255) tGCTTTCCGTTTTTGATTTTGTTGCTTTTGGCTTTGCCTTAATTATTAATTTTCTGTGTCCCCCATTTATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt < 1:524060/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTa > 2:228996/1‑150 (MQ=255) ccgctttctatatGGGCGCGTGTGGCTGTGCTATAATTCTTAATATTCTGGCGCCCCCCATGAATTATGCAATTTGTCGAGTTCCCTCAAACCTCCTTAGCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt < 1:302328/141‑1 (MQ=255) ccGCTGTTGATTTGGGTCCCTGGGGCTTTCCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCCCATTTAATTATGGTTTTTTTCGCTTTTCCTCCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg < 1:638127/151‑1 (MQ=255) gCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGAc > 2:1080204/1‑151 (MQ=255) ttGATATTGTTGCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTCAACCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAtt < 1:803196/150‑1 (MQ=255) ttGATATTGGTGCCTGTGTCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAtt < 2:538907/150‑1 (MQ=255) tGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGt > 2:627750/1‑151 (MQ=255) ttGGTGCCTGTGGTTCTGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCCCTATAAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGtt < 1:592962/147‑1 (MQ=255) tgggTGCTTGTGGCTTTCCAATATTTATAAATTTTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTCCCTGCACCATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCt < 1:63101/148‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTAGGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCAAAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCtt < 2:618892/149‑1 (MQ=255) cttgtgGTTATGCCATATTTATAAATATTCTGTGTCCCACTTTTATTTATGTTTTTTTTCGCTTTCCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTAt < 1:833057/146‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt > 2:777718/1‑151 (MQ=255) ccTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt > 2:1011317/1‑151 (MQ=255) ccTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCACCATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt < 2:990864/151‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTATCCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACAATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCAAAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc < 2:417795/149‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt > 2:738953/1‑151 (MQ=255) ttattaATTTTCTGTGTCCCCCCATTATTTATGTTTTTTGTCGGGTTTCCTCCAAAATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTg < 1:224830/147‑1 (MQ=255) ttattaATATTTTGTGTCCCCCCTTTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTCCCTGCAACTTCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt < 1:618769/143‑1 (MQ=255) ttattaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTg > 1:508874/1‑151 (MQ=255) ttaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCg > 1:91501/1‑151 (MQ=255) atatTCTGTGTGCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGGTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAc < 2:80862/151‑1 (MQ=255) tCTGTGTGCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGGAACATCAAAAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat < 2:808446/150‑1 (MQ=255) tCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat > 1:179718/1‑150 (MQ=255) tCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat > 2:569035/1‑150 (MQ=255) gtgCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGt > 2:1057576/1‑151 (MQ=255) tgCCACCATTATTTATGTTTTTTTTCGCGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCata < 1:913594/145‑1 (MQ=255) tgCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGtt > 2:1011727/1‑151 (MQ=255) ccaccaTTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACTTCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGttt < 2:194463/150‑1 (MQ=255) ccacaaTTATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCCGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGtt < 1:141946/149‑1 (MQ=255) caccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTAt > 1:841586/1‑151 (MQ=255) accaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATg > 1:1017617/1‑151 (MQ=255) ccaTTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTAt < 2:136060/149‑1 (MQ=255) ccaTCAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt > 1:308243/1‑151 (MQ=255) catttaattaTGGTTTTTGTCGCTTTTCCTCCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATg < 2:921939/147‑1 (MQ=255) caattatttaTGTTTTTTTTCGCTTTTCCTAAAACATCTAAAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTAt < 1:33515/147‑1 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 2:693653/1‑151 (MQ=255) attaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAAt > 2:931536/1‑151 (MQ=255) ttaTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTCCAACTCCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTaaa < 2:570101/149‑1 (MQ=255) tGGTATTTGTCGTTTTCCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGac < 2:101019/150‑1 (MQ=255) ggTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGacc < 2:361039/150‑1 (MQ=255) tttttGTCGCTTTTCCGCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGac < 1:561690/145‑1 (MQ=255) tATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGACCCATATGCGTTTATGTCTAAATGaccacc > 2:373577/1‑151 (MQ=255) aTTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCg > 1:942312/1‑151 (MQ=255) tttGTCGCTTTTCCTGCAACATCAAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCg < 2:106788/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGtt > 2:85606/1‑151 (MQ=255) cgcgTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt < 2:88014/148‑1 (MQ=255) gcgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 1:400743/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCa > 1:1096844/1‑149 (MQ=255) | ACAACCTGCCGGCTCCCGGAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCA > NC_000913/2781477‑2781774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |