Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,350,853 | 0 | A | C | 46.9% | 103.3 / 10.8 | 67 | S725A (TCA→GCA) | arcB | aerobic respiration control sensor histidine protein kinase, cognate to two‑component response regulators ArcA and RssB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/6); new base C (0/30); total (28/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.33e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAG > NC_000913/3350704‑3351000 | ttttGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGAc > 2:298390/1‑151 (MQ=255) tttGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGa < 1:285899/149‑1 (MQ=255) tGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGAcccc > 2:841641/1‑151 (MQ=255) cacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCccgcc < 1:18201/151‑1 (MQ=255) tttCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCttt > 1:137466/1‑150 (MQ=255) ctcTTCTACGTCGTGCCCCCACTCTTTTTTCATCTCTTCAACCCATCCCCCGCCTTTTTCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCTGTTTTTGCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAAtttt < 2:1043238/148‑1 (MQ=255) ttCTCCGTCGTGCCCCCCCTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCGGG‑AGACTAATTTTGCTGCCCCATTTTTTGCAGATGGGGAACCCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTAt < 2:31768/149‑1 (MQ=255) ttCTACGTCGTGACGCCCCTCTTCTTTCATCTCTCCAATCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCGGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTAATTTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCGTACCCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTAt < 1:1024873/149‑1 (MQ=255) cTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcc > 1:719728/1‑151 (MQ=255) tACGTCGTGCCCCCACTCTTCTTTCATCTCTTAAACCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGCCTGATTTTGCGGACCAAGTTTTTGCAGTGGGCGTACCCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAtttt < 2:1012550/144‑1 (MQ=255) acgttcgtacccccACTCTTTTTTAATCTCTTAACCCAATCCCCCAACTTTATCTTCCCCGGCGGGAAGGTCAGG‑AGCCTGAATTTGCTCCCCTGGCTGTTGCAGATGGCTTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAAtttt < 2:1062948/132‑1 (MQ=255) cgtcgtGCCCCCCCTCTTCTTTCATCTCTCAAACCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCGTACCCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcctt < 1:990965/150‑1 (MQ=255) cgccgtGCCCCCCCTCTTCTTTCATCTCTTAAATCGTTACCCCGCCTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGTTAAGG‑ATACTGATTTTGCTGCCCAAGCTGTTGCAGAGGGCGAACCCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 1:687050/144‑1 (MQ=255) cgtGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTc > 2:928750/1‑151 (MQ=255) tgccccccctctTTTTCCATCTCTCAAACCCATCCCCCGCCTTTATCTCCCCAGGCCGAAAGGTCAGG‑AAACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcct < 1:402062/140‑1 (MQ=255) gccccccttcttttTTCCCCCCTCCAATCCATTCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcctt < 1:125333/136‑1 (MQ=255) gACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaac > 2:633692/1‑151 (MQ=255) aCTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGcc > 2:503674/1‑151 (MQ=255) ttcttcCCTCTCTCCAACCCATCCCCCGCCTTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGG‑AGCCTGATTGTGCTGCCCCGGTTTTTGCAGATGGCCAACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtt < 2:51930/149‑1 (MQ=255) tcttTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttttt > 2:749447/1‑151 (MQ=255) tCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATc > 2:487657/1‑151 (MQ=255) tCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATc > 1:678964/1‑151 (MQ=255) ctctTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgc > 2:361359/1‑151 (MQ=255) ctTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgcgc > 2:1034684/1‑151 (MQ=255) aacccttcccccGACTTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGCCAGG‑AGACTAATTTTGCGGCCCCAGTTTTTGCAGAGGGCGAACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGt < 2:313899/140‑1 (MQ=255) aacccttcccccGACTTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTGGGG‑AGACTAAATTTGCTCACCCGGTTTTTGCAGTGGGCATACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTc < 2:478053/141‑1 (MQ=255) aacccttcccccGACGTTATCTCCCCAGGCCGAAAGGTCAGG‑AGACTAATTTTGCTCCCCCAGCTTTTGCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg < 2:378613/134‑1 (MQ=255) aacccATCCCCCGACTTTATCTTCCCAGGCGGGAAGGTCAGG‑AGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCATACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg < 1:298446/141‑1 (MQ=255) caatgcACCGACGTTATCGTCCCAGGCGGAGAGGGCAGG‑AGACGGAATTTGCGGGCCCAGGTTTTGCAGATGCCGTACCCCCACGGGCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttt < 1:533941/127‑1 (MQ=255) ttCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc > 1:882680/1‑151 (MQ=255) cccccGTCGTTTTCTTCCAAGCCCGGAAGG‑CAGGTGGACGGACTTTGCTAACCCGCTTGTTGTAGAGGGCGAAACCCCATCGTCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCg < 1:226251/148‑1 (MQ=255) ccccGACTTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 1:974047/147‑1 (MQ=255) ccccGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGG‑AGACTGATTTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCTAACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 2:350039/147‑1 (MQ=255) ccccGACGTTATCCCCCCAGGCCGGAAGGCCAGG‑AGACTAAATTTGCTCCCCCGGCTGTTGCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCg < 1:239025/148‑1 (MQ=255) cGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTc > 2:1078174/1‑151 (MQ=255) tATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCAc > 2:573865/1‑151 (MQ=255) tATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCAc > 2:234881/1‑151 (MQ=255) cTTCCCAGGCCGGACGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCt > 2:593561/1‑151 (MQ=255) cccAGGCCGGAAGGTCAGG‑AACCTAAATTTCCTCCCCCAGTTTTTGCAGATGGCGTACCCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGAc < 2:613700/151‑1 (MQ=255) ccagggCGGGAAGGTCGGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGTTGTTGAAGAGGGCGAACCCCCACGGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGa < 1:301891/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAAGGGCAAGG‑AGCTGGATTTTGCTGCCCCATTTTTTGTAGATGGCTTACCCCCATTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACa < 2:1068470/151‑1 (MQ=255) ggAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTCCTGACCCAGTTTTTGAAGGTGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGccc < 1:762737/150‑1 (MQ=255) gaaaGGTCAGG‑AGACGAATTTTGCTGCCCCAGCTTTTGCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCg < 2:140061/149‑1 (MQ=255) agggTCGGG‑AGACTAATTTTGCTCCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCTAACCCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCgg < 1:18150/148‑1 (MQ=255) aaGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGc > 1:239378/1‑151 (MQ=255) ggttagcaggcggattttGCTGACCCATCTGTTCGAGAGGGCGAACCCCCCCTGTCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGcat < 1:1057251/136‑1 (MQ=255) aGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCatcatc > 1:459323/1‑151 (MQ=255) g‑agaCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtctt > 1:272758/1‑151 (MQ=255) gaCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtcttct > 2:555837/1‑151 (MQ=255) aCTGATTTTGCTGCCCCAGTTGTGGCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTtctc < 1:593686/151‑1 (MQ=255) gAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCaa > 1:1046908/1‑150 (MQ=255) attttCCTGACCCGGTTGTTGCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCa < 2:356069/146‑1 (MQ=255) ttGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACAcc > 2:535626/1‑151 (MQ=255) gCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCg < 2:213538/150‑1 (MQ=255) gCTGACCCAGCTTTTGCAGAGGGCGAACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACAcc < 2:418942/149‑1 (MQ=255) gCTCACCCAGTTGTTGGAGAGGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCg < 1:642230/150‑1 (MQ=255) ctcccccGGCTGTTGCAGATGGCGTACCCCCCCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGc < 2:838347/146‑1 (MQ=255) tgccccGGCTTTTGCAGATGGCTTAACCCCTCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGc < 1:488550/146‑1 (MQ=255) tcccccAGTTTTTGCAGATGGCTAACCCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACAcc < 2:1118016/144‑1 (MQ=255) aCCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAAc > 1:801375/1‑151 (MQ=255) cAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCg > 2:644270/1‑151 (MQ=255) aGCTGTTGCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGt < 1:344217/151‑1 (MQ=255) cTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCg > 1:256128/1‑151 (MQ=255) gCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTg > 2:386942/1‑149 (MQ=255) aGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTg < 1:742548/147‑1 (MQ=255) gATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCa < 1:1010794/150‑1 (MQ=255) aaCCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTc > 1:630439/1‑151 (MQ=255) cggACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAg < 1:472827/149‑1 (MQ=255) | TTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGG‑AGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAG > NC_000913/3350704‑3351000 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |