Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 41.9% | 100.2 / 11.8 | 62 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative DASS family tricarboxylate or dicarboxylate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/11); new base C (0/26); total (25/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG > NC_000913/801975‑802268 | aaCTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCAccgc < 1:164937/151‑1 (MQ=255) aaCTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCAccgc < 1:443444/151‑1 (MQ=255) ggCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGt > 1:88113/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGt > 2:56481/1‑150 (MQ=255) tttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTAct > 2:186175/1‑151 (MQ=255) ttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGTTTATCAAG‑CCTTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTAct < 1:341856/150‑1 (MQ=255) tttCCCTGGCGGCCATTGGGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCGGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCGGCCTAAATGGTGGTGGTCGTTAACTTATCCGAGGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCa < 1:779752/149‑1 (MQ=255) tttACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCa < 2:926757/149‑1 (MQ=255) tACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt > 2:293976/1‑150 (MQ=255) acttGGCGGCCATGGTGGGTTTGGTT‑CCAAGCCCTTTCCCGGACCCGTTCGTTTTGTTCACTCCTGTTGTTACCAAAATGTTGTTGGGC‑AAAACTTTACCACAGGTCGCGTTAAACA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAgc < 1:214909/145‑2 (MQ=255) ccgggcggcATTTGTGGGGTTGGTTTTCAAC‑CCTTTCCCGGACCCTGTCGTATTGTTAATTGCGGTTGCTGCTTCAAGGGTGGTGGGCGGTAATTTACCCGACGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa < 2:93077/146‑1 (MQ=255) ctggcgcactgtgtgGGGTGGGTTCTCAAT‑CCTTTCCGGAACCCTGTCGTCCTGTTAATTGCCGTTGCTGCTACAATGGTGGGGGTCGTTAACGTATCCGCCGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt < 2:280478/136‑1 (MQ=255) tGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTaccac > 2:378938/1‑151 (MQ=255) ggcggcCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCTGATGGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGTTCGGTAACTTATCCGACGGG‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTaccacc < 1:546302/151‑1 (MQ=255) ggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctgg > 2:834920/1‑151 (MQ=255) gcCTTTGTGGGGCTGGTTATAAAG‑CCTTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACct < 2:107700/148‑1 (MQ=255) cATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctg > 2:621343/1‑151 (MQ=255) cATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGAGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctg > 2:443686/1‑151 (MQ=255) gtgGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgtgt > 1:853179/1‑151 (MQ=255) ggCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTACCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc < 1:959314/151‑1 (MQ=255) aaG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGTTCGGTACCTTATCCGAGGGT‑GCGTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAc < 2:528988/149‑1 (MQ=255) accttttCCGGGACCTTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTAATTGGTGGTGGTGGTTAATTTATCCGACGGG‑GGGTTTAAAC‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAc < 1:684554/144‑1 (MQ=255) cTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa > 1:934548/1‑149 (MQ=255) cTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa > 1:148254/1‑149 (MQ=255) cccGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgcc < 2:618474/151‑1 (MQ=255) ccGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTACCTTACCCGACGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccg < 1:277444/151‑1 (MQ=255) ggAACGTTTCGTATTGTTAATTGCTGTGGCTCCTTAAATGTGGGTGGTCGTTAATTTTTCCTGCGGT‑GTGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccgc < 2:845965/150‑1 (MQ=255) acccTGTCGTACTGTTATTTGCCTTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTGGGTAACTTATCCGCCGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAtt < 1:913528/149‑1 (MQ=255) cTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtg > 1:951762/1‑150 (MQ=255) tGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtg > 2:163529/1‑149 (MQ=255) gTCGTACTTTTAATTCCCTTTGCTGCCTCAAGGGGGGTGGTCGGTAATTTATCCGACGGT‑CCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 2:423193/149‑1 (MQ=255) aCTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccacc > 1:353865/1‑151 (MQ=255) tttAATGGCCTTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGTTATTTTACCCGACGGT‑GCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCgg < 1:150118/149‑1 (MQ=255) gTTAATTGCGGTTTCTGCCTAATTGGTGGTGGTCGGTAATTTACCGGGGGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg < 1:434390/149‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGGGGTGGTGGTTAATTTATCCGACGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg < 1:623744/148‑1 (MQ=255) cctttGCTGCCTCAAGGGTGGGGGTCGGAAACTGACCCGGGGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTaa < 1:149621/148‑1 (MQ=255) cGTTGCGCCCTAAAGGGTGGTGGTCGTTAACTTCCCCGGCGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTaaa < 2:373951/151‑1 (MQ=255) gTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAAc > 1:356612/1‑151 (MQ=255) tgctgcTTAAATGGGGGTGTTCGTTACCTTACCCGACGG‑‑GCCTTTAAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg < 1:729458/150‑1 (MQ=255) gttgcCTGAATGGTGGTGATCGTTAATTTATCCGGCGGT‑GGGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGt < 1:152160/148‑1 (MQ=255) ctgcCTCAATGGTGGTGTTCGGTAATTTACCCGACGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTa < 1:99654/150‑1 (MQ=255) tCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCt > 2:602372/1‑151 (MQ=255) cAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCt > 1:595502/1‑150 (MQ=255) agtggtggtggGCTGTAACTTATCCGACGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa < 1:599168/148‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCt < 2:649334/149‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCt < 2:321872/149‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt > 1:45175/1‑151 (MQ=255) tggtggtggTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct > 1:977528/1‑151 (MQ=255) tggtggtggTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct > 2:257104/1‑151 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTTTCCGCCGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 2:157655/151‑1 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg > 2:966093/1‑151 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTACCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgct < 2:617375/150‑1 (MQ=255) ggtCGGTAACTTAGCCGACGGT‑GCTTTAAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGAtt < 1:375568/151‑1 (MQ=255) gttAACTTATCCGAGGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTa < 2:603938/149‑1 (MQ=255) gTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa < 2:818/151‑1 (MQ=255) tAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGGAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa > 1:942910/1‑150 (MQ=255) taccggACGGT‑CCTTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCg < 1:253219/145‑1 (MQ=255) tATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCgg > 2:16271/1‑151 (MQ=255) gtggcttttAAAC‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcacca < 1:395010/145‑1 (MQ=255) gTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGct < 2:33346/150‑1 (MQ=255) tttAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgg > 2:679427/1‑151 (MQ=255) tAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggt > 1:181742/1‑151 (MQ=255) a‑ccaccGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtctgg > 2:814288/1‑151 (MQ=255) | AACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAG‑CCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG > NC_000913/801975‑802268 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |