| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,290,201 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑21/‑296) | yejO ← / → narP | pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system/response regulator in two‑component regulatory system with NarQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 62 (1.250) | 42/298 | 0.3 | 98.4% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2290201 = | 1 (0.020) | intergenic (‑21/‑299) | yejO/narP | pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system/response regulator in two‑component regulatory system with NarQ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290204 | 1 (0.020) | 50 (1.000) | 41/298 | 0.4 | 98.0% | intergenic (‑24/‑296) | yejO/narP | pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system/response regulator in two‑component regulatory system with NarQ |
| ? | NC_000913 | = 3131340 | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTA > NC_000913/2290056‑2290353 | tacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatagctccaggtgacagacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAAt > 1:74069‑M2/146‑150 (MQ=255) tATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaagg > 2:546962‑M1/1‑145 (MQ=255) aaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGtt > 1:643097‑M2/140‑151 (MQ=255) aatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTaa < 2:45529‑M2/14‑1 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTaaa > 2:270987‑M2/136‑150 (MQ=255) ccAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATACTATGAAATTAAggaaggtgcgaa < 2:162836‑M1/150‑13 (MQ=255) cAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaat > 1:624809‑M1/1‑137 (MQ=255) cttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTaaaa < 1:629231‑M2/16‑1 (MQ=255) aGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataa < 2:215069‑M1/151‑16 (MQ=255) ttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTAAAAGCAt > 1:656287‑M2/132‑151 (MQ=255) aCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataagcggg > 1:221512‑M1/1‑131 (MQ=255) aCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataagcggg < 1:78512‑M1/151‑21 (MQ=255) cAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataagcgggg > 1:498676‑M1/1‑130 (MQ=255) 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aattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCAt < 1:477485‑M2/48‑1 (MQ=255) tGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtc < 1:754411‑M1/150‑46 (MQ=255) tcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATAc < 2:281373‑M2/50‑1 (MQ=255) actgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCg < 1:212029‑M2/53‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcattt < 2:528491‑M1/150‑50 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |