| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,186,115 | (TTCCGCTGG)1→2 | coding (766/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4186099 = | 4 (0.050) | 68 (0.910) | 59/282 | 0.4 | 95.2% | coding (750/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | = 4186107 | 3 (0.040) | coding (758/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GAGCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGT > NC_000913/4185959‑4186257 | gagCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtc > 2:27812‑M2/1‑149 (MQ=255)gaaaccaactccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggttccgctggttc < 1:42676‑M1/11‑1 (MQ=255) aaCGACACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctgg < 1:30665‑M2/151‑9 (MQ=255) tccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGAtg < 2:445086‑M1/20‑1 (MQ=255) cgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGAtggt > 1:340234‑M1/130‑151 (MQ=255) aaCCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccg > 1:933283‑M2/1‑138 (MQ=255) gaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGAtggtg < 1:908988‑M1/23‑1 (MQ=255) accaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGAtggtggtt > 2:208670‑M1/126‑150 (MQ=255) 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gccgccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgt > 1:403900‑M2/1‑24 (MQ=255) gcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACg > 1:961047‑M1/13‑146 (MQ=255) gcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGa > 1:716428‑M1/13‑147 (MQ=255) gtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACg < 1:438024‑M1/141‑1 (MQ=255) cAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctggcctgaacgatctgtatcggcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgtaa > 2:180616‑M2/1‑19 (MQ=255) 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GGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAg > 2:195873‑M1/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCgg > 1:1237821/1‑150 (MQ=255) | GAGCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGT > NC_000913/4185959‑4186257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |