Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 44.4% | 98.3 / 20.4 | 63 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/4); new base C (0/28); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGC > NC_000913/1376361‑1376653 | ccgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTc > 1:322480/1‑150 (MQ=255) cgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGTCCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGc < 2:352054/151‑1 (MQ=255) ccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCg < 1:836708/151‑1 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGAt > 2:434056/1‑151 (MQ=255) aCCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGccc > 1:398200/1‑151 (MQ=255) cTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccgc > 1:187371/1‑151 (MQ=255) tCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCTCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccgcc > 1:1015067/1‑151 (MQ=255) gccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGt > 1:765582/1‑151 (MQ=255) aagcggggACGGCGACCGAAAAAGGGTGAGTGTTCCCCTGCGCGTACGGAAACAGGTCGCCGCGCGTACGGGACCCGTGGTGTATCTCGACCTGTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACa < 2:706987/143‑1 (MQ=255) ggACGGCGCCCGAAAAATGGTGGGTGATCCCCGGCGCGTACTGGAACGGGCCCCCGCGCGTCCCGGACCGGGGTTGTATCCCAACCCGTAAAC‑CCGCTACCAGGATAAAATGATCACCCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaa < 1:469677/151‑1 (MQ=255) gcgcCCGAAAAAGGGTGGGTGATCCCCTGCGCGTACGGGAAAGGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGGGGTGTATCTCGACCCTTAAAA‑CCGTTATAGGGATAATATGATCACCCCCCTCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 2:830762/149‑1 (MQ=255) ccGAAAAATGGTGAGTGATCCCCTGCGCGTCCTGGAACAGGTCGCCGGGCGTCCCGGACCGGTGGTGTATCTCGACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt < 2:394200/151‑1 (MQ=255) aaaaGGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTGTATCTCGAACCTTAAAC‑CCGTTATCAGGATAATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaa < 2:348929/149‑1 (MQ=255) aaaaGGGTGAGTGATCCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCGGTGGTGTACCTCGACCTTTTAAC‑CCGCTACAAGGATAATATGATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc < 2:1172272/151‑1 (MQ=255) aTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATg > 1:1101178/1‑151 (MQ=255) gagtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 1:651376/1‑149 (MQ=255) gagtgaTCCCCGGCGCGTACGGAAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGGGGTGTATCTCAAACCTTTAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACa < 2:5260/150‑1 (MQ=255) tgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt > 1:156544/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCGTACGGGAACAGGCCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTGTATCTCGACCCGTTAAC‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCg < 2:322515/150‑1 (MQ=255) ccggcgcGTCCTGGAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGAACCGTGGTGTATCTCAACCCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGc < 2:567163/148‑1 (MQ=255) gcgTACGGGAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCGGGGGTGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCTCTATCAGGATCATATGATAAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAtt < 2:1015170/150‑1 (MQ=255) cgTACTGGAACGGGTCGCCGCGCGTACCGGAACGGTGGTGTATCCCGACCCTTAAAC‑CCGCTATCAGAATCATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCg < 2:654745/146‑1 (MQ=255) tACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt > 2:1238229/1‑150 (MQ=255) cggaaaCGGGTCGCCGCGTGTCCCGGAACGGTGGTGTATCTCGACCCGTAAAC‑CCGCTATCAGGATCATAGGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt < 2:1194239/144‑1 (MQ=255) tGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc > 2:568385/1‑150 (MQ=255) ggagcgggccgccgcGCGTACCGAAACGGTGGTGTATCCGGCACCTTTAAA‑CCGTTAAGAGGATCAAATCATAAACCCCCTCGCGAATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTa < 2:1048095/138‑1 (MQ=255) gaaaCAGGCCGCCGCGCGTACCGGACCGGTGGTTTATCCCGAACCTTAAAC‑CCGCTATCAGGATAATATAATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcac < 1:305988/149‑1 (MQ=255) aaCGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTGTATCCCGAACCGTTAAC‑CCGCTATCAGGATAATATGACCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTa < 2:1057785/145‑1 (MQ=255) aaCGGGTCCCCGCGCTTACGGGACCGGTGGTTTATCCCGACCCTTAAAC‑CCGTTACAAGGATCATATGATCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcaca < 2:493969/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACAt > 1:843585/1‑151 (MQ=255) aCAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 2:970690/1‑151 (MQ=255) cAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 2:1165801/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 2:327182/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGCGCGGCCGGGACCCGTGGTGTATCCCGAACCGTTAAC‑CCGCTATCAGGTTCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGaa < 2:328006/150‑1 (MQ=255) cgcggcgatacccGGAACCGTGTTGTACCTCGAACCGTAAAC‑CCGTTATAAGGATAATAGGATCAACACCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAata < 2:710177/138‑1 (MQ=255) cgccggGCGCCCGGGACCCGTGTTTTATCCCGACCTGTAAAC‑CCATTATAAGAATCATATGATAACCCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAt < 1:183181/133‑1 (MQ=255) cgccgcGCGTCCCGGAACCGTGGTGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCGCTATCAGAATCATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATc < 2:765649/151‑1 (MQ=255) cgcgTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCga > 1:571170/1‑148 (MQ=255) cccgTCCCGAACCCGTGTTTTATCTCGAACGGTTAAC‑CCGCTATCAGTATCATATGATCACCCCCCTCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaag < 2:579280/148‑1 (MQ=255) cgcaCCGAACCCGTGGTTTACCCCGACCCGTAACC‑CCGCTATCAGGTTAAAAAAACCACCCCCCCCGCCGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaagaa < 1:231134/147‑1 (MQ=255) gTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 1:270831/1‑148 (MQ=255) ggAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAAcc > 2:867833/1‑151 (MQ=255) gAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt > 1:302648/1‑151 (MQ=255) aCCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg > 1:377421/1‑151 (MQ=255) ggttTATCTCAACCCTTTAAC‑CCCTTATAAGAATAATATGATCAACCCCCTCGCCGTTCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCa < 2:675989/150‑1 (MQ=255) ggtgTACCCCGACCCTTAAAC‑CCGATAAAAGGATCAAATGATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCa < 1:733825/150‑1 (MQ=255) tgtATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc > 2:169275/1‑151 (MQ=255) ccaacccGTAAAC‑CCGTTAACAGAATAATATAACCAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGGGCt < 1:1034133/143‑1 (MQ=255) aaCCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg > 2:146759/1‑150 (MQ=255) aCCCTTAAACCCGCAATCAGGATAATATAACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcg < 2:618034/143‑1 (MQ=255) tAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATGGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcg > 1:808959/1‑151 (MQ=255) aaa‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgc > 2:1249101/1‑151 (MQ=255) ccGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAc > 1:851593/1‑151 (MQ=255) caggttaatataacaaaCCCCCCCCCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 2:398239/135‑1 (MQ=255) agtaTCATATGACCAACCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc < 2:651434/141‑1 (MQ=255) ggATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt > 1:319423/1‑151 (MQ=255) gATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc > 1:1252923/1‑151 (MQ=255) tCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt > 1:557805/1‑151 (MQ=255) tatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgtg > 1:160414/1‑151 (MQ=255) tatGAACACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt < 2:753723/148‑1 (MQ=255) aTCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCat > 2:16782/1‑150 (MQ=255) tCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCatat > 1:137483/1‑151 (MQ=255) aaCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt < 2:328561/143‑1 (MQ=255) acacCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGc > 1:1196771/1‑151 (MQ=255) | CCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGCTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGC > NC_000913/1376361‑1376653 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |