| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,186,115 | (TTCCGCTGG)1→2 | coding (766/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4186099 = | 1 (0.020) | 37 (0.900) | 35/282 | 0.3 | 97.4% | coding (750/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | = 4186107 | 1 (0.020) | coding (758/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
TGCGTGAAGAGCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGC > NC_000913/4185951‑4186247 | agctgaacgaaaccaactccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggttcc > 1:426504‑M1/149‑151 (MQ=255) acgaaaccaactccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggttccgctggt > 1:602759‑M1/143‑151 (MQ=255) gaaaccaactccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttcggccggtactgccgccagatctgcgtccgctggttccgctggttc < 1:548092‑M1/11‑1 (MQ=255) agCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtcc > 1:426504‑M2/1‑148 (MQ=255) caactccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggttccgctggttccgctg < 1:446282‑M1/16‑1 (MQ=255) aCGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggt > 1:602759‑M2/1‑142 (MQ=255) gAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCGGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttc < 1:548092‑M2/151‑12 (MQ=255) ccgaaaccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGAtgg < 2:425230‑M1/21‑1 (MQ=255) cAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctg < 1:446282‑M2/151‑17 (MQ=255) ccaagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcggtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCg > 1:64694‑M1/125‑151 (MQ=255) aagcgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGtt > 2:128536‑M1/123‑151 (MQ=255) ccGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatgg < 2:425230‑M2/151‑22 (MQ=255) cgtaaaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTcg < 2:227673‑M1/32‑1 (MQ=255) ccAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCGGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcg > 1:64694‑M2/1‑124 (MQ=255) aaaagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGAc < 2:88780‑M1/36‑1 (MQ=255) aagctgaccaagcgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACtt > 1:106575‑M1/114‑151 (MQ=255) aaGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtt > 2:128536‑M2/1‑122 (MQ=255) cGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcg < 2:227673‑M2/151‑33 (MQ=255) aaaaGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgac < 2:88780‑M2/151‑37 (MQ=255) aaGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgactt > 1:106575‑M2/1‑113 (MQ=255) cgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACg < 2:481650‑M1/50‑1 (MQ=255) cgtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACg < 2:25751‑M1/50‑1 (MQ=255) gtatcaaactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAAc > 1:218888‑M1/101‑149 (MQ=255) aactgctggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTa > 1:586686‑M1/95‑151 (MQ=255) cGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacg < 2:25751‑M2/151‑51 (MQ=255) cGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacg < 2:481650‑M2/151‑51 (MQ=255) gTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaac > 1:218888‑M2/1‑100 (MQ=255) ggaagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTAtcgtc > 2:184928‑M1/88‑149 (MQ=255) aagcgttcgttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGt > 1:212950‑M1/86‑151 (MQ=255) aaCTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgta > 1:586686‑M2/1‑94 (MQ=255) ggAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtc > 2:184928‑M2/1‑87 (MQ=255) gttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAAcc > 1:708878‑M1/78‑151 (MQ=255) ttcagtctggtaacaaaccagagtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgagtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCg < 2:604979‑M1/75‑1 (MQ=255) 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agtggatgatcctgaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTct > 1:348354‑M1/56‑151 (MQ=255) cAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctg < 1:47809‑M2/151‑89 (MQ=255) aCCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaa < 2:673409‑M2/150‑91 (MQ=255) agTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtct > 1:348354‑M2/1‑55 (MQ=255) gaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTgg > 1:247901‑M1/43‑149 (MQ=255) gaccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGc > 1:263890‑M1/43‑150 (MQ=255) ccgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTgc > 2:577529‑M1/41‑151 (MQ=255) gatCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTgc > 1:641669/1‑150 (MQ=255) cgttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTgcg > 2:414822‑M1/40‑151 (MQ=255) ttctgccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGcc < 1:523590‑M1/114‑1 (MQ=255) gccggtactgccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCgg > 1:88758‑M1/34‑149 (MQ=255) gACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggc > 1:263890‑M2/1‑42 (MQ=255) gACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctgg > 1:247901‑M2/1‑42 (MQ=255) ccGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgc > 2:577529‑M2/1‑40 (MQ=255) cGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcg > 2:414822‑M2/1‑39 (MQ=255) ttCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgcc < 1:523590‑M2/151‑115 (MQ=255) gccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATcgt < 2:232854‑M1/126‑1 (MQ=255) gCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccgg > 1:88758‑M2/1‑33 (MQ=255) ccgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATcgtac > 2:714677‑M1/24‑151 (MQ=255) cgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATcgtacg > 2:695199‑M1/23‑151 (MQ=255) cgccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATcgtacg > 2:93869‑M1/23‑151 (MQ=255) ccagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATcgtacgta > 2:493319‑M1/21‑151 (MQ=255) cagatctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGTTGCGCCGGACATCATcgtacgta < 2:285585‑M1/131‑1 (MQ=255) tctgcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGa < 1:317745‑M1/135‑1 (MQ=255) gccgccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgt < 2:232854‑M2/150‑127 (MQ=255) ccgccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtac > 2:714677‑M2/1‑23 (MQ=255) cgccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacg > 2:93869‑M2/1‑22 (MQ=255) cgccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacg > 2:695199‑M2/1‑22 (MQ=255) gcgtccgctggtTCCGCTGGTTCTGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGaaa < 1:192739‑M1/137‑1 (MQ=255) gcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACg > 1:718657‑M1/13‑146 (MQ=255) gcgtccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGa > 2:291976‑M1/13‑147 (MQ=255) ccAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgta > 2:493319‑M2/1‑20 (MQ=255) cAGATCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggttgcgccggacatcatcgtacgta < 2:285585‑M2/150‑132 (MQ=255) ccgctggtTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTa > 2:179906‑M1/9‑151 (MQ=255) tCTGCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgtaacga < 1:317745‑M2/150‑136 (MQ=255) gCGTCCGCTGGTtccgctggttctgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgtaacgaaa < 1:192739‑M2/149‑138 (MQ=255) gCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgtaacga > 2:291976‑M2/1‑12 (MQ=255) gCGTCCGCTGGTtccgctggttccgctggatggtggtcgtttcgcgacttctgacctgaacgatctgtatcgtcgcgtcattaaccgtaacaaccgtctgaaacgtctgctggatctggctgcgccggacatcatcgtacgtaacg > 1:718657‑M2/1‑12 (MQ=255) TCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGACCGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTAtgctgc < 1:369049‑M1/149‑1 (MQ=255) | TGCGTGAAGAGCTGAACGAAACCAACTCCGAAACCAAGCGTAAAAAGCTGACCAAGCGTATCAAACTGCTGGAAGCGTTCGTTCAGTCTGGTAACAAACCAGAGTGGATGATCCTGACCGTTCTGCCGGTACTGCCGCCAGATCTGCGTCCGCTGGTTCCGCTGGATGGTGGTCGTTTCGCGACTTCTGACCTGAACGATCTGTATCGTCGCGTCATTAACCGTAACAACCGTCTGAAACGTCTGCTGGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGC > NC_000913/4185951‑4186247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |