Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 43.0% | 114.0 / 38.6 | 79 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/9); new base A (0/34); total (36/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTG > NC_000913/29346‑29641 | tttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAatat > 1:289354/1‑151 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa < 2:870371/151‑1 (MQ=255) gTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaaaa < 1:996644/151‑1 (MQ=255) gTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaaa > 1:904105/1‑150 (MQ=255) tAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAt > 2:324191/1‑151 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATcc < 1:1009544/151‑1 (MQ=255) tttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCg < 1:690839/150‑1 (MQ=255) aCCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAtt > 2:893390/1‑151 (MQ=255) aCCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAt > 1:600858/1‑150 (MQ=255) aTTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 1:412154/1‑149 (MQ=255) tttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGt > 1:926950/1‑151 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGtt > 1:854308/1‑151 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGtt > 1:853599/1‑151 (MQ=255) tCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACt > 2:1099431/1‑151 (MQ=255) ttttCTGCTCTTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCA‑AGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGAAAAACATGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgc < 1:1016904/150‑1 (MQ=255) ttttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcg > 2:98345/1‑151 (MQ=255) tttCTGCTTTTTTTTTTTTCATCAATTTTTCTTGCTGCGAAGGCTTTTCCA‑AAAA‑CAGGTTAGATTTTTTTTTTGTCG‑TTAAAGCCTTGAAAAACTTGAAGGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcg < 2:364643/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTTTTTTTTTTTTCATCAATTTTTCTTGCTGCAAAAGCTTTTCCA‑AAAA‑AAGGTAAAATAATTTTTTTGTCGTTTAATGCC‑TAAAAAACATGAATGAGCCAAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcgc < 2:734619/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGcc > 2:604100/1‑151 (MQ=255) tCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc > 1:443625/1‑151 (MQ=255) cTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc > 2:950047/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc > 2:493966/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat > 2:48953/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat > 1:287066/1‑150 (MQ=255) tttttttttTCATGAAATCTTTTTGCTGCGAAAGCTTTTCCA‑AAAA‑CAGGTTAGATATTTTTTTTGTCGTTTAATGCC‑TGTAAAACTTGCATGACCAAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCata < 2:770974/146‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtctc > 2:205589/1‑151 (MQ=255) tttATTTCATGAATTCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCA‑AGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATGCC‑TGAAAAACATGCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCa < 1:804821/150‑1 (MQ=255) tATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa > 1:320363/1‑150 (MQ=255) tttcatcaatttttcttGCTGCCAAAGCTTTTCCA‑AAAA‑AATGTTAGATAATTTTTTTGTCGTTTATTGCT‑TAAAAAACATGCTGGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt < 2:46171/138‑1 (MQ=255) tcttctTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTg > 2:803476/1‑151 (MQ=255) cttCCTGAGCAAGCTTTTGCA‑AAAG‑CGGGTAAGATGTTTTTTTTGCCGTTTAGTCCT‑TAAAAAACTTACAGGCCCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc < 1:899272/148‑1 (MQ=255) gctgcGCAAGCGTTTCCA‑AGAA‑CAGTTAAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGAAAAACTTGCATGACCAACAAAAAAAAATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGttt < 1:925661/143‑1 (MQ=255) tgcGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt > 1:768304/1‑151 (MQ=255) tgcGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt > 2:334896/1‑151 (MQ=255) cgcAAGCTTTTTAA‑AAAA‑CGGTTTAAATTATTTTTTTGTCTTTTAAGCCT‑TAAAAAACATGCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGaaa < 2:168960/147‑1 (MQ=255) cgcAAGCTTTTCCC‑AAAA‑CAGTTTAGATGATTTTTTTGCCGTTTAATGCC‑TTAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGaa < 1:538561/146‑1 (MQ=255) gaaaGCTTTTCCA‑AAAA‑CAGTTAAGATGATTTTTTTGTCTCTTATTGCT‑TTAAAAAAATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGaaa < 1:517551/144‑1 (MQ=255) cgcaattgtttgaaaGAA‑CAGTTTAAATAATTTTTTTGTCGTTTAATGCT‑TAAAAAACAGGCATTACCCACAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg < 2:562912/137‑1 (MQ=255) aaGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TAAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc < 1:556690/147‑1 (MQ=255) gTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTa > 2:1061191/1‑150 (MQ=255) tttCCAAGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATGCG‑TGAAAAACATGAATAACCAAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTaa < 1:290629/150‑1 (MQ=255) tttCC‑AAAACCAGGTAATTTGATTTTTTTTTCGCTAAGTGCC‑TTAAAAACTGGCCCGACCAAAAAAAAAATAAAAAAATCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGt < 1:454582/148‑1 (MQ=255) ttccc‑AGAA‑CGGGTTAGATTATTTTTTTGTCTTTTAATGCT‑TGAAAAACATGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAg < 1:171096/147‑1 (MQ=255) tCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGCAAGc > 1:1060895/1‑149 (MQ=255) aaaacggtttAGATGATTTTTTTGCCGCTAATGGCG‑TGTAAAACAGGCATGGCCAAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGa < 1:48964/141‑1 (MQ=255) a‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 1:913297/1‑151 (MQ=255) aGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAt > 1:55075/1‑151 (MQ=255) ggTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 2:1057951/1‑151 (MQ=255) ttAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATCCC‑TAAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg < 1:37765/150‑1 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg > 2:865255/1‑150 (MQ=255) tatttttttttTCGTTTATTGCC‑TGTAAAACATGCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt < 2:195666/139‑1 (MQ=255) tttttttGTCGTTAAATCCT‑TGAAAAAAATGCATGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTa < 2:213149/145‑1 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 2:555772/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 1:1105828/1‑150 (MQ=255) ttttttTCGTTTAATGCT‑TTAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc < 1:379649/149‑1 (MQ=255) ctcTTAATGCC‑TAAAAAACATGCATGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt < 2:306619/146‑1 (MQ=255) cGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg > 1:869868/1‑151 (MQ=255) aaTGCC‑TTTAAAAAATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGa < 1:1132408/147‑1 (MQ=255) aatccctaaaaaaCATGCAGGACCAAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTa < 2:754965/142‑1 (MQ=255) gcttaaaaaaCATGCATACCCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTaa < 2:412049/143‑1 (MQ=255) cc‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGTCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat > 2:265895/1‑151 (MQ=255) cctaaaaaaCATGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAat < 1:1020372/144‑1 (MQ=255) c‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg > 2:218365/1‑151 (MQ=255) 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aCATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATa > 1:291389/1‑150 (MQ=255) gcatgAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 1:324269/151‑1 (MQ=255) atgACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagt < 1:34896/148‑1 (MQ=255) gggcaaaaaaaaaATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtga < 2:289286/141‑1 (MQ=255) gaccaaaaaaaTAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtga < 2:703310/141‑1 (MQ=255) gAGCAACAAAAAAAAATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagt < 1:494110/150‑1 (MQ=255) acccAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 1:202744/142‑1 (MQ=255) aGCCAAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 2:790113/148‑1 (MQ=255) caAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATAtt > 2:945691/1‑151 (MQ=255) aaaTAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtct > 1:769303/1‑151 (MQ=255) aaaataAAAAAATCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTctct < 2:853328/149‑1 (MQ=255) taataTAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTg > 1:349237/1‑151 (MQ=255) | TTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTG > NC_000913/29346‑29641 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |