| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 43.3% | 86.4 / 45.3 | 67 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/7); new base A (0/29); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGG > NC_000913/29349‑29642 | aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa < 2:132765/151‑1 (MQ=255)aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa < 1:191231/151‑1 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATcc < 1:182826/151‑1 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATcc < 1:377844/151‑1 (MQ=255) ttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc > 1:23225/1‑151 (MQ=255) ttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc > 2:3207/1‑151 (MQ=255) ttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGc < 2:855897/150‑1 (MQ=255) tGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGACACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc > 2:473685/1‑150 (MQ=255) aCCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAtt > 1:615986/1‑151 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGtt > 1:53458/1‑151 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGtt > 2:20297/1‑151 (MQ=255) cACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACttt > 2:853419/1‑151 (MQ=255) ttttttttGCTTTTTTTTTTTGCATGCATTCTTCTTCCTGCGCAGGCTTTTCCA‑AA‑AACAGTTTAAATTATTTTTTTGTC‑TTTAATTCCTTATAAAA‑ATTGCATGACCAAAAAAAAAATAAAAAAATCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 1:611218/150‑1 (MQ=255) tttttcTTGCTTGTTTTTATTTCATGAAATTTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCA‑AA‑AACAGTTAAAATAATTTTTTTTTCGCTAAATCCC‑TGAAAAA‑CATGCATGTGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACtttt < 1:171103/149‑1 (MQ=255) tttCTCCTTTTTTTTTTTTCATGAACTTTTTTTGCGGCGAAAGCTTTTCCC‑AA‑AACGGGTAAGAGTTTTTTTTTGTCTTTAATTGCT‑TAAAAAA‑CATGAATGACCAAAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcg < 2:877700/150‑1 (MQ=255) tGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat > 2:406690/1‑151 (MQ=255) ttttttttTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAGGCTTTTCCA‑AA‑AAAAGTTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATGCC‑TAAAAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCata < 2:720943/146‑1 (MQ=255) ttttttttTCAGCAAATTTTCTTGCGCCGAAAGGGTTTCCA‑AG‑AACAGTTAAGATAATCTTTTTGCCGTTAAATGCT‑TGAAAAA‑CATGCAGGGCCCAAAAAAAAAAATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtctc < 2:319612/150‑1 (MQ=255) ttttttttCATGCATTCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCA‑AG‑AACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATGCC‑TGAAAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc < 2:775491/150‑1 (MQ=255) aTTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt > 1:137913/1‑151 (MQ=255) aTGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccgc > 1:714851/1‑151 (MQ=255) cAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGt > 1:277380/1‑151 (MQ=255) ttcttGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:252632/1‑151 (MQ=255) aaGCTTTTACC‑AG‑AACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATCCC‑TGAAAAA‑CATGCATGACCCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg < 2:396669/151‑1 (MQ=255) aagtttttCC‑AAAAACAGTTTAGTTGTTCTTTTTGCCGTTTAATCCT‑CATAAAA‑TTCCCATGCCCCAAAAAACAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg < 1:390024/147‑1 (MQ=255) cGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGt > 1:8998/1‑150 (MQ=255) ttttCA‑AA‑AAAAGGTTAGATGTTTTTTTTGCCGTTTAATGCC‑TGAAAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCgg < 2:155253/147‑1 (MQ=255) tttCCAAG‑AACAGTTTAAATGATTTTTTTGTCGTTTATGGCT‑TAAAAAA‑CATGCATGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgt < 1:242950/144‑1 (MQ=255) tttccaaaaacggtttAGATGTTTTTTTTTTCTTTTATTCCT‑TAAAAAA‑CTTGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTaa < 1:760753/136‑1 (MQ=255) ttCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 1:451926/1‑150 (MQ=255) tCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 2:83893/1‑149 (MQ=255) c‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 1:616487/1‑147 (MQ=255) c‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 1:226956/1‑147 (MQ=255) aG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAtt > 2:860361/1‑151 (MQ=255) ggTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATGCT‑TGAAAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAt < 2:8855/150‑1 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGTATTGCAtt > 1:639392/1‑149 (MQ=255) attttttttttTCGCTTAAAACC‑TTAAAAACCAGCCAGAAGCCAAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg < 1:720236/141‑1 (MQ=255) tCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 1:277762/1‑151 (MQ=255) cgtttAATGCT‑TAAAAAA‑CTTGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt < 1:435918/145‑1 (MQ=255) cgtttaatccttaaaaaa‑aaTGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg < 2:794357/137‑1 (MQ=255) ttattcccttaaaaa‑CATGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa < 1:244462/139‑1 (MQ=255) aTGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTa > 1:820998/1‑150 (MQ=255) cctaaaaaa‑CAGGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat < 1:293740/146‑1 (MQ=255) c‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg > 2:835258/1‑151 (MQ=255) tGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 1:18808/1‑151 (MQ=255) tGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 1:181949/1‑151 (MQ=255) gTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 2:404374/1‑150 (MQ=255) gTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 1:419127/1‑150 (MQ=255) gTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 2:545298/1‑150 (MQ=255) aaaa‑aaTGCATGAGCAAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCa < 2:697142/149‑1 (MQ=255) aaaa‑CATGCATGCCCAAAAAAAAAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCa < 1:828742/149‑1 (MQ=255) aaaa‑CATGCAGGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 2:621468/147‑1 (MQ=255) aa‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAAt > 2:822807/1‑150 (MQ=255) 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aaaaaaaaATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGaa < 2:100433/146‑1 (MQ=255) aaaaaaTAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAatat < 2:740836/149‑1 (MQ=255) caAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATAtt > 1:46995/1‑151 (MQ=255) aaaaaaaATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat < 1:835149/147‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAatat < 1:178132/149‑1 (MQ=255) ataataTAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTctct < 2:451980/151‑1 (MQ=255) taataTAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTg > 2:227495/1‑151 (MQ=255) aataAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTctct < 2:23224/149‑1 (MQ=255) aataAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg < 1:692209/151‑1 (MQ=255) | AATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCC‑TGTAAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGG > NC_000913/29349‑29642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |