Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,105,483 | 0 | A | C | 44.3% | 119.3 / 11.5 | 70 | T351P (ACC→CCC) | mltC | membrane‑bound lytic murein transglycosylase C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/5); new base C (0/31); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.36e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGGCGCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCC > NC_000913/3105335‑3105628 | aggcgCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATAcc > 2:601125/2‑151 (MQ=255) agCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAAt > 1:346510/1‑151 (MQ=255) gTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCt > 1:142727/1‑151 (MQ=255) tgctgcGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCt > 2:620818/1‑150 (MQ=255) tgcGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTAccg > 2:1060617/1‑151 (MQ=255) gAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTAccgccg > 1:222826/1‑151 (MQ=255) gAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCAGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTAccgccg > 1:693541/1‑151 (MQ=255) gTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCAAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTAccgccgcc < 1:574563/151‑1 (MQ=255) cGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAAtt > 2:761909/1‑151 (MQ=255) cGAATGAAAAGATTAGGGCTGCGAATATTATTACCCCCAGGACGCGGGACGATGTTTATCAAACGTTAACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATaa < 1:364937/149‑1 (MQ=255) aTAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCAtt > 2:29739/1‑150 (MQ=255) gATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCg > 1:56354/1‑151 (MQ=255) ttCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGcc > 2:17478/1‑151 (MQ=255) aGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCt > 1:893849/1‑151 (MQ=255) gCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTg > 1:780963/1‑150 (MQ=255) tGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACg > 1:915948/1‑151 (MQ=255) tGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACg > 2:965928/1‑151 (MQ=255) aaTATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGc > 2:776217/1‑151 (MQ=255) attattAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTc > 1:485933/1‑150 (MQ=255) ttataacccccATGCCCCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGCCCCCCCACCCCTCTGCGGAATCTCCCCTTTATTTTTATAAAGTAAATCCCGCGCAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATCCCATTAACCGCCCCTGACGATGCt < 1:359464/139‑1 (MQ=255) ttacccccATGCCCCGGGGCGTTTTTTATCAGACGCTGACGCCCCCCCACCCCTCGGCGAATCCTCGCCTTTATTTTTATAAAGTGAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATCCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAggg < 2:193862/144‑1 (MQ=255) aaCACCATGCCCCGGGGGTATTTTAACCAGACCTAGACCCCCCGCCCCCCCTCTGCGAAATCCCGCCTTTTTTTTTAAAAAGTAAATCCCGCGAAAAACCCCTCCCGCCGCCAATAATCCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTc < 2:7349/144‑1 (MQ=255) cccATGCCGCGGGGCGTTGTTTATCAGCCGCTGACGCCCCCCCACCCCTCGGCGAATTCTCGCCGTTTTTTTTAAAAAGTAAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCaa < 2:429972/148‑1 (MQ=255) ccATGACGCGGGGCGTTTTTTATCAGCCGCTGACGCCCCCCCACCCCCCTGCGGATTCTCGCCGTTATTTTTAAAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCaaaa < 1:71810/150‑1 (MQ=255) aTGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATg > 2:631060/1‑151 (MQ=255) cggggggttGTTTATCGGACGCTGACGCCCCCCCCCCCCTCTGCGAAATCCCGCCGTTATTTTTAAAAAGTAAATCCCGCGAAAAAATCCTCCCCCCGCCGATATTTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAAt < 2:1010098/136‑1 (MQ=255) cggggCGATTTTTATCAGCCGCTAACGCCCCCCCACCCCTCTGCGAAATCTCGCCGTTTTTTTTATAAAGGGAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTAt < 2:150222/147‑1 (MQ=255) ccGGGCGATGTTTATCAGCCGCTGACGACCCGCCACCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTAAAAAGTGAATACCGCGAAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTa < 1:537640/148‑1 (MQ=255) cGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATcc > 1:618969/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTTTTATCAGCCGCTGCCGCCCCCCCACCCCCCTGCGAAATCTCCCCTTTTTCTTTAAAAAGGAAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATAAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCcaca < 2:361063/151‑1 (MQ=255) gATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATc > 1:114603/1‑150 (MQ=255) gATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATc > 1:369319/1‑150 (MQ=255) tGTTTATCAGCCCTTGACGCCCCGCCACCCCCCGGCGAAATCTCGCCTTTATTTTTAAAAAGTGAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATATTTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATca < 2:368219/149‑1 (MQ=255) gTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATcaca > 1:76129/1‑150 (MQ=255) tttATCAGCCGCTGCCGCCCCCCCTCCCCTCTGCGAATTCCCGCCGTTATTTTTAAAAAGTGAATCCCGCGCAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATcaca < 2:469033/149‑1 (MQ=255) ttaaTCAGAGCCTGACCCCCCCCCACCCCGCTGCGGAATCTGGCGGTTTTCTTAATAAGGTGAACCCCGCGAAAAAATCCTCCCCCGGCCGATATTTCCATAAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATcac < 2:436940/145‑1 (MQ=255) cgttgccgccccGCCACCCCCCGGCGAATCCCCGCCGTTATTTTTAAAAAGTAAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCAATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGtttt < 2:612882/141‑1 (MQ=255) cGCTGACGCCCCGCCACCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATCCCGCGCAAAAACCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTc < 1:55403/145‑1 (MQ=255) gCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGc > 2:748732/1‑151 (MQ=255) gCTGACACCCCCCCACCCCTCTGCGAAATCCCGCCGTTATTTTTATAAAGGGAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGtt < 2:899300/147‑1 (MQ=255) cgccccGCCACCCCTCGGCGGAATCCCGCCGTTATTTTTAAAAAGTGAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTc < 1:620795/136‑1 (MQ=255) gacCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTg > 2:930901/1‑151 (MQ=255) ccccccACCCCTCTGGGAAATCTCGCCTTTATTTTTAAAAAGGAAATCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGATATTTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTg < 2:908176/149‑1 (MQ=255) ccccccACCCCTCTGCGGAATCCCGCCTTTATCTTTAAAAAGTGAATCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCg < 1:1030098/137‑1 (MQ=255) ccccccACCCCTCTGCGAATTCTCGCCTTTTTTTTTATAAATTAAATCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGATATTTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTg < 1:962641/149‑1 (MQ=255) cccGCCACCCCTCGGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTAAAAAGTGAATCCCGCGCAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTggg < 1:262965/151‑1 (MQ=255) cGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGa > 2:1074377/1‑150 (MQ=255) cGCCATCCCTCGGCGAATTCTCGCCGTTATTTTTATAAAGTGAATCCCGCGCAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGaa < 1:889981/151‑1 (MQ=255) cATCCCTCTGGGGACTCTCGCCTTTTTCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAACCCTCCCCCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGt < 1:1060575/151‑1 (MQ=255) aTCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGtt > 2:11740/1‑151 (MQ=255) aTCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGtt > 2:240747/1‑151 (MQ=255) cccTCTGCGAATTCCCGCCTTTATTTTTAAAAAGTAAAACCCGCCAAAAACCCCTCCCGCCGCCAATATTCCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGttt < 2:1057026/150‑1 (MQ=255) gCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAatt > 2:188654/1‑150 (MQ=255) gaaaccccccctttATTTTTAAAAAGTGAATCCCGCGAAAAACTCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAattatt < 2:915982/139‑1 (MQ=255) aaTCTCGCCTTTATTTTTAAAAAGTGAATCCCGCGCAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTg < 1:744817/151‑1 (MQ=255) aaTCTCGCCGTTATTTTTAAAAAGTAAATCCCGCGCAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAttt < 1:987008/150‑1 (MQ=255) aaTCCCCCCTTTATTTTTAAAAAGTAAATCCCGCAAAAAAACCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAatt < 2:346517/146‑1 (MQ=255) aTCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGc > 2:530275/1‑151 (MQ=255) tctcGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGcc > 2:354443/1‑151 (MQ=255) ccccctttATATTTAAAAAGTGAATCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGAAAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTg < 2:533733/141‑1 (MQ=255) cGCCTTTATTTTTAAAAAGGGAACCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAttt < 2:142739/145‑1 (MQ=255) cGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGt > 2:259961/1‑151 (MQ=255) gTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAgg > 1:785722/1‑149 (MQ=255) aTCTTTATAAAGTGAATCCCGCGCAAAAACCCTCCCCCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTaa < 1:17479/149‑1 (MQ=255) tCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACa > 1:806386/1‑150 (MQ=255) tttAAAAAGTAAATCCCGCGCAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAAc < 1:654395/147‑1 (MQ=255) aaaaaggaaaTCCCGCGCAAAACCCCCCCCCCCGCAGTTAATTCCATTACCCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAAc < 2:135797/143‑1 (MQ=255) aaaGTAAATCCCGCGAAAAAACCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCa < 2:386015/151‑1 (MQ=255) aaGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAAcc > 2:44744/1‑149 (MQ=255) aaTCCCGCGAAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTcc < 1:631037/149‑1 (MQ=255) | CGGCGCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCC > NC_000913/3105335‑3105628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |