Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,258,974 | 0 | T | G | 48.3% | 87.0 / 15.3 | 58 | G411G (GGT→GGG) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/26); new base G (28/0); total (32/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACG > NC_000913/4258830‑4259123 | gATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCTGGgttt > 1:393207/1‑148 (MQ=255) gATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCCCCCCAGGGTTTtcg > 2:841571/1‑151 (MQ=255) tCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCt < 1:669258/150‑1 (MQ=255) gcagcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGGTTTgcggcgac > 2:973828/1‑145 (MQ=255) agcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCt < 1:176892/151‑1 (MQ=255) ggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCtt < 2:429866/151‑1 (MQ=255) ctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCCCCtt > 1:337268/1‑149 (MQ=255) tgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCACGGTTTGCGCTGACGCTCCTTAc > 2:1014985/1‑150 (MQ=255) tgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGGGGGCGCCGCCGGGTTTGCGCCGGCGCTCCTTAc > 2:545427/1‑150 (MQ=255) cTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACgccgcc > 2:1125319/1‑150 (MQ=255) atcttatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCg < 2:214942/149‑1 (MQ=255) atctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTg < 1:208442/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCCCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTggg > 1:1320684/1‑149 (MQ=255) gCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAAt < 1:1057893/151‑1 (MQ=255) ggTGATTTTGCCGGTGGTTGGGGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGACGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCAt < 2:832848/151‑1 (MQ=255) ggTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCAt < 1:244630/151‑1 (MQ=255) ggTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAAACa > 1:991065/1‑150 (MQ=255) gTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCCTACGCTGCCGGGGGTGGGGAATTAt > 1:1219000/1‑150 (MQ=255) gTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATg < 1:1172401/151‑1 (MQ=255) gTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCCTACGCTGCCGTGGGTGGGTAATCa > 1:1134260/1‑149 (MQ=255) gATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGGTTGCGCTGGCGCTCCTTACGCCGCCGTGGCCggg > 2:381205/1‑141 (MQ=255) aTTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCCGGGTTTGCGCTGGCGCCCCCTACGCTGCCCGGGGTGGGGGATCATGc > 2:164925/1‑149 (MQ=255) tttGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCCGCCGGGGGTGGGGAATCATGCttt > 1:459193/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtgg < 1:276179/151‑1 (MQ=255) tCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCCTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGCTGGGATTaaac > 1:440052/1‑147 (MQ=255) cTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCCGCCGGGGCTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAAcc > 1:405020/1‑148 (MQ=255) gtTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCt > 1:389451/1‑151 (MQ=255) aTCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGCTGGCCTTAACCCTCttttttg > 2:370471/1‑146 (MQ=255) tCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGGTGGCATTAACCGTCTTTCTTGCg > 1:1193230/1‑151 (MQ=255) ctgctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGGTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTTTGGCg > 1:431414/1‑150 (MQ=255) ctgctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCCTTCGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGGTGGCATTAACCGTCTTTTTGGCg > 2:891507/1‑150 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCTGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGATCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGtt < 2:299659/150‑1 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTg < 2:431611/151‑1 (MQ=255) ctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGGCGCCGCAGGGGTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGGGGGTGGGGAAACATGCTTTGTGGGGGGGGTTAAACGTCTTTTTGGGGtt > 2:232847/1‑149 (MQ=255) aCGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGACGCCGCCCCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCCTACCCTGGCGTGGCTTGGGAATCCTGCTTTGTGGCCGGCATTTACCGCCTTTCTGGCGGTGGGCgg > 1:1077592/1‑151 (MQ=255) ggCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCCCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTTCTCTGCCGCGGCTTGGGAAACCTGATTTTTGGCTGGCATTTAACCCCTTTCTTGGGTTGCGCggg > 2:683545/1‑150 (MQ=255) aTGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGCGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCCGTCCCCCCCTACGCCGCCGTGGCTGGGGAAACAAGCTTTGTGGCTGGGATTAAACGCCTTTCTTGCGTTGCGCGGGGttt > 1:873938/1‑151 (MQ=255) gTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTtct < 1:232772/151‑1 (MQ=255) aGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTggc < 1:758494/150‑1 (MQ=255) gcAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGGTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTTGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTggcgg > 1:881699/1‑148 (MQ=255) cAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTAt < 1:1326699/151‑1 (MQ=255) cAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGCGGGTGGGTAATCCTTCTTTTTGGCTGGGCTTTACCCTCTTTTTTGCGGTGGGCGGGCTTTCTTTggcgg > 2:1261549/1‑147 (MQ=255) cgcgTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTg < 1:983631/151‑1 (MQ=255) tGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAAACGTCTTTTTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggcgg > 1:483217/1‑151 (MQ=255) aaaTGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTg < 1:1234081/151‑1 (MQ=255) aTGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGgc < 1:590940/151‑1 (MQ=255) gCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCCCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGCTGGCATTAACCGTCTTTTTGGCGGTGCGCGGGGTTTTTCTGGCGGCTATCTTGCGGCGTCACttg > 1:540046/1‑146 (MQ=255) gTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCaa < 1:996489/151‑1 (MQ=255) aGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCCGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGGTGGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCCTTAACCGTCTTTTTGGCGTTGGGCGGGCTTTCTCTGGCGGGTATTTCGGGGCGTCACCGgggcca > 2:927570/1‑144 (MQ=255) gTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTAc > 1:122950/1‑151 (MQ=255) aTGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCt < 1:896431/151‑1 (MQ=255) cGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGtt < 2:731189/151‑1 (MQ=255) ggTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGATTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGttt < 2:522576/151‑1 (MQ=255) ccgccgCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGc < 2:803738/151‑1 (MQ=255) cgccgcAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGc > 1:1269171/1‑150 (MQ=255) ccgcAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTTCGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAAc < 2:522001/151‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACg < 2:577428/151‑1 (MQ=255) ggTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGAc > 2:1173788/1‑151 (MQ=255) gTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACg < 2:337442/151‑1 (MQ=255) | GATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACG > NC_000913/4258830‑4259123 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |