| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,378,802 | 0 | A | C | 39.7% | 111.5 / 14.7 | 59 | V48G (GTA→GGA) | ampC | penicillin‑binding protein; beta‑lactamase, intrinsically weak |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/0); new base C (0/23); total (35/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCT > NC_000913/4378653‑4378951 | ccccTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑a < 1:502632/150‑1 (MQ=255) ccTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accg > 2:46661/1‑151 (MQ=255) ccTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accg < 2:1217552/151‑1 (MQ=255) cGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTATCCTGATAAATT‑accgcc > 2:1089994/1‑150 (MQ=255) cGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accgcc > 2:817042/1‑150 (MQ=255) cGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accgc < 1:586273/149‑1 (MQ=255) aGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accgccacc > 1:1030014/1‑151 (MQ=255) aaTAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑accgccaccgcc > 2:88114/1‑151 (MQ=255) tCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCg > 1:692532/1‑151 (MQ=255) tCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCg > 1:962855/1‑151 (MQ=255) gCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCggg > 1:1316273/1‑151 (MQ=255) caAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCtt > 1:327574/1‑151 (MQ=255) cACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTttgt > 1:784307/1‑151 (MQ=255) aCGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTttgtt > 1:696139/1‑151 (MQ=255) ccAGAAATTGTTTTGCTGCCCAACCCAACCAAAAACACGGTTTGGTGTGTGGGGGTTTGTTTTTTGGCGTTGCCCGCACACCCCGAGAAAAAGTAAA‑AAGTTTTCCCCTAATAATTC‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGc < 2:505483/150‑1 (MQ=255) atttttttGCTGACCAACCCAAACTAAAACACCGTTTGTTGTGGGAGGGGTTGTTTTTTGGGGATGCCCGAAAACCCCCGGATAAAGAAAT‑AAGTTTTCCCCTAATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATaa < 1:828995/147‑1 (MQ=255) tGTTTTGCTAACCGACCCAAACTAAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGTTGTTTTTTGGGGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTCCCTTGATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAg < 1:622012/150‑1 (MQ=255) tttGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACAGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCggg > 2:3701/1‑151 (MQ=255) ttccTGCCCAAACCTACCACAAACAACGTTTGTTGTGTGACGGCCTTTTTTTTGGCGATGCCCCCATCCCCCAAGTTAAAGTAAT‑AAGGTTTCCCCTAATAAATT‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCggg < 1:645867/147‑1 (MQ=255) ttGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCgggg > 2:724344/1‑151 (MQ=255) gCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGt > 1:1091927/1‑150 (MQ=255) cggcccGAACCTACCCCAAACACCTTTTGCGTTGTGACGGTTTTTTTTTTGGCGATGCCCGCTCCCCCCCGGGTAAAGTAAA‑AGGGTTTCCCTTAAAAAATT‑GCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGt < 2:88905/145‑1 (MQ=255) tGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAt > 1:222430/1‑151 (MQ=255) gAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtgtg > 2:1210388/1‑150 (MQ=255) accaaaccgcAAAGAAAGTTTGCTGGGAGGGGGGTTTCTTTGTGGTGATGCCCACATCGCCCGAGGTAAATAATT‑TTGTTTTCCCCTGAAAAATT‑CCCCCCTCCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCg < 2:154454/142‑1 (MQ=255) cTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGcac > 2:983655/1‑150 (MQ=255) cTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGcac > 1:501997/1‑150 (MQ=255) aaaCACCGTTGGCTGTGTGAGGTGTTTTTTTTGGGCGAGTCCCGCACAGCCCCAGAAAAAGTAAT‑AAGTTTTCCCTTAATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGcaca < 1:141668/148‑1 (MQ=255) aaaCAACTTTTGCTGTGTGCGGGGCTGTTTTTGGGCGATGCCCGCATACCCCCGGAAAAAGTAAA‑AAGTTTTCCCCTAAAAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAat < 1:257651/150‑1 (MQ=255) aaaCAACTTTTGCTGTGTGAGGGGCTGTTTTTGGGGGATGTCCGAATCCCCCCAGGAAAAGAAAT‑AGGTTTTCCCCTAATAAATC‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGcac < 1:718517/147‑1 (MQ=255) aaaCAACGTTTGCTGTGGGGCGGGCTTTTTTTTGGCGATGCCCGCATACCCCCAGGAAAAGAAAT‑AAGTTTTCCCCTGATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAat < 1:929636/150‑1 (MQ=255) caacGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCg > 1:830926/1‑151 (MQ=255) gtgAGGGGCTGTTTTTTGGCGTTGCCCGCATACCCCCAGGAAAAGTAAT‑AAGTTTTCCCCTAATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATttgtt < 1:331218/148‑1 (MQ=255) tgACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTGAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAgg > 2:611802/1‑151 (MQ=255) aCGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAgggg > 2:1272289/1‑151 (MQ=255) aCGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAgggg > 2:422710/1‑151 (MQ=255) ggttttttttttGGCGTTGCCCCCACAGCCCGGGAAAAAGAAAT‑AGTTTTTCCCTTAATAATTT‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGgca < 2:157569/144‑1 (MQ=255) gggCTTTTTTTGGGCGATGCCCGCAAACCCCCAGTAAAATAAAT‑AAGTTTTCCCATAAAAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGgca < 1:187716/151‑1 (MQ=255) gggCTTTTTTTGGGCGATGCCCGCAAACCCCCAGGAAAAGTAAT‑AAGTTTTCCCTTAATAATTT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAgggg < 1:1273651/149‑1 (MQ=255) gggCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGgc > 1:567970/1‑150 (MQ=255) ctgctTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGgcag > 2:242057/1‑149 (MQ=255) tttttttGGTTATGCCCGCAT‑CCCCCGAGTAAAATAAA‑TAGGTTTTCCCTTAAAAATTCCCCGCCTCCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGgcagc < 2:479454/146‑1 (MQ=255) ttttGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAAtg > 2:791942/1‑150 (MQ=255) tttGGCGGTGTCCGCAGGGCCCAGGGTAAA‑TAATGAAGTTTTACCGGGAAAATTC‑CCCCCCTCCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAAtgt < 1:914380/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTgg > 2:365628/1‑150 (MQ=255) gATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCa > 2:311898/1‑150 (MQ=255) ccGCATACCCCCAGGAAAATTATA‑AGGGTTTCCCCTAAAAAATT‑CCCCCAACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAaga < 2:1284152/148‑1 (MQ=255) tAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGta > 1:152248/1‑150 (MQ=255) tAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGt > 2:186683/1‑149 (MQ=255) ccAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGtaattaat > 1:1207505/1‑151 (MQ=255) tAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAgg > 1:380541/1‑150 (MQ=255) tAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGgc > 1:824263/1‑151 (MQ=255) aaaaTAAT‑AAGTTTTACCTTAAAAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGgcg < 1:687384/151‑1 (MQ=255) aat‑aaGTTTTCCCCTGAAAATTT‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCaga < 1:724007/150‑1 (MQ=255) gttttcccttaaaaaaTT‑CCCGCCCCCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGcg < 1:144692/135‑1 (MQ=255) gttttCCCCTAATAAATT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGcgtc < 1:369548/148‑1 (MQ=255) gttttCCCCTAATAAATT‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCag < 1:960180/142‑1 (MQ=255) tttCCCCTAAAAAATC‑CCCCCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGcgtcg < 1:88075/149‑1 (MQ=255) tACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGtttt > 1:1271973/1‑151 (MQ=255) ccTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGAAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGtttt > 2:1129972/1‑148 (MQ=255) aaaTT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAgg > 2:1245327/1‑151 (MQ=255) aaaTT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAgg > 1:587537/1‑151 (MQ=255) aaaTT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAgg > 1:975434/1‑151 (MQ=255) aaTT‑CCCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATa < 2:300036/148‑1 (MQ=255) aTT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAggg > 2:703793/1‑150 (MQ=255) aTT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAggg > 1:752345/1‑150 (MQ=255) t‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCt > 1:91401/1‑151 (MQ=255) | CCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAAT‑AAGGTTTACCCTGATAAATT‑ACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCT > NC_000913/4378653‑4378951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |