| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→8 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,047 | 1 | . | C | 95.7% | 238.2 / 3.6 | 70 | coding (1286/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base C (33/34); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
CTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTT > NC_000913/307903‑308192 | cTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑c‑ccccc > 1:673991/1‑151 (MQ=255) tACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑c‑cccccc > 1:315423/1‑151 (MQ=255) cGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑c‑ccccccc > 2:738078/1‑149 (MQ=255) tCGCCATTGATTGTAAATGCGGGTCTTTTCCTCACAAACCACCAGCGTCTTAATGCTTCCCGGTCGCGTGGCGCTGATTATGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGAATCATTTGAACGATAACGTCGATCggcacctcga > 2:207630/1‑140 (MQ=255) cGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑c‑cccccccaagc < 1:1036899/151‑6 (MQ=255) cGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑c‑cccccccaag < 1:675029/150‑5 (MQ=255) cGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑C‑CCCCCCAAGCg < 2:542522/151‑1 (MQ=255) cAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCgg < 1:597024/151‑1 (MQ=255) aaTTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGc > 2:489908/1‑151 (MQ=255) attgattgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCa < 1:1080309/151‑1 (MQ=255) gattgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCg > 1:966665/1‑151 (MQ=255) gCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc > 2:776671/1‑149 (MQ=255) gCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAg < 2:1141264/151‑1 (MQ=255) gCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 1:125399/150‑1 (MQ=255) gggTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt > 1:852300/1‑151 (MQ=255) gggTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt > 2:872452/1‑151 (MQ=255) ggTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt > 2:926585/1‑150 (MQ=255) cTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 2:737511/1‑151 (MQ=255) gATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc < 1:764546/149‑1 (MQ=255) aTTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg > 1:814384/1‑151 (MQ=255) aaCCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt < 1:964866/151‑1 (MQ=255) aaCCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt > 1:1216809/1‑151 (MQ=255) aCCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt > 1:143517/1‑150 (MQ=255) cccACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGTGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt < 1:1129003/151‑1 (MQ=255) cccACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt > 1:285193/1‑151 (MQ=255) cacaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 2:690026/151‑1 (MQ=255) aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTAt > 1:2997/1‑151 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat > 1:1218951/1‑151 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat < 1:634277/151‑1 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat > 1:804812/1‑151 (MQ=255) aaaGCGTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATAATGCTGCGTGAGCTGTCGCTGGCCCTCATATTTTGGAGGTTAACGTTGATCT‑‑CGCCCCCCAGGCGCCAGCGCCTGACGGGCCTCACCCACCATCTGATTATCGCATCCATAGcc > 2:525632/1‑151 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat < 1:924944/149‑1 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGTGGTGTCACTGGCCGGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat < 2:322984/148‑1 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 2:633007/151‑1 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGt < 1:50917/151‑1 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 1:661807/1‑151 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 1:623078/1‑151 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGTTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCa < 2:230908/150‑1 (MQ=255) gagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc < 1:1098682/151‑1 (MQ=255) agTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCt < 2:1208196/151‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa < 1:692351/151‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCTGCCCAGCTa > 2:1210662/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 2:806446/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 2:895281/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATAGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 2:803458/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc > 1:29135/1‑151 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 1:293599/150‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa < 1:168122/151‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa < 1:51397/151‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa < 1:388333/151‑1 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc > 2:1142725/1‑151 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc > 2:500751/1‑151 (MQ=255) aTGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCg < 2:990541/151‑1 (MQ=255) 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tGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTg > 1:160889/1‑151 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGc < 1:4906/151‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGc < 1:737516/151‑1 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTa < 1:1015357/151‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAg < 2:1208828/151‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCATATGTTGAAGGTTAACGTTTATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCATCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCGAGCTAGGCGTACTCAAGGAGCCGGAGGTCGAGGCTCCTGCTAg < 2:548752/150‑1 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActctc < 2:799955/151‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActctct > 2:603634/1‑151 (MQ=255) tatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGCGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActctct < 2:385416/150‑1 (MQ=255) atTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCtt < 1:597571/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCttt > 2:450998/1‑149 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTgg > 1:519076/1‑151 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCGCCC‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTgg < 2:274443/151‑1 (MQ=255) gTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGTTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTGAATGAGCCGGAGGTCGAGGCTCCTGCTAGCCACCTCTCTTTAGCTGGTcg < 2:643475/151‑1 (MQ=255) gTTAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTcg > 2:1128032/1‑151 (MQ=255) ttAACGTTGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTcgc > 2:1133651/1‑151 (MQ=255) tGATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATCATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGCCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCtttt > 1:1192523/1‑151 (MQ=255) gATCGC‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCttttt < 1:52968/151‑1 (MQ=255) | CTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑C‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTT > NC_000913/307903‑308192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |