Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,486 | 0 | C | A | 40.0% | 120.5 / 39.4 | 65 | intergenic (+291/‑165) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/10); new base A (0/26); total (29/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGA > NC_000913/29343‑29631 | tgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAaata < 2:1044358/150‑1 (MQ=255) tgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAaata < 2:981890/150‑1 (MQ=255) tgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAaata > 2:27034/1‑150 (MQ=255) gttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAaataat > 1:616374/1‑151 (MQ=255) gttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCACGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACaaaa < 2:44661/147‑1 (MQ=255) tttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAataata < 2:817281/150‑1 (MQ=255) tttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAatat > 1:500912/1‑151 (MQ=255) ttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAatat > 1:679235/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATaa > 2:329386/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATaa < 2:566149/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTTAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATGATATAAAAAAt < 2:426137/150‑1 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATcc < 1:731530/151‑1 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATccc < 1:1093970/151‑1 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATccc < 2:447374/151‑1 (MQ=255) ttttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCg > 1:1096135/1‑151 (MQ=255) cATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 2:248640/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtttt > 2:377489/1‑150 (MQ=255) ttttttCTGCTCTTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCAAA‑AACAGGTTAGATGATTTTTTTGCCGT‑TTAAT‑GCCTGAAAAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtttt < 1:62050/149‑1 (MQ=255) ttttttCTCTTTTTTTTTATTTCATGCATTTTTTTTGCGGCGAAAGCTTTTCCAAG‑AACAGTTTAAATTATTTTTTTGTCGC‑TTAAT‑CCTTAAAAAAC‑TTGCTTGAACC‑AAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACttt < 2:1185115/148‑1 (MQ=255) ttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGcc > 2:433647/1‑151 (MQ=255) ttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGcc > 1:78829/1‑151 (MQ=255) ttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGAATTTTAgcg > 2:971656/1‑149 (MQ=255) ttttttttTCATGAAATTTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCAAG‑AACAGGTTAGATATTTTTTTTGTCGT‑TTAAT‑GCCTGAAAAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCata < 1:220891/146‑1 (MQ=255) aTTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt > 1:776005/1‑151 (MQ=255) ttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgc > 1:63936/1‑151 (MQ=255) taaaaTCTTTTTGCTGCCAAAGCTTTTCCCAA‑AACAGTTTAAATTTTTTTTTTATCTC‑TAAAT‑CCCT‑TAAAACAATGCATGAGCC‑AAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgc < 2:325157/144‑1 (MQ=255) ttcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 2:437114/1‑151 (MQ=255) tcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:749006/1‑150 (MQ=255) tcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:247253/1‑150 (MQ=255) tcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc > 2:754160/1‑149 (MQ=255) cgaaggctttttCAAA‑AAGAGTTTAGATTATTTTTTTGTCTT‑TAATT‑CCCTTAAAAAC‑TTGAAGGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAACCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAt < 2:126252/140‑1 (MQ=255) cacaggtttttCCAAAAACAGGTTAAATAATTTTTTTTTCG‑‑TTAATCGCTTAAAAAAC‑TTGAATGCCCC‑AAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg < 2:822043/144‑1 (MQ=255) cAAGCTTTTTCCAG‑AACAGTTTAGATGATCTTTTTTTCGT‑TAAAG‑GCCTGAAAAAC‑ATGAATGAGCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgt < 1:146988/150‑1 (MQ=255) ttttCCAG‑AACCGGTTATCTTTTTTTTTTGTTGC‑ATATT‑CCCTATAAAAC‑AGGCAGAACCC‑ACAAAATAATAAAAAAAGTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTa < 1:1037238/149‑1 (MQ=255) ttttCCAG‑AACAGTTAAGATGATTTTTTTGCCGC‑TTAAT‑GCCTGAAAAAC‑ATGAATGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTaa < 1:1145729/150‑1 (MQ=255) ttttCAAG‑AACGGGTTAGATATTTTTTTTTTCCT‑TTAAT‑GCTTAAAAAAC‑TTGCATGACCA‑AAAAAATAAAAAAAAAACCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTaa < 2:604886/150‑1 (MQ=255) ttttCAAA‑AACAGTTTAGATGATTTTTTTTTCGT‑TTATG‑GCCTGAAAAAC‑TTGTATGAGCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCgg < 2:325432/147‑1 (MQ=255) caag‑aagaGTTTAGAGGTTTTTTTTG‑CGCATTACC‑GCATGTAAACA‑ATGCAGGAGCA‑AAAAAATAATATAAAAAGGCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAg < 1:99792/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAGAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTg < 1:378173/151‑1 (MQ=255) aaCAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTg > 2:361434/1‑151 (MQ=255) ttAGATGATTTTTTTGTCGT‑TTAAT‑GCCTGAAAAAC‑ATGCATGAACC‑AAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt < 1:30164/149‑1 (MQ=255) aGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAGATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 2:211023/1‑147 (MQ=255) atgatTTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGAAAAAC‑ATGCAGGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGAtt < 1:1228089/149‑1 (MQ=255) tttttttGTCGT‑TTATT‑GCGTGAAAAAC‑ATGTAT‑AGCCAAAAAAAAAATAAAAAAATCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTa < 2:853422/145‑1 (MQ=255) tttttttGTCGT‑TAAAT‑GCTTTAAAAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGAttt < 1:252341/144‑1 (MQ=255) tCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 2:164888/1‑151 (MQ=255) taaaT‑GCCTAAAAAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGa < 2:485172/147‑1 (MQ=255) tAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAAtt > 2:630052/1‑151 (MQ=255) t‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAat > 2:656654/1‑151 (MQ=255) cctaaaaaaC‑ATGCAGGACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAat < 1:414840/144‑1 (MQ=255) ccTGTAAAAC‑ATGCATGACCC‑AAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:296858/150‑1 (MQ=255) cTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg > 1:1153790/1‑151 (MQ=255) taaaaaaC‑ATACAGGGCCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat < 2:572425/146‑1 (MQ=255) gaaaaaa‑aTGCATGCGCC‑AAAAAAAAATATAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:654713/145‑1 (MQ=255) gTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 2:616284/1‑150 (MQ=255) tAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCa > 1:684156/1‑150 (MQ=255) aaaaC‑ATGCATGAGCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTaa < 1:823606/143‑1 (MQ=255) aaaacagcaatgACCC‑AAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaa < 1:607081/141‑1 (MQ=255) c‑atgcatgAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTCTGAATTAATATGCAAATaa > 1:1169608/1‑150 (MQ=255) atgaatgaCCC‑AAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 1:293571/151‑1 (MQ=255) gcatgAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 1:1070864/1‑151 (MQ=255) catgAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 2:138760/1‑150 (MQ=255) tgAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag > 1:77344/1‑150 (MQ=255) gAGCA‑AAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 2:818882/149‑1 (MQ=255) ccc‑AAAAAATACTAAAAAAAACTCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgttagtga < 2:530662/149‑1 (MQ=255) | TGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAG‑AACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGC‑TTAAT‑GCCTGTAAAAC‑ATGCATGAGCC‑ACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGA > NC_000913/29343‑29631 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |