Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 869,107 | 0 | A | G | 43.1% | 81.2 / 15.5 | 59 | I530V (ATT→GTT) | gsiA | glutathione ABC transporter ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/28); new base G (25/0); total (31/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.35e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATCCAAAAGTGATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCGC > NC_000913/868960‑869251 | aaTCCAAAAGTGATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTa < 2:762626/151‑1 (MQ=255) aaTCCAAAAGTGATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGAGGTAGAGAGGagt > 2:330552/1‑148 (MQ=255) aaGTGATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCg < 1:1171621/151‑1 (MQ=255) gATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGGGGGGTAGTCATCgtgt > 1:607019/1‑150 (MQ=255) gATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCgtgt < 1:322497/150‑1 (MQ=255) tGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGGTAATCATCGCGTTGC‑gg > 1:92570/1‑149 (MQ=255) ccGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAt < 1:723151/151‑1 (MQ=255) ccGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGTCATCGTGTGGC‑gggg > 1:48570/1‑147 (MQ=255) cgacgaAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑g < 2:168162/151‑1 (MQ=255) gacgaAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGTCATCGTGTGgg‑ggggg > 1:346191/1‑145 (MQ=255) gaAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTTGTCATCGTGTGGC‑GGTgggt > 1:1132546/1‑144 (MQ=255) gCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑g < 2:25592/151‑1 (MQ=255) gCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑g < 2:684340/151‑1 (MQ=255) ccGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑gg < 2:21603/151‑1 (MQ=255) gTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGGGAGGGGGGTAGTTATTGTGTGGC‑GGGGgt‑‑gttgctctg > 1:715533/1‑142 (MQ=255) tCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGCCATCGTGTGGC‑ggggggggttttcggg > 2:311428/1‑133 (MQ=255) cGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGc < 2:1244682/147‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGAGTTATCATCGGGTGGC‑GGGTGT‑‑GT‑A‑TT‑T‑T‑GGGGaaa > 1:135129/1‑150 (MQ=255) cTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGGGGGGGGGTTTGTCATCGTGTGgg‑gggggtgggttttggg > 2:525932/1‑127 (MQ=255) tGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTTGTCATTGGTTGGG‑GGGGAT‑‑GTGT‑TT‑T‑C‑GGGCAAAtatt > 2:896067/1‑146 (MQ=255) aTGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTTGTCATCGTGTGGC‑GGGGGT‑‑GT‑T‑TT‑TCC‑GGGGAAAtttt > 2:891179/1‑144 (MQ=255) aTGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAACGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGTGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGa < 2:1129873/148‑1 (MQ=255) tGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGC‑GGGGGT‑‑GT‑A‑TT‑TCC‑GGGCAAAtgttttaa > 1:945030/1‑142 (MQ=255) gTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGATTTGTTATCGTGTGGC‑GGGGGT‑‑GT‑A‑TC‑T‑CGGGGGAAATTTTTGA‑AAt > 1:1169005/1‑150 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTTGTCCTCCTGTGgg‑gggggtgggttt > 2:867682/1‑117 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTc < 2:8268/148‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGAGGTAGGGGGGGTTTGTCATCTGGTGGG‑GGGGATAGGT‑A‑TC‑T‑‑‑GGGGAAATTTTTTA‑AAtttttccc > 2:835303/1‑145 (MQ=255) cgcgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGgc < 1:455423/151‑1 (MQ=255) cgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTTGTAGAGCGGGTTTGTCATCGTGTGGG‑GGGGGG‑‑GT‑ATTC‑T‑C‑GGGAAAAtttttttatttgtgccc > 2:96151/1‑134 (MQ=255) cgGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGTCATCGGGTGGG‑GGGGGG‑‑GG‑A‑TT‑TCC‑GGGGAAATTTTTGA‑AATTgtgccc > 1:708845/1‑141 (MQ=255) gggCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGC‑GGGGGT‑‑TT‑A‑TT‑T‑CGGGGCAAATTTTTTA‑AATTgtgccc > 1:544234/1‑140 (MQ=255) aTTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTTATCGGGTGGG‑GGGGGT‑‑GT‑A‑TT‑TCC‑GGGGAAATTTTTGA‑AATTG‑TTCCCCg > 1:1150088/1‑141 (MQ=255) aTCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTc < 1:1002145/150‑1 (MQ=255) ttgCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGCATAGGCATCGCGTGGC‑GGGGTT‑‑GT‑G‑TG‑T‑CGGGGGAAATGGTTTA‑AA‑TG‑GTCCCCGGCCCC‑C‑gggttttcggaa > 1:25780/1‑136 (MQ=255) tgCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGCGGGGGTT‑‑GT‑T‑TT‑C‑G‑GGGCAAAATTTTGA‑AATTG‑GTCCCCGGGGGG‑G‑GGGT‑TCCGAAAAccc > 2:50527/1‑149 (MQ=255) tCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTTGAGCGGGTTAGTTATCGTGTTGC‑GGGGGG‑‑GT‑T‑TCTT‑T‑GGGGAAATT‑TTGAGAATTGTGTACAGGGCGCG‑G‑GGTT‑TTCAAAAcccc > 2:463219/1‑147 (MQ=255) cGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCgcagca < 1:697515/150‑1 (MQ=255) aTCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGGGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTTTGGC‑GGGGGG‑‑GT‑A‑TT‑TCC‑GGGGAAATTTTTGA‑AATTGTGCCCCCGGCGCG‑G‑GGTT‑TTGAAAAAcccaccccac > 2:477980/1‑144 (MQ=255) ccAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCtt < 1:465824/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCt < 1:687314/148‑1 (MQ=255) ccAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGTTAGTCATCGTGTGGC‑GGGGGT‑‑GG‑A‑TC‑TCC‑GGGGAAATTTTTTA‑AATT‑‑GTCCCCCGCGCG‑C‑GGGCTTTCGAAAAaccccgcaatcct > 1:445930/1‑139 (MQ=255) ccAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGGGGTAGAGCGGGTTTGTTATCCTGTGGG‑GGGGGT‑‑GT‑T‑TT‑TCC‑GGGGAAATTTTTGA‑AATT‑‑GTCCACCCCGCG‑CGGGGT‑TTCGAAAAccccccccctc > 2:1105468/1‑139 (MQ=255) cAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGTCATCGGGTGGC‑GGGGGG‑‑GG‑A‑TC‑TCC‑GGGCAAATGTTTGA‑AATTG‑GTCCCCGG‑GCG‑C‑GGGCTTTCGAAAAcccccgcaacccttt > 1:629519/1‑138 (MQ=255) cAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGGGGGTTAGTCATCGGGTGGC‑GGGGAG‑‑GT‑A‑TT‑C‑T‑GGGCCAATTTTTTT‑AAATA‑GTCCACCGCCCGCC‑GGCT‑TTGGAAAAcccccgccccc > 1:1112053/1‑138 (MQ=255) atgtCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTaa < 1:321200/148‑1 (MQ=255) aTTTCGGCATTGCTTATCTGTTTAACTCCCACGCGATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑G‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCTTCCTTATACGCGTa < 2:127463/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAAtt < 1:730369/150‑1 (MQ=255) ggCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTAc < 2:729860/151‑1 (MQ=255) tGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGGGGTAGAGAGGGTTAATCATCGTGTGGC‑GGCGGG‑‑TT‑G‑TT‑T‑CGGGGAAAATTTTTTA‑ATTTG‑TTCCAC‑GCGCG‑CGGGCC‑TTCG‑AAACCCCCAGCATTCCtataagacggaaataatt > 2:971989/1‑134 (MQ=255) gCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTggcgg < 2:798958/151‑1 (MQ=255) gCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTggcg < 2:603262/150‑1 (MQ=255) gTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTcc < 2:346176/150‑1 (MQ=255) tATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGt < 1:910199/150‑1 (MQ=255) aTCTCCCACGATATGGCGGTGGGAGAGCGGGGTAGTCATCGTGTGGG‑GGGGGT‑‑GT‑T‑TT‑T‑C‑CGGGGAAATGTTTT‑AAATG‑GTGCACCGCGCG‑C‑GGGG‑TTTGTAAAACCCCCGCAACCTTTTTAGCGGAAAATACTtgcggccggttccg > 2:166009/1‑140 (MQ=255) cccACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTg < 2:771904/150‑1 (MQ=255) ccACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGaa < 2:1132568/151‑1 (MQ=255) gATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGAACCGt < 1:525953/151‑1 (MQ=255) atatGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGAACCGTc < 2:204624/151‑1 (MQ=255) agCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCGc > 1:490606/1‑150 (MQ=255) gCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGGAACGTCCCGACAACGAcc > 1:472275/1‑147 (MQ=255) | AATCCAAAAGTGATCATTGCCGACGAAGCCGTTTCGGCGCTGGATGTTTCTATTCGCGGGCAGATTATCAACTTGTTGCTCGATCTCCAGCGTGATTTCGGCATTGCGTATCTGTTTATCTCCCACGATATGGCGGTGGTAGAGCGGATTAGTCATCGTGTGGC‑GGTGAT‑‑GT‑A‑TC‑T‑C‑GGGCAAATTGTTGA‑AATTG‑GTCCACGGCGCG‑C‑GGTC‑TTCGAAAACCCGCAGCATCCTTATACGCGTAAATTACTGGCGGCAGTTCCGGTCGCTGAACCGTCCCGACAACGACCGC > NC_000913/868960‑869251 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |