| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,258,974 | 0 | T | G | 40.5% | 146.4 / 17.2 | 75 | G411G (GGT→GGG) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/40); new base G (30/0); total (35/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.89e-17 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTG > NC_000913/4258824‑4259120 | aaCCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGt < 1:302810/151‑1 (MQ=255) tCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGGGGCCGCCGCAGGGTTTg > 2:1189919/1‑146 (MQ=255) cagcagCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGGTGGCC‑CCCCAGGGTTTgcg > 2:969719/1‑147 (MQ=255) cagcagCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTg < 1:846755/150‑1 (MQ=255) cagcagCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGGTGGCGCCGCAGGGTTTgcg > 2:1217334/1‑147 (MQ=255) agcagcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGAc < 1:656347/151‑1 (MQ=255) agcTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCCCAGGGTTTGCGCTGAc > 1:762382/1‑148 (MQ=255) gctggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTTACGCTc > 1:382863/1‑151 (MQ=255) tggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCCCCCCAGGGTTTGTGGTGACGCTcc > 2:165044/1‑150 (MQ=255) ggctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCtt < 1:1232382/151‑1 (MQ=255) gctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTa < 1:231431/151‑1 (MQ=255) ctgACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCCCAGAGTGTGCGCGGTCGCTCCtttc > 2:1196511/1‑149 (MQ=255) gACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGc < 1:762770/151‑1 (MQ=255) aCCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCt < 1:217942/151‑1 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCCGGGTTTGCGGTGCAGCCCCTTACGCCTCCGTGGGTg > 2:1105151/1‑151 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTgg < 2:716297/148‑1 (MQ=255) tatctGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTgg < 2:978048/148‑1 (MQ=255) ggCGGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTaa < 2:435766/151‑1 (MQ=255) ggCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGt < 2:520231/149‑1 (MQ=255) ggCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTaa < 1:134753/151‑1 (MQ=255) cAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGaa > 1:418508/1‑149 (MQ=255) aGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCa < 2:148426/151‑1 (MQ=255) gTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATg < 1:109654/151‑1 (MQ=255) aTTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCtt < 2:457830/151‑1 (MQ=255) aTTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCCGCCGGGGCTGGGGAATCaatctt > 1:1023171/1‑146 (MQ=255) ttttGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCttt > 1:827165/1‑151 (MQ=255) tttGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCttt < 1:133204/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTtgtg < 1:848752/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCGGGGTTTTGGCTGACGCTCCCTACGCTCGCGTGGGTGGGGAAACATGCttt > 2:807992/1‑146 (MQ=255) ggtggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggc‑t‑g < 1:1194624/151‑1 (MQ=255) ggtggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggc‑t‑g < 1:922542/151‑1 (MQ=255) gtggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCGGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTTCCGTGGGTGGGGAATCATGCTTTGtggc‑t‑gg > 1:644899/1‑151 (MQ=255) ggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggc‑t‑ggc < 2:115987/150‑1 (MQ=255) ggtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGtggc‑t‑ggaa < 2:507386/151‑3 (MQ=255) gtTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCGCCGGGTTTGCGCCCACGGCCCTTACCCCGCCCTGGCTGGGGAATCATTATTTTtgggcg > 2:920413/1‑144 (MQ=255) tGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCCGGGTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGGGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGGAtt > 2:801032/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCAtt < 1:195545/150‑1 (MQ=255) ggTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCt < 1:653523/150‑1 (MQ=255) ggTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGAGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCtt < 2:814184/151‑1 (MQ=255) gtgtTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCttt < 2:864510/151‑1 (MQ=255) tgtTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCCCAGGGTTTGCGCTGACGCCCCTTACGCTGTCGTGGGTGGGGAATCAAGCTTTTTGGG‑T‑GGGATTTAccccccttt > 2:1003783/1‑144 (MQ=255) tATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGGGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGC‑T‑GGGCTTTACCGGCTTTCttg > 1:403943/1‑149 (MQ=255) tgctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTTTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTgg > 1:561541/1‑147 (MQ=255) gctgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGtt < 1:469259/150‑1 (MQ=255) tgGACGGCATGTTTATAGGCGCAACACGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTTGCCGACGCGGGGTTTACGCTGATTCTCCTTACGCCGGCTTTGCGGGGTGATCATACGTTTTTGC‑T‑GGCATTTAACATCttttttacgtt > 2:284119/1‑140 (MQ=255) ggACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTgcg < 1:66023/150‑1 (MQ=255) cGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCggg < 1:178080/151‑1 (MQ=255) aggCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCCCAGGGTTTGCGGCGGAGCTCCTTTCGCTGCCGGGGGCGGGGAAATATGCTTTTTTGG‑G‑GGGATTAACCGGCTTTCttggggttggcggg > 2:737795/2‑138 (MQ=255) cATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCGCCGGGTTTTTGCTGACGCTCCCTACGCTGCCGGGGCTGGGGAATTATGGTTTTTGGT‑T‑GGGATTTAACGTCTTTCTTGGGttttgggggggt > 2:399138/1‑141 (MQ=255) aTGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCCCAGGGTTTGCGCTGTCGCTCCTTTCGCTGCCGCTGCTGGGTAATCATGCTTTTTGGC‑T‑GGCATTAAACGTCTTTTTTGCGTTTTGCGGGCttt > 1:214929/1‑151 (MQ=255) tGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGGTTTGTGCTGGCGCCCCTTACGCTGCCCAGGGTGGGTAAACCATCTTTTTTGG‑G‑GGCATTTACCGGCCTTTTTGGGTTGCGCGGGCttt > 2:1237368/1‑150 (MQ=255) ttATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCGCCGCAGGGTTTGCCGTGACGCTCCCTACGCTGCCGGGGGCGGGGAATCATGCTTTTTGGC‑TGGGCTTTAACGCTCTTT‑TTGCGTGTCGCggggatt > 2:767135/1‑143 (MQ=255) aGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTggc < 2:1054446/150‑1 (MQ=255) aGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCCCCGCTGGGTTTGCGCTGGCCCGCCCTACGCGGTCGTGGGTGGGGAAGCCTTGTTTTTGGCAT‑GGCCTT‑ACCCTCTTTTCGGCGttttccggggtttttc > 1:685075/1‑132 (MQ=255) aaCGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTAt < 2:465316/150‑1 (MQ=255) aaCGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATc < 2:570798/151‑1 (MQ=255) aCGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCt < 1:485469/151‑1 (MQ=255) cgcgTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGAGGCCGCCGCAGGGGTTTCGCCGACACCCCTTACACTGCCGTGGGGGGGGGATCAGGCCTTGTGGC‑T‑GGCATTTACAGCCCTTTTGGCGGTGTGCGGGGTTTCTCTggcgggtg > 2:740322/1‑144 (MQ=255) tGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCCCCGGGTTTGCCCTGACGCTCCTTTCGCCGCCCTGGCTGGGGAAACATGCTTTTTGGG‑T‑GGGATTTACCCTCTTTCTTGCGGTGCGCGGGGCTTTTCTGGCGGCGATTTtgcgg > 2:274935/1‑151 (MQ=255) gCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggcgg < 2:119910/150‑1 (MQ=255) gCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggcgg < 1:200092/150‑1 (MQ=255) gCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCCGACGCCCCTTACGCCGCCGTTGCCCGGCAATCATGCCTTTTGGC‑T‑GGTATTTAACGTCTTTCTGGCGGTTCCTGGGCCTTCTTTGGCGGGTATCTagcgg > 1:603114/1‑150 (MQ=255) ccACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGgcggcg < 2:1109940/151‑1 (MQ=255) cACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTggcgg < 2:704797/148‑1 (MQ=255) ccGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCCGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGGAATCATGCTTTTTGGG‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTTGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTTgcggcg > 2:730825/1‑148 (MQ=255) aaaTGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTg < 1:515348/151‑1 (MQ=255) aaTGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGGCCCCGCAGGGTTTTCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGGTGGGGAAACATGGTTTTTGGC‑T‑GGGATTAAACGTCTTTTTGGCGGTGCGCGGGGTTTTTCTGGCGGCTCTCTTGCGGCGTCCCttg > 2:582714/1‑149 (MQ=255) tGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCCCCGGTTTTGCGCCGGCGCTCCTTTCCCTGCCGGGGGTGGGGTATCATGCTTTGTTGC‑G‑GGCATTTACCCGCTTTCTGGCGTTGCGCGGGGCTTCTTTTGCGGCTTTTTtgcgggggcc > 2:814591/1‑140 (MQ=255) 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gccgccGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCg < 1:935219/151‑1 (MQ=255) ccgccgCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGc < 1:1217319/151‑1 (MQ=255) aGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTg > 1:323390/1‑150 (MQ=255) | AACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGC‑GGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGC‑T‑GGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTG > NC_000913/4258824‑4259120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |