Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,903,155 | C→T | G183S (GGC→AGC) | bglB ← | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,903,155 | 0 | C | T | 98.3% | 225.3 / NA | 60 | G183S (GGC→AGC) | bglB | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (27/32); total (28/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAACCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCCCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAACCGCCGTAGTTTTTC > NC_000913/3903008‑3903300 | aaaCCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCg < 2:852667/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTg < 2:676775/151‑1 (MQ=255) aaCCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTg < 2:614136/151‑1 (MQ=255) aCCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTg > 1:1240354/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGaa < 1:481704/151‑1 (MQ=255) ccAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGaa < 2:395943/151‑1 (MQ=255) cAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGaa > 2:1088915/1‑150 (MQ=255) gCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATgg < 1:774088/151‑1 (MQ=255) gCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATg > 2:1063289/1‑150 (MQ=255) cACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGgcgc > 1:1015984/1‑151 (MQ=255) ccGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCgt < 2:729422/151‑1 (MQ=255) agaAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCgtgt > 1:496221/1‑150 (MQ=255) aaGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAAc > 2:1170985/1‑151 (MQ=255) gCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGa < 2:258210/151‑1 (MQ=255) gCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGa < 2:21150/151‑1 (MQ=255) atTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGTTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAGCTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATg < 2:93552/151‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATg < 2:182715/150‑1 (MQ=255) gATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGAtt > 2:1239280/1‑151 (MQ=255) tttCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGATGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTc < 2:463649/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCAtt > 1:1034818/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTGCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTa < 2:412647/151‑1 (MQ=255) gCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTa > 1:453024/1‑150 (MQ=255) tCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAAc < 2:453012/150‑1 (MQ=255) tCGGGAAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTaaa < 2:669047/149‑1 (MQ=255) cGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACg > 2:63314/1‑150 (MQ=255) cAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCAt > 1:967292/1‑151 (MQ=255) ggCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATaa < 1:16532/151‑1 (MQ=255) gCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAAc < 2:973797/151‑1 (MQ=255) cTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACg > 2:551630/1‑151 (MQ=255) tGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGcc > 2:273387/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACtt > 2:1062356/1‑151 (MQ=255) tAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGtt < 2:511952/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTgg < 1:1152695/151‑1 (MQ=255) aaCTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTAATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTgg < 1:140501/151‑1 (MQ=255) cTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGt > 1:815712/1‑150 (MQ=255) cgcgCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAg < 1:568008/151‑1 (MQ=255) cAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGt < 1:512824/151‑1 (MQ=255) aCCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGc < 1:90726/151‑1 (MQ=255) ccAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGc < 2:1015985/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCg < 1:148391/151‑1 (MQ=255) ggtggATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATg < 1:866553/151‑1 (MQ=255) ggATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTc < 2:899452/151‑1 (MQ=255) cTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTg > 1:128553/1‑150 (MQ=255) cTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGAAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTg > 1:31184/1‑150 (MQ=255) aaaCTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGACAGCCCCACGCCCGGGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGa > 2:736681/1‑150 (MQ=255) ccGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGc < 2:1082390/151‑1 (MQ=255) cGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGc > 2:497863/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCg < 1:198360/151‑1 (MQ=255) cTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCg > 1:1192655/1‑150 (MQ=255) tCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGAt > 1:793580/1‑151 (MQ=255) cGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGAtt < 2:929028/151‑1 (MQ=255) cGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGAt < 2:851033/150‑1 (MQ=255) gCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCTCGTGTAACGTCATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGGGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGAtt > 1:553175/1‑150 (MQ=255) gCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTa < 1:882561/151‑1 (MQ=255) cACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGCAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGc > 1:237796/1‑151 (MQ=255) aCTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGcc > 2:170946/1‑151 (MQ=255) tcttctGCCAGCCCCACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAAc > 1:530709/1‑151 (MQ=255) ccACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAACCGCCGTAGttttt > 1:70501/1‑151 (MQ=255) ccACGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAACCGCCGTAGttttt > 2:1029851/1‑151 (MQ=255) aCGCTCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAACCGCCGTAGTTTTTc > 2:674668/1‑150 (MQ=255) | AAACCAGCCCACCGAGAAGCATATTGCCGATTTTCGCTTCGGGGAGCAGGCTATGACAGGCTTTAACTGCCCGCGCACTGGCAACCAGTTGATGGTGGATAGCCTGATAAACTTCCGCCTCGCCACTCTCTTCTGCCAGCCCCACGCCCGTGAATGGCGCGTGTAACGACATGTTGATTTCATTAAACGTCAGCCATAACGCCACTTTATGTTGGTAGCGAGTAAAGACCGTGCGGGCGTAATGCTCGAAGTGATCGATGACCGCTCGATTAGCCCAACCGCCGTAGTTTTTC > NC_000913/3903008‑3903300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |