Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 736,382 | T→C | intergenic (+163/‑63) | ybfC → / → ybfQ | putative secreted protein/pseudogene, H repeat‑associated protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 736,382 | 0 | T | C | 99.0% | 369.4 / NA | 97 | intergenic (+163/‑63) | ybfC/ybfQ | putative secreted protein/pseudogene, H repeat‑associated protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (45/51); minor base A (0/1); total (45/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
AAAACAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGTCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGAT > NC_000913/736234‑736528 | aaaaCAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCt > 2:1187119/1‑151 (MQ=255) aaaaCAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCt > 1:255350/1‑151 (MQ=255) aaCAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTaa < 1:748183/151‑1 (MQ=255) aCAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTaaa < 2:443833/151‑1 (MQ=255) cAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAg < 1:524314/151‑1 (MQ=255) aaaTTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGc < 1:914845/151‑1 (MQ=255) aaaTTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGc > 1:314282/1‑151 (MQ=255) tAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGtt > 2:881172/1‑151 (MQ=255) tAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGt < 1:862953/150‑1 (MQ=255) aaTCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGttt > 1:511868/1‑151 (MQ=255) tCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGttttt > 2:1195425/1‑151 (MQ=255) cATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGTGAAAGATCACGTAACGCTTCTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTGAACATTTGAGATCCTACCTATTGCCTCAAGCTGCTGTTc < 2:657254/151‑1 (MQ=37) cATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTc > 2:267740/1‑151 (MQ=255) aTTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTc > 1:184157/1‑150 (MQ=255) tgAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGc > 1:248519/1‑151 (MQ=255) aaaaaTTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCtt < 1:75825/151‑1 (MQ=255) aaTTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTtata < 1:823229/151‑1 (MQ=255) atataACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATg < 1:203725/151‑1 (MQ=255) tataACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATg > 2:30411/1‑150 (MQ=255) ataACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGAt < 1:956194/151‑1 (MQ=255) ataACGCATGGAATCAGTTATTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGATATATGACGTAACGCTACTTTTTTGTTCTAAGTAATTCGAATTTTAAGGTCAACAATTGGGATACTACTTATTCACTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACAtttt < 2:822495/151‑4 (MQ=18) aaCTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATc > 2:706844/1‑150 (MQ=255) aaCTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCa < 1:192028/151‑1 (MQ=255) aCTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCa > 1:10714/1‑150 (MQ=255) cTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCaa > 1:148764/1‑150 (MQ=255) cATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAAt < 2:405437/150‑1 (MQ=255) aTGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATAc > 2:764073/1‑151 (MQ=255) ggAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACt < 1:1101978/150‑1 (MQ=255) ggAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACt < 1:37639/150‑1 (MQ=255) gAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTcc > 2:362176/1‑151 (MQ=255) gAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTcc > 1:1155856/1‑151 (MQ=255) aGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTa < 2:445000/150‑1 (MQ=255) aGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTa > 2:1220754/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTa < 1:925598/150‑1 (MQ=255) aGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTAc > 1:950978/1‑151 (MQ=255) gtgtTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACat > 1:70732/1‑151 (MQ=255) gtTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACata < 1:270246/150‑1 (MQ=255) ttATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataaa < 1:818959/150‑1 (MQ=255) tATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataaat > 1:41493/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataaata > 2:676749/1‑150 (MQ=255) ttttACATTCGATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataaataa < 2:255358/150‑1 (MQ=11) tGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTg > 1:247590/1‑151 (MQ=255) cGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGaa < 1:972477/151‑1 (MQ=255) ttCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAAc > 1:11237/1‑150 (MQ=255) tCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACa < 2:32310/150‑1 (MQ=255) aTTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATg < 2:723078/151‑1 (MQ=255) tGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGa < 1:846770/150‑1 (MQ=255) gCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGaa < 2:1097220/150‑1 (MQ=255) aaGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTaaaa > 1:12522/1‑150 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTaaaaaa < 2:1244926/151‑1 (MQ=255) aGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTaaaaaa < 1:997192/151‑1 (MQ=255) aTCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAAt < 2:143110/150‑1 (MQ=255) aaCGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGaa < 2:307529/151‑1 (MQ=255) aaCGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGa > 2:153267/1‑150 (MQ=255) aCGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAAc < 2:955270/151‑1 (MQ=255) aCGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAAc > 1:718864/1‑151 (MQ=255) cGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAAc > 1:553247/1‑150 (MQ=255) cGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACa < 2:108669/151‑1 (MQ=255) cGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACa < 1:359447/151‑1 (MQ=255) gCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACat < 1:217192/151‑1 (MQ=255) cTACTTTTCTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACat < 2:871712/150‑1 (MQ=255) aCTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATAtt > 1:1018529/1‑151 (MQ=255) tttttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTc < 2:452012/150‑1 (MQ=255) ttttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCt > 2:206625/1‑150 (MQ=255) tttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTAt > 2:530323/1‑151 (MQ=255) ttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTAtt > 2:354084/1‑151 (MQ=255) ttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTAtt > 2:102307/1‑151 (MQ=255) ttGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTAt < 2:153801/150‑1 (MQ=255) gTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTac < 1:475363/151‑1 (MQ=255) aCTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTacac > 2:1188384/1‑151 (MQ=255) aaaTAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCg < 2:827582/151‑1 (MQ=255) ataatTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGAt < 2:723842/151‑1 (MQ=255) taatTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGAtt > 2:483981/1‑151 (MQ=255) aatTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGAtt < 2:1011410/150‑1 (MQ=255) aatTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGAtt > 2:564267/1‑150 (MQ=255) atTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTAc < 1:723666/151‑1 (MQ=255) ttCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTAc > 2:168069/1‑150 (MQ=255) gAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGAc < 1:695948/151‑1 (MQ=255) gAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTG‑ACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGAc > 1:90072/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAAGAAGGTGAACAAATCGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACGCCCGATTACAGACa < 2:906049/151‑1 (MQ=255) aTTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTAAATAAATAAGTTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACAACCGATTACAGACa > 2:272704/1‑150 (MQ=255) ttttAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACa > 1:1216103/1‑149 (MQ=255) ttCAACAATTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGa > 1:381981/1‑150 (MQ=255) aacaaTTGAGATACTACCTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAg > 1:120159/1‑150 (MQ=255) acaaTTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAgtg < 2:8067/151‑1 (MQ=255) aTTGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAgtggtg < 2:664763/151‑1 (MQ=255) tGAGATACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGc < 2:165283/150‑1 (MQ=255) agaTACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATa < 2:732344/151‑1 (MQ=255) aTACTACTTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATaaa < 2:832921/151‑1 (MQ=255) actactTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAAtt < 2:950976/151‑1 (MQ=255) actTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTg < 2:841022/149‑1 (MQ=255) actTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTg < 2:480038/149‑1 (MQ=255) actTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTc > 2:434241/1‑151 (MQ=255) actTATTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTc > 2:578024/1‑151 (MQ=255) aTTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTc > 1:439858/1‑147 (MQ=255) aTTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTc > 1:404401/1‑147 (MQ=255) aTTGCCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGat < 2:504636/151‑1 (MQ=255) | AAAACAAATTAATCATTGTGAAAAATTATATAACTCATGGAATAGGTGTTTATTTTGCGTTCCATTTGCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTAAGTTCAACAATTGAGATACTACTTATTGTCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGAT > NC_000913/736234‑736528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |