| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,111,747 | 0 | G | T | 44.1% | 89.6 / 46.3 | 68 | N156K (AAC→AAA) | yiiQ | DUF1454 family putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/9); new base T (0/30); total (29/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCCAG > NC_000913/4111597‑4111894 | caAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttg > 2:849243/1‑151 (MQ=255) aaaGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttgt > 1:917083/1‑151 (MQ=255) aGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttgttt > 2:336768/1‑151 (MQ=255) aGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttgttt < 2:672052/151‑1 (MQ=255) gctttgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGttttt > 2:92376/1‑151 (MQ=255) gctttgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGttttt < 1:937090/151‑1 (MQ=255) tttgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑cc > 2:252639/1‑151 (MQ=255) tttgctttTTGTCACTTATTGAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCACCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑cc > 1:434920/1‑151 (MQ=255) ttgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑cc < 1:1037521/150‑1 (MQ=255) gctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCccg < 2:291698/151‑1 (MQ=255) tttttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCccgcc > 1:2150/1‑151 (MQ=255) ttttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCccgcc < 1:74416/150‑1 (MQ=255) ttttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCccgc < 1:1058655/149‑1 (MQ=255) tttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAACCGTTTCAACAGCGAAGGCCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATACCGCAGTGCACCTTCTGTCCCGGTGTAATAACGTTTGTTTTC‑CCccgccg < 1:316603/150‑1 (MQ=255) tttATTAAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCCCCAGCTTAATGGGTACAACAGCGAAGGTCACCCCCTTTT‑CGCTTTTTTCCGCGACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCGCGGTGTAATACTTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTtagtag < 1:471264/150‑1 (MQ=255) ttATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCg > 2:276892/1‑151 (MQ=255) ttATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCg > 2:815677/1‑151 (MQ=255) aTTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCTAc > 2:685696/1‑151 (MQ=255) tCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTg > 2:139390/1‑151 (MQ=255) cAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGc > 1:422816/1‑151 (MQ=255) cAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGc > 2:260534/1‑151 (MQ=255) aacccTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTACAACAGCGAAGGCCACCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGAAAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAACGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCa < 2:316031/148‑1 (MQ=255) cctaaaaGCGATTCAAATAGCGCCAGCTTAATCCGTTAAACCGCAAAGGTCACCCCTTTTC‑CGCCTTTGTCCGCAACAACACAACGCAGTGCACCTTCTTTCTCGGTTTAAAAACTTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt < 1:162859/146‑1 (MQ=255) ccTACAAGCTATTCAAATAGCGCCAGCTTAATCGTTACAACAGCGAGGGCCACCCCCTTTT‑CGCCTTTGCCCGCAACAACATACCGCAGTCCCCTTTCTGTCTCGGTTTAAAAACTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGt < 1:207619/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCGTTTCAGAGACCCCCATCTTAATCGTTACAACAGCGAAGGCCCCCCCTTTTC‑CGCGGTTGTCCGCGAAAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTGGGTGAAATAACGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGt < 1:252581/148‑1 (MQ=255) ttCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtttt > 2:1080161/1‑151 (MQ=255) ttCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtttt > 1:405701/1‑151 (MQ=255) aaGCAATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGCCACCCCTTTTC‑CGCCGTTGTCCGCGAAAACATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTGTAATAACTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt < 2:964323/146‑1 (MQ=255) gCGATAAAGATGCCGCCATTTAAATCGTTACAACAGCGAAGGCCGCCCCTTTTT‑CGCCTTTCTCCGCGAAAACATAACGCGGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTTAATACCGTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTg < 1:424922/151‑1 (MQ=255) aTTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:1104862/1‑151 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCtt > 2:368134/1‑151 (MQ=255) tacAGATAGCCCCAGTTAAACCGTTTAAACAGCAAAGGCCAGCCCCTTTT‑CGCTTTGACCCGCAAAAACATAACGCATTCCACCTTCTGTCCGGGTGTAAT‑ACGTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt < 1:1057796/148‑1 (MQ=255) tagccccacttaaaTCGGTCCAACAGCGAGGGCCACCCCCTTTC‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTTTAATACCGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTgtgt < 2:518096/138‑1 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTg > 2:237964/1‑151 (MQ=255) ccccAGTTTAACCGGTTCAACAGCGAAGGTCACCCCCTTTT‑CGCCGTTGCCCGCGAAAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGCCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtt < 2:1170634/146‑1 (MQ=255) ccAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt > 2:893555/1‑151 (MQ=255) ttAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAtt > 1:304827/1‑150 (MQ=255) tCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgg > 1:780836/1‑151 (MQ=255) gtttaaaCAGCGAGGGCCACCCCTTTTC‑CGCGGTGGTCCGCGACAACAAACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATACCGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgggg < 2:1109633/146‑1 (MQ=255) gttccAACAGCGAAGGCCCCCCCCTTTT‑CGTCGTTTCCCGCAACAACATACCGCGTTGCCCCTTCTGTCTGGTTTTAAATGTTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAAt < 1:468576/143‑1 (MQ=255) ggtcaaacggcgaGGTCCACCCCTTTTCCGCGTTTGCCCGCAACAAAAAACCGCGTTCCCCCTCCTGTCTGGTTGAAATACCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgggg < 1:1092807/139‑1 (MQ=255) agggccacccctTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGAAAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAGGTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGtgtg < 1:1029053/139‑1 (MQ=255) ggccAGCCCTTTTT‑CGCGGTTGCCCGCGACAAGATAGCGCATTTCCCCTTCTTTCTCGGTGTAATATGGTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc < 1:315643/148‑1 (MQ=255) cacccccTTTC‑CGCCTTTGCCCGCGAAAAAATAACGCAGTCCCCCTTCGGTCTGGGTGTAAAACCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAcc < 2:783102/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAcc > 1:540276/1‑151 (MQ=255) cAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAcc > 1:837528/1‑151 (MQ=255) ccccTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCg > 1:362882/1‑149 (MQ=255) ccccTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt > 2:327530/1‑151 (MQ=255) ccccTTTG‑CGCTGTTGCCCGGGAAAACATAGCGGAGTGCTCCTTGTCTCCGGGTGTATTAATTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCg < 2:435959/149‑1 (MQ=255) ccTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGc > 2:279937/1‑151 (MQ=255) ttt‑CGCCTTTGTCCGCGACAACATAACGCATTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATAACGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCa < 2:1025950/150‑1 (MQ=255) tccGCCGTTGTCCGCAACAACATACCGCTGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATACCGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCAt < 2:206091/148‑1 (MQ=255) gTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTg > 2:171872/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTCGGTTTAATACCTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGa < 2:129438/149‑1 (MQ=255) acaacaTAACGCAGTGCACCTTCTTTCTCGGTGTAATATCTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttc < 2:822253/150‑1 (MQ=255) acaacaTAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCACTGCCATGTATTCCTGAgctttcg > 1:657084/1‑151 (MQ=255) aacaTAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgct > 1:380980/1‑151 (MQ=255) aaaaaaccgcgGTGCCCCTTTGGTCTGGGTGTAATATCTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgct < 1:893350/144‑1 (MQ=255) aTACCGCGGTGCCCCTTCTGTCTCGGTGTAATACCTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctttc < 2:358648/151‑1 (MQ=255) aTAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTCGGTGTAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctttc < 2:493565/151‑1 (MQ=255) taccgcgGTGCCCTTTTTGTCTCGGTGTAATATTTTTTGTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt < 1:926186/145‑1 (MQ=255) accGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGAAATAACGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctttc < 2:310239/147‑1 (MQ=255) cAGTGCCCCTTCTGTCGCGGTGTAATACCGTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGc < 2:1005805/150‑1 (MQ=255) 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gttttaatacttttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 1:747047/130‑1 (MQ=255) ggTGTAAT‑ACGTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTg < 1:939608/143‑1 (MQ=255) gtAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATg > 1:660928/1‑151 (MQ=255) aataaGTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATgg < 1:1050997/150‑1 (MQ=255) aataaCGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcc < 2:480288/141‑1 (MQ=255) atacttttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGt < 1:574537/145‑1 (MQ=255) ttttttttT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGt < 2:479177/145‑1 (MQ=255) ttttttttT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTa < 2:389326/146‑1 (MQ=255) tgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCTCCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCCAg < 2:949475/149‑1 (MQ=255) | CAAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCCAG > NC_000913/4111597‑4111894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |