Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,039,933 | T→C | L213P (CTG→CCG) | cbdB → | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,039,933 | 0 | T | C | 98.7% | 272.5 / ‑3.8 | 74 | L213P (CTG→CCG) | cbdB | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (33/40); total (34/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.93e-01 |
TGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCG > NC_000913/1039789‑1040078 | tgACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCtt > 2:40786/1‑151 (MQ=255) gACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCtt < 2:803521/150‑1 (MQ=255) gACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCtt < 1:277817/150‑1 (MQ=255) cGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCttttt < 1:474326/151‑1 (MQ=255) cGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCttttt > 2:5462/1‑151 (MQ=255) cGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCttttt > 2:1144286/1‑151 (MQ=255) gCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTg > 1:1111626/1‑151 (MQ=255) aTTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTg > 1:306200/1‑151 (MQ=255) tCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGc > 2:657085/1‑151 (MQ=255) ccTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCgg > 2:201273/1‑151 (MQ=255) ttGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTa > 2:94946/1‑149 (MQ=255) gtgCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTg < 1:1059004/150‑1 (MQ=255) gCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCt < 2:325930/151‑1 (MQ=255) ggATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCtgt > 2:930694/1‑151 (MQ=255) aTTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAATTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTgg < 2:3839/151‑1 (MQ=255) gCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGt < 1:831153/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCgg > 2:914143/1‑151 (MQ=255) cAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCg < 1:1105522/149‑1 (MQ=255) cAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCgg > 2:429288/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTa < 1:791627/151‑1 (MQ=255) ttGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTATTg > 1:159404/1‑150 (MQ=255) tGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGTATTg > 2:873119/1‑149 (MQ=255) gggATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGTCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATg < 2:999190/151‑1 (MQ=255) ggATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATgg > 1:285210/1‑151 (MQ=255) ggTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCtt < 1:102209/150‑1 (MQ=255) gTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg < 1:1165615/151‑1 (MQ=255) tttGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTTGGTTGGTATTGGAGGCTTTGTACt > 1:1053764/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGc < 2:520209/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCt > 1:1073918/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGATACTGGCTGTGGGTCGGTATTGAAGGCCTTGTACTGCTCGgcc > 1:379626/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTTGTGGCTTTGTACTGCTCGCCCCgggt > 1:440801/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAgg > 2:1084446/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGAt < 1:131318/151‑1 (MQ=255) gTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGAt < 1:585099/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGc > 2:172062/1‑151 (MQ=255) tGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCt > 2:10341/1‑150 (MQ=255) ggTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCt < 2:1098493/149‑1 (MQ=255) ggTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTa < 1:947332/150‑1 (MQ=255) aaCTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGttc < 1:360329/151‑3 (MQ=255) aaaaCTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCa < 2:69811/151‑1 (MQ=255) aCTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATc < 1:40775/151‑1 (MQ=255) aCTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTAATGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCCCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCaa > 2:746648/1‑149 (MQ=255) cgTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCg < 1:612782/150‑1 (MQ=255) tgtgATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACAGGCTGTGGGTAGGGCTTGTTGGCTTTGTACTGCTCCCCCAGGATGCTAAACGGCCTTCCAATTCggtga > 2:60693/1‑145 (MQ=255) gATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGaa < 2:647656/150‑1 (MQ=255) gATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGaa > 2:342233/1‑150 (MQ=255) aTTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAAc < 1:201227/151‑1 (MQ=255) aTCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACtgg > 2:1049509/1‑150 (MQ=255) gTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAg > 1:637699/1‑150 (MQ=255) gTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGGTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAg > 1:37001/1‑150 (MQ=255) ttCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAg < 2:46012/149‑1 (MQ=255) cacaGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGc < 2:286901/150‑1 (MQ=255) caGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTTATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATTCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTAc > 2:1153436/1‑151 (MQ=255) gCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCt < 2:283923/151‑1 (MQ=255) gCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGGCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGGAGTGCTACCt > 1:447524/1‑151 (MQ=255) ggCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTg < 2:285280/149‑1 (MQ=255) gACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGc < 1:794403/150‑1 (MQ=255) ccAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCt > 2:1129081/1‑150 (MQ=255) aaaCGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGa < 1:308859/151‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATg < 1:979858/151‑1 (MQ=255) cgcgCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGa < 2:213794/151‑1 (MQ=255) cgcgCTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTTCTCGCCCAGGATGCTAACGGGCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGAt > 1:1053428/1‑149 (MQ=255) gcTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaata < 2:555861/151‑1 (MQ=255) gcTGCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaa > 2:1027471/1‑149 (MQ=255) gCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaataat < 1:94921/150‑1 (MQ=255) gCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaataat < 1:10342/150‑1 (MQ=255) gCACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaataa < 2:1133885/149‑1 (MQ=255) cACTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAAttt < 1:1071676/151‑1 (MQ=255) aCTGTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGGGGGGCGGTATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACCGTCCTTCCAAACCGTTAATGAAACTTGTGGCAGGGCTACCTGGATCCTGGAGGAATAAtttt > 1:989673/1‑151 (MQ=255) gTTGGTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTg < 1:679308/149‑1 (MQ=255) ggTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGa < 1:930480/150‑1 (MQ=255) ggTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGa < 1:78118/150‑1 (MQ=255) gTGATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGt < 2:999554/151‑1 (MQ=255) gATGCCGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTTTCGAGTCg > 1:792699/1‑151 (MQ=255) | TGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATTGCTCAGCCTTGGGATGGTGATTTTGCAAGGTGGCGTCTGGTTACAACTGAAAACTGTTGGTGTGATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCG > NC_000913/1039789‑1040078 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |