Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,646,854 | C→T | intergenic (+117/+320) | flxA → / ← intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,646,854 | 0 | C | T | 100.0% | 262.4 / NA | 69 | intergenic (+117/+320) | flxA/intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/29); total (40/29) |
ATACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGC > NC_000913/1646706‑1647001 | aTACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGc > 2:335313/1‑151 (MQ=255) cATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTTGCCCTCATCGGACCACTTTTCGCCATCAGCATTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGCTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAg > 1:528923/1‑150 (MQ=255) cATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGt > 2:480893/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |