| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,228,275 | 0 | T | C | 44.8% | 54.1 / 13.3 | 58 | pseudogene (335/1287 nt) | mdtQ | pseudogene; putative channel/filament proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/7); new base C (12/14); total (37/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.51e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCT > NC_000913/2228128‑2228422 | tctTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTAC‑CGTTTCCCCCCCCCGTGT‑TTTAACCTTACCC‑CGCGGGGAG‑T‑AAACTc > 2:597123/1‑149 (MQ=255) tttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCG‑CG‑TTCCGCCCCCCCCGC‑TTTTACCCCACCCACGCGGGCAG‑G‑AAAccccc‑ccc > 2:685731/1‑150 (MQ=255) tttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCG‑CG‑TTCCCCCCCCCCTGC‑TTTAAACGTACCCCAGCGGGCAG‑T‑AACCCCCG‑ccc > 1:111230/1‑150 (MQ=255) ttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCg < 2:334183/146‑1 (MQ=255) cTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTTGCGGGTTTTCTCC‑CG‑GTCCCCCGCCCGTGC‑TTTTACCCGACCCAGGCGGGCGG‑T‑AACCTccc‑ccc > 2:299607/1‑147 (MQ=255) tATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCC‑CG‑GTTCCCCGCCCGTGC‑TTTTACCCGAACCCGGCGGGGAG‑G‑AAACCCCG‑ccccctt > 1:330131/1‑146 (MQ=255) ttGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCG‑CG‑TTCCCCCGCCCCCGC‑TTTTACCGCACCCCGGCGGGGCG‑T‑AAACTCCC‑CCCCATTCttt > 2:567680/1‑151 (MQ=255) ctgcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTTCTCG‑CC‑TTTCCCCCCCCCCGC‑TTTTAACGCACCCCGGCGGGGAG‑G‑AAACCCCC‑CCCCATTCTTTtcc > 2:122102/1‑151 (MQ=255) ctgcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCACCCAGCAACTGGCGGGCTTGCCCGCCG‑TTCC‑CCCCCCCTTC‑TTTAACCCTACCCACACGGGGAGTT‑ATCCTCCC‑CCGGGTTCTTTcc > 2:59692/1‑151 (MQ=255) gACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCG‑CG‑GTCCGCCCCCCCGGC‑TTTAAACGTACCCCGGCGGGGAG‑T‑AAACCCCG‑CCCCGTTTTTTTCCCCGat > 1:620972/1‑150 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCCCCGCCCGTGC‑TTTAAACGTAACCACGCGGGCAG‑G‑TAACTCCG‑CCCGATTCTTTtccccaat > 1:43837/1‑145 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCG‑CG‑TTTCGCCGCCCGGGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGGAG‑G‑AAACCCCG‑CCCCCTTCTTTTCCCCGata > 1:121768/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGatat < 2:32857/150‑1 (MQ=255) ccGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCG‑CG‑GTCCCCCCCCCCTGC‑TTTTACCCTACCCCCGCGGGCCG‑T‑AAACCCCC‑CCCCCTTCTTTtccc > 2:955780/1‑144 (MQ=255) cGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCG‑CG‑TTTCCCCGCCCCCGC‑CTTTACCCGACCCCAGCGGGCCG‑TAAACCCCCC‑CCCCATCTTTTcccccgt > 2:668717/1‑144 (MQ=255) aaCGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGGGC‑TTTAAACGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCC‑CCCGGTTTTTTCCCCCGATATCGAGATGcc > 1:1001181/1‑151 (MQ=255) aCGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTTCTCC‑CG‑GTCCCCCCCCCCTGC‑TTTTACCCTACCCCAGCGGGGAG‑G‑AAACCCCGCCCCCATTTTTTCCCCA‑ATATCCAGATGcc > 2:962062/1‑150 (MQ=255) cgccgcCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAg < 2:73533/151‑1 (MQ=255) gccgccTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGc < 2:182746/151‑1 (MQ=255) gccTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCCCC‑CG‑TTTCGCCCCCCCTGC‑TTTTACCGTACCCAAGCGGGCAG‑T‑AAACTCCC‑CCCCCTTTTTTTCCCCGATATCGAGATGCCAGccc > 1:268025/1‑150 (MQ=255) ttGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCCCCCGCGC‑TTTTAACGTACCCAGGCGGGCAG‑G‑AAACTCCC‑CCCCATTCTTTCCCCCGATATCGAGAAGCCAACccgcccgtaa > 1:815432/1‑145 (MQ=255) ttGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCC‑CG‑TTCCCCCCCCCCCGCTTTTAACCG‑ACCCCCGCGGGCAG‑G‑AAACCCCC‑CCCCCTTCTTTTCCCCGATATCCAGAAGCCCGcccccccgt > 2:192409/1‑145 (MQ=255) tGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTTCTCC‑CG‑TTTCGCCGCCCCCGC‑TTTTACCCTACCCCGGGGGGGCG‑G‑AACCCCCC‑CCCGGTTTTTTTCCCCCATATCGAGATGCCCGCCCCCCCTTaa > 2:240944/1‑149 (MQ=255) cTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTTCTCC‑CG‑GTCCGCCGCCCCTGC‑TTTAAACCGACCCCGGCGGGCCG‑T‑AAACCCCG‑CCCCGATCTTTTCCCCGATATCGAGATGCCAACCCCCCCTTTAGCCaa > 1:823239/1‑149 (MQ=255) tACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTGTCC‑CG‑GTCCGCCGGCCGTGG‑TTTTACCGGAACCCGGCGGGGAG‑G‑AAACCCCC‑CCCCAGTCTTTTCCCCGATAATCAGATACCCGCCCCCCGATTAACCaaaaagaac > 2:118309/1‑144 (MQ=255) aGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCCGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCCAAAGTACCgct > 2:379400/1‑147 (MQ=255) aGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCCGATATCGAGATGGCAGCCCGCCGGTTAGCCCAAAGTACCGTTgg > 2:513663/1‑151 (MQ=255) gCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGgtg > 1:719256/1‑151 (MQ=255) ggCTACGCTGCCAGCCAGCAATGGGGGGGTTTGCTCG‑CG‑TCCCCCCGCCCGTGC‑TTTACCCGTCCCCGGGGGGGAAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGTTTCTTCCCCAAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAc < 2:849786/151‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTCCCCGGGCGGGCAG‑T‑ACCCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACgg < 1:561624/150‑1 (MQ=255) cagccagcAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTTCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAACCAAGAGTACCGTTGGGGTACCACGGGCCgg > 2:674957/1‑150 (MQ=255) agcAATTGGCGGGGTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCg > 1:546549/1‑144 (MQ=255) gCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGcc > 1:712419/1‑151 (MQ=255) ggttttGCCGG‑CG‑TCCCGCCCCCGGTGT‑TTAACCCGTCCCCCGGCGGACAG‑A‑ACCCCCCC‑CCCAATTTTTTCCCCAGTTATCGAGACGCCGCCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCgg < 2:18026/144‑1 (MQ=255) cg‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCag > 2:775745/1‑149 (MQ=255) g‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc > 1:729540/1‑151 (MQ=255) ttCCGCCGCCCGTGC‑TTAACCCGTCCCCAGGCGGGAAG‑T‑ACCCCCCC‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCag < 2:79412/147‑1 (MQ=255) ccgccgCCCGTGC‑TTTACCCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCa < 1:514250/149‑1 (MQ=255) ccgccCGTGC‑TTTAACCGTCCCCAGGCGGGCAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACgg < 1:269819/151‑1 (MQ=255) ccgccCATGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACgg > 1:403388/1‑151 (MQ=255) cgccCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGc > 1:89913/1‑151 (MQ=255) gccCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc > 1:333951/1‑151 (MQ=255) gccCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc > 1:435750/1‑151 (MQ=255) tGC‑TTTACCCGTCCCCAGGGGGGCAG‑T‑ACCCCCCC‑CCCGATTCTTCCCCCAGATAGCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCa < 1:675589/149‑1 (MQ=255) tttACCCGTACCCTGCCGGGATT‑T‑ACCCCCCG‑CCCATTTTTTTCCCCAGAAATCGGGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTaa < 1:598211/150‑1 (MQ=255) tttAACCGTCCCCGGGGGGGCAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTaa < 1:571270/150‑1 (MQ=255) cccAGGGGGGCAG‑T‑CCCCCCCG‑CCCTTTTTTTCCCCCAGATATCGGGATGCAAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCg < 2:43834/151‑1 (MQ=255) cccAGGCGGGCAG‑A‑ACCCTCCG‑CCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGc < 1:63107/149‑1 (MQ=255) ggCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTGCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAt > 2:461709/1‑151 (MQ=255) cGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt > 1:448796/1‑151 (MQ=255) cGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt > 1:710564/1‑151 (MQ=255) gggCAT‑T‑ACCCCCCG‑CCCGTTTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt < 1:140221/150‑1 (MQ=255) gggCAG‑T‑ACCCTCCG‑CCCATTTCTTCCCCCATATACCGAGAGGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt < 2:542296/150‑1 (MQ=255) gggCAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt < 1:562385/150‑1 (MQ=255) gggCAG‑T‑ACCCCCCG‑CCCGATTCTTCCCCCAGATAGCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAtttt < 1:597183/151‑1 (MQ=255) gggAAG‑T‑ACCCCCCC‑CCCGATTCTTCCCCCAGTTATCGAGAGCCCGGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt < 1:272505/150‑1 (MQ=255) ggccAG‑C‑AACCCCCG‑CCCGTTTTTTCCCCCAGATTTCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAtttt < 2:671910/148‑1 (MQ=255) t‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCg > 1:242642/1‑151 (MQ=255) aCCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCt > 1:403062/1‑151 (MQ=255) | TCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCG‑CG‑TTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAG‑T‑AACCTCCG‑CCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCT > NC_000913/2228128‑2228422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |