Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 43.8% | 93.1 / 43.9 | 73 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/6); new base A (0/32); total (35/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.37e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGG > NC_000913/29346‑29645 | tttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAatat > 1:938421/1‑151 (MQ=255) tAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAAtata > 1:861585/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATaa < 2:1035650/150‑1 (MQ=255) aTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATaaa > 2:1000511/1‑150 (MQ=255) aTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATaaa > 2:793427/1‑150 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATccc > 2:79680/1‑151 (MQ=255) ttttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCg > 2:69909/1‑151 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAt > 1:824979/1‑151 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAt > 1:856704/1‑151 (MQ=255) ccATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAtt > 1:970800/1‑150 (MQ=255) tttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGt > 2:592130/1‑151 (MQ=255) ggTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTg > 1:40366/1‑150 (MQ=255) cttttttttCTGCTCGTTTTTATTACACGCATTCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTCCCAGAACAGGTTAGATAATTTTTTTGT‑CGC‑TTAATCCCTAA‑AAAA‑CATGCAT‑GACCCAAAAAAAAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACt < 2:128234/146‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtttt > 1:611230/1‑151 (MQ=255) ttttCTGCTCTTTTTTATTTAATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCTTGT‑AAAA‑CATGAAT‑GACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgc < 1:79684/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc > 2:770711/1‑150 (MQ=255) tcttttttATTTCATGAATTCTTCTGGCTGCGCAAGCTTTTCCAAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGT‑CGT‑TTAATGCCTGA‑AAAA‑CATGCAT‑GACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc < 2:401157/143‑1 (MQ=255) tCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtc > 1:443139/1‑151 (MQ=255) ttttttTCATGCATTCTTCTTGCTGCGAAAGTTTTTTCCAAAACAGGTAAGATTATTTTTTTGT‑CG‑‑TTAATTCCTTTAAAAA‑CATGCAT‑GACCCAAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCa < 2:584503/150‑1 (MQ=255) ttatttaacgaacttttcttGCTCCCCAAGC‑TTTTCCAAAAAAGGTTAAAATATTTTTTTGT‑TGCTTTAATG‑CTGA‑AAAA‑AATTGATGGACCAAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAg < 2:146509/135‑1 (MQ=255) aTTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt > 2:288913/1‑151 (MQ=255) tttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATg > 1:923757/1‑151 (MQ=255) cATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccg > 1:410355/1‑151 (MQ=255) aTGCATTCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGT‑CGT‑TTAATGCCTGA‑AAAA‑CATGAAT‑GACCAAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATg < 1:348057/147‑1 (MQ=255) gCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGccgccg > 1:616252/1‑151 (MQ=255) tgctgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGa > 2:338678/1‑150 (MQ=255) tgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt > 1:880046/1‑151 (MQ=255) gcgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc > 1:841465/1‑151 (MQ=255) cAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAACTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtc > 1:471420/1‑151 (MQ=255) aaGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg > 1:839640/1‑151 (MQ=255) gTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTa > 2:265953/1‑150 (MQ=255) ttttCAAAAACAGGTAAGATTTTTTTTTTGT‑CTC‑TTAATCCCTAA‑AAAA‑CAGGCAT‑GACCAAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTa < 2:873390/149‑1 (MQ=255) tttcCCAAAACGGTTTAAATTTTCTTTTTGT‑CGT‑ATAATGCTAAT‑AAAA‑CATGCCT‑GAGCCAAAAAATAATAAAAAAATTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg < 2:546493/146‑1 (MQ=255) aGAACAGTTTAGATGTTTTTTTTGT‑CGC‑TAAATGCCTGA‑AAAA‑CATGCAT‑GACCAAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc < 1:720828/146‑1 (MQ=255) gAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAttt > 2:842197/1‑151 (MQ=255) aacggtttAGATGATCTTTTTGT‑CGT‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAttt < 1:360735/144‑1 (MQ=255) aCAGGGTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 1:717500/1‑151 (MQ=255) gttaagttgttttttttGT‑CTT‑TTATTCCCTAA‑AAAA‑AATGCTT‑GAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAt < 2:851112/138‑1 (MQ=255) ggTTAGATGATTTTTTTTT‑CGT‑TTAATGCTTGA‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCAAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAt < 1:175811/150‑1 (MQ=255) ggTTAGATGATTTTTTTGT‑CTC‑TTAATGCTTGA‑AAAC‑CATGAAT‑GAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 1:934860/149‑1 (MQ=255) ttAGATGTTCTTTTTGT‑CGT‑TTAATCCCTAT‑AAAC‑CTTGCAT‑GACCCAAAAAAAAATAAAAAAACCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg < 2:104587/150‑1 (MQ=255) taagttgtttttttttT‑CGT‑TAAATGCTTGA‑AAAA‑CATGCAT‑GCCCCAAAAAATATTAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt < 1:818178/139‑1 (MQ=255) gtttaatttttttttGTCCGC‑CTAACTCCTGT‑AAAACCATGCGC‑AAGCAAAAAAATAATATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAGCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt < 2:594552/141‑1 (MQ=255) 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ttGT‑CTT‑TTAATGCCTAA‑AAAA‑AATGCAT‑GACCAAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatca < 2:752396/150‑1 (MQ=255) t‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgt > 2:380174/1‑151 (MQ=255) gC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg > 1:50378/1‑150 (MQ=255) tttaaagcccTGA‑AAAA‑CATGAAG‑GACCAAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtg < 2:568638/140‑1 (MQ=255) aaTGCCTGA‑AAAA‑CATGAAG‑GACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTa < 2:1024969/151‑1 (MQ=255) 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tgcag‑gAGCAAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATaaa < 1:871364/149‑1 (MQ=255) at‑gAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 1:63224/1‑149 (MQ=255) at‑gACCCACAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 1:1000557/147‑1 (MQ=255) aggaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 2:443117/142‑1 (MQ=255) tgaccaaaaaaaaaATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtga < 1:119660/141‑1 (MQ=255) cccAAAAAAAAATATAAAAACCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagt < 2:478784/143‑1 (MQ=255) caaaaaaaaaATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagtgt < 1:308834/145‑2 (MQ=255) acaAAAAAAAATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGaa < 1:506639/148‑1 (MQ=255) aaaaaaATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtc < 2:900965/151‑1 (MQ=255) aaaaTAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtc < 1:927164/151‑1 (MQ=255) aaaTAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtct < 2:616222/151‑1 (MQ=255) aaaTAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtct < 2:823240/151‑1 (MQ=255) taataTAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTg > 1:175821/1‑151 (MQ=255) tataAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg > 1:157553/1‑149 (MQ=255) ataAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAgg > 1:492340/1‑151 (MQ=255) | TTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGT‑CGC‑TTAATGCCTGT‑AAAA‑CATGCAT‑GAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGG > NC_000913/29346‑29645 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |