Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,578,143 | 0 | A | C | 47.5% | 77.1 / 27.8 | 61 | L79V (TTA→GTA) | maeB | malic enzyme: putative oxidoreductase/phosphotransacetylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/7); new base C (0/29); total (25/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.85e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTTCGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCC > NC_000913/2577994‑2578291 | tggttCGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTaa < 2:90159/150‑1 (MQ=255) tggttCGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTaa < 1:338709/150‑1 (MQ=255) cggcgACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CAccgc < 2:419897/151‑1 (MQ=255) cggcgACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CAccgc > 2:564787/1‑151 (MQ=255) gcgACAACTTAAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTGCGTCAACTTCAATGTCAAATACAGCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCACCC‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CAccgccg < 1:776783/151‑1 (MQ=255) gACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGt > 2:907251/1‑150 (MQ=255) cAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTAcc > 1:76638/1‑151 (MQ=255) aaCTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGACTTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCg > 1:686387/1‑151 (MQ=255) aaTAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTag > 2:522710/1‑149 (MQ=255) aaTAAATTTGCCCGGGTCGATTTCTCCAACTTCATTGTAAAATACATCAACCCCGGCGAATTTCTAAAACAGACCGCCCTTGCCTCCCATCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAC‑CCCCA‑C‑CACCGCCGTACCGtt < 1:630485/147‑1 (MQ=255) tttGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTAAAATACATCAACCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTCCCATCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCATTGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCAc < 2:22181/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGGGGCGATTTCGTCATCTTCAATGTAAAATACACCAATCCCGGCAAATTTCTAAAACAGACCCCCCTTGCCTCCCATCC‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCAAATGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCAc < 2:1490/150‑1 (MQ=255) tCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGcc > 1:912151/1‑150 (MQ=255) gggTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGccacc > 1:332277/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGTTCGTCACCTACAATGTAAAATAAATCAACCCCGGCAATTTTCTAAAAAAGACCCCCCTTCCCTCCCA‑CC‑CCGGTTTGCCCTC‑CCG‑GCGCGCCAATGTGCCCAAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAg < 2:183460/151‑1 (MQ=255) gTCGATTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAACCCCGGCGATTTTCTTAAACAGACCGCCCTTCCCTCCCATCC‑CCGGTTTG‑CCTC‑CCG‑GCGCGCCAATGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAgg < 1:385109/151‑1 (MQ=255) aGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTAc > 2:250920/1‑151 (MQ=255) ttcctaaaCTTAAATGTAAAATACATCAACCCCGGCGATTTTCTAAAACAGACCGCCCTTGCCTCCCCCCA‑CCGGTTTG‑CCGG‑CCG‑GCGCGCCAATTTTGCCAAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGtt < 2:565039/141‑1 (MQ=255) ttCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCt > 1:726440/1‑151 (MQ=255) cgccaccTTCAATGTAAAATACATCAACCCCGGCGATTTTATAAAACAAACCCCCTTTCCCTTCCCTCC‑CCGTTTTC‑CCTC‑CCA‑GCGCACAAATTTCCCCACC‑CCCCA‑G‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCt < 1:892498/143‑1 (MQ=255) aactaaaatgaaaaaTACACCACCCCCGGCAATTTTCTAAAACAGACCCCCCTTGCCTCCCATCC‑CCGTTTTG‑CCGC‑CCG‑GCGCCCAAATTTTCCCTAC‑CCCCA‑C‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTc < 1:334535/134‑1 (MQ=255) aaCTTCATTTTCAATTCCACCAACCCCGGCGATTTTCTTAACCAGACCCCCCTTCCTTCCCATCC‑CGGTTTTG‑CCTG‑CCG‑CCGCCCAATTGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGc < 2:313385/150‑1 (MQ=255) cTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGt > 2:163480/1‑151 (MQ=255) ttaaaTGTAAAATACATAACCCCCGGCAAATTTCTAAAACAGAACCCCCTTGCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATTTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGc < 2:436310/144‑1 (MQ=255) aaTGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTatat > 2:280231/1‑151 (MQ=255) aaTGTAAAATACATAAACCCGGGCAATTTTCTAAAACAGACCCCCCTTCCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTC‑CCG‑GCGCGCAATTTTTCCCTAC‑CCCAA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTatat < 2:839610/151‑1 (MQ=255) aaaTACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGt > 2:228968/1‑149 (MQ=255) aaTACATCATCCCCGGCGAATTTCTAAAAAAGAAGGCCTTGGCCTTCCATCC‑CCGCTTGG‑CCCG‑CCC‑GCGCGCGATTGTTCCCAAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAgg < 2:956521/151‑1 (MQ=255) acccccGGCAAATTTCTAAAACAGAACCCCCTTCCCTTCCATCC‑CCGTTTTC‑CCTC‑CCA‑GCCCGCAATTGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCtttt < 2:64463/145‑1 (MQ=255) aaccccGGCGAATTTCTAAAACAGACCCCCCTTCCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCAATTGTTGCCAAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTaa < 2:463124/147‑1 (MQ=255) ccccgcaaaaTTTCTAAAAAAAACCCCCCTTCCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCG‑GCGCGCAATTGTTCCATAC‑CCCAA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAAc < 2:699228/141‑1 (MQ=255) acccGGGCAATTTCCTAAACAACACCCCCCTGCCCCCCCCCCCCCGGTTTC‑CCGC‑CCA‑CCGCGCAATTGTGCCCTAC‑CCCCA‑G‑CGCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCt < 1:716290/143‑1 (MQ=255) cccGGCGATTTTCTAAAACAGAACGCCCTTCCCCCCCATCC‑CCGTTTTC‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATTTGCCCTCC‑CCCCA‑G‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTaa < 1:126481/147‑1 (MQ=255) cccGGCAATTTTCTAAAACAG‑ACCCCCCTGCCCTCCAACC‑CCGGTTTT‑CCCGCCCA‑GCGCCCCAATGTCGCCTAC‑CCCCG‑G‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCtt < 1:139513/143‑1 (MQ=255) cccGCCAAATTTCTCAAACACACCCCCCTTGCCTTCCATCC‑CCGGTTAG‑CCGC‑CCC‑GC‑CGCCAAATTTCCCCTA‑CCCCACG‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCtt < 2:468869/143‑1 (MQ=255) ggCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCt > 2:665616/1‑151 (MQ=255) cGATTTTCTAAAACAGACCCCCTTTCCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTC‑CCA‑GCGCGCCAATGTGCCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtt < 2:37031/150‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAAACAGACCGCCTTTGCCTCCCACCC‑CCGTTTTG‑CCTG‑CCG‑GCGCGCCAATGTTGCCTAC‑CCCCA‑C‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtttt < 2:751125/150‑1 (MQ=255) tttttaaaacaaacCCCCCTTCCCTCCCACCC‑CCGGTTTC‑CCGG‑CCG‑GCGCCCCAATTTTCCCAAC‑CCCCC‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTc < 1:428639/144‑1 (MQ=255) tttCTAAAAAAGACCCCCCTT‑CCCTCCCCCC‑CCGGTTTGCCCTC‑CCA‑GCCCCCAATTGTTCCCAAC‑CCCCG‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtttt < 1:845649/148‑1 (MQ=255) ttCTAAAACAGACCGCCCTT‑CCCTCCCCCC‑CCCGTTTG‑CCCGCCCA‑GCGCCCAATTGTTGCCAAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCg < 1:665912/150‑1 (MQ=255) aaaCAGACCGCCCTTCCCTTCCATCT‑CCGGTTTC‑CCTG‑CCG‑CCGCTCAAGTGTTCCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGAt < 2:38028/147‑1 (MQ=255) cAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCa > 1:752919/1‑148 (MQ=255) cccccTTGCTTCCCATCC‑CCGTTTTC‑CCCC‑CCA‑GCCCGCAAATTTTCCTTAC‑CCCCA‑C‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAg < 2:481/148‑1 (MQ=255) ccTTCCCTCCCATCC‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCG‑GCGCGCAAATGTTGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGc < 2:76636/151‑1 (MQ=255) ttGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCgg > 2:702044/1‑151 (MQ=255) ttGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGGGCg > 1:728679/1‑150 (MQ=255) ccTCCCATCC‑CCGTTTTC‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATTTCGCCTAC‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCa < 2:332284/150‑1 (MQ=255) cTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAAc > 1:178123/1‑151 (MQ=255) ttCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACg > 2:461165/1‑151 (MQ=255) ttCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACg > 1:57819/1‑151 (MQ=255) ccctcccggttttC‑CCTC‑CCA‑GCGC‑CCAATTTTTCCCAACCCCCG‑G‑CCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGcc < 1:564776/141‑1 (MQ=255) cATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCt > 1:218120/1‑151 (MQ=255) ccttttttG‑CCCT‑CCA‑GCGCTCCGTTTTTTCAAAA‑CCCCG‑C‑CACCGCCGTGCCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTg < 2:660798/146‑1 (MQ=255) cGGTTTT‑CCCG‑GCAGGCGCGCAATTGTT‑CCCAA‑CCCCA‑GCCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTg < 1:535038/147‑1 (MQ=255) tttG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGt > 1:15900/1‑149 (MQ=255) ttgg‑ccgg‑ccg‑GCGCCCCAATTTTGCTTAA‑CCCCG‑C‑CTCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGt < 2:784744/146‑1 (MQ=255) tgccgccccgcccgcCATTGTTCCCTAC‑CCCCA‑C‑CTCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAgg < 2:686403/138‑1 (MQ=255) ctg‑ccA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGcc > 2:96167/1‑149 (MQ=255) gcgcgcCATTGTTCCCTAC‑CCCAA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAg < 1:125924/151‑1 (MQ=255) aaTGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCgcgc > 2:323787/1‑151 (MQ=255) aaTGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCgcgc > 2:856414/1‑151 (MQ=255) tGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTCACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCtg > 1:219215/1‑151 (MQ=255) aa‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGcc > 1:594472/1‑150 (MQ=255) | TGGTTCGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGCGAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCCATCA‑CCGGTTTG‑CCTG‑CCA‑GCGCGCCAATGTTGCCTAA‑CCCCA‑G‑CACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCC > NC_000913/2577994‑2578291 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |