| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,292,458 | 0 | T | A | 41.4% | 112.3 / 30.5 | 70 | intergenic (+93/+51) | galU/hns | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/6); new base A (0/29); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGTTTT > NC_000913/1292311‑1292604 | ccTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATaa > 2:569327/1‑150 (MQ=255) tGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATaaaaa > 1:886209/1‑150 (MQ=255) ggCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACTAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAAt < 2:1003059/151‑1 (MQ=255) gCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATc < 1:144386/151‑1 (MQ=255) cGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATccc < 1:580182/150‑1 (MQ=255) aaGCCGGGTTTGAAAAAGAGATGGGAATAAAAAAGTAACATCCTTATGGGTTTTATCCACAAAACGGCGTGGAGAAAGCGCCCCCTTTTTTTT‑AAAGTTTTTTTTTATTAATTTTTC‑TAAACCGGAAAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCg < 2:37838/151‑1 (MQ=255) aGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCgg > 1:430664/1‑151 (MQ=255) aGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCgg > 1:196120/1‑151 (MQ=255) gCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCggg > 2:231880/1‑151 (MQ=255) tGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGAtt > 2:542588/1‑151 (MQ=255) gCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGAtttt > 2:241170/1‑151 (MQ=255) ttGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTa > 1:515222/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaagaTGGGAATAAAGAAGTAACATCCTTATCGTTTTTATCCACAAAACGGCGTTGAGAAACCGCCGCTTTTTTTTT‑ATAGTTTTTTTTTATAAAATTGTCTCAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGc < 2:928448/144‑1 (MQ=255) aagaagAGAGGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATGGGTGTTATCCACGAAACGGCTTTGAGAAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTTTTATTAATTTGTCTTAACCGGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAg < 1:933574/149‑1 (MQ=255) gaagaGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCa > 2:104943/1‑149 (MQ=255) aagaGATGGGCATAAAAAAGAAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCTTGGAGCAATCGCCGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTTTTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGA‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAg < 1:406824/150‑1 (MQ=255) gagaTGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTg > 1:1124369/1‑150 (MQ=255) ttAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACaa > 1:83616/1‑150 (MQ=255) aagTAACATCCTTATCGGTTTTATCCACAAACCGGGGTGGAACAATCGCCGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTTTTATAAATTTGTCAAAAACCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGat < 2:629745/150‑1 (MQ=255) aagTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGatt > 1:737340/1‑151 (MQ=255) agTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGatt > 1:1022615/1‑150 (MQ=255) aaCATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTAAAAAAGattatt > 2:832357/1‑150 (MQ=255) cATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGc > 1:427708/1‑150 (MQ=255) cATCCGATTGGGTTTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCGTTTTTTTT‑ATGGCTTATTTTTATTAATTTGTCTAAAACGGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTg < 2:775117/149‑1 (MQ=255) ccttATCGGTTTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCTTTTTTTT‑ATAGTTTATTTTTATTAATTTGTCTAAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTg < 1:159123/147‑1 (MQ=255) tATGGGTTTTATCCACAAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGa < 1:169763/148‑1 (MQ=255) tATCGGTTTTACCCACGAAACGGCTTTGAGCAATCGACGCTGTTTTTTT‑ATAGCTTATTTTTATTAATTTTTCTTAACCCGA‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGa < 2:602815/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATc > 1:273042/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATc > 2:700773/1‑149 (MQ=255) cGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAgg > 1:1125027/1‑150 (MQ=255) aTCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgt < 1:542260/150‑1 (MQ=255) tCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtcg > 1:953788/1‑151 (MQ=255) cccACGAATCGGCTTTGAGCACTCGACGCTGTTTTTTT‑ATAGCTTTTTTTTATAAATTTGTTTTAAACCGA‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtcg < 1:70990/150‑1 (MQ=255) ccACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtcg > 1:435216/1‑150 (MQ=255) ccACAAAACGGGGTTGAGAAATCGACGCGTTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATAAAATTGTCTTAAACCGG‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtcg < 1:45163/150‑1 (MQ=255) ccACAAAACGGCGTTGAGAAACCGCCGCTTTTTTTTT‑ATAGCTTATTTTTATAAAATTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtc < 2:959914/149‑1 (MQ=255) aaccGGCGTGGAGAAACCGCCGCTGTTTTTTT‑ATAGCTTATTTTTATAAAATTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAgg < 2:257977/145‑1 (MQ=255) aaaGGGTGTTGAAAAATCGGCGCCGTTTTTTT‑ATAGTTTATTTTTATAAATTTGTCTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGa < 2:609738/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGAGCAATCGCCGCCTTTTTTTT‑ATAGTTTATTCTTATAAAATTGTCTTAACCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGAttt < 1:1113015/149‑1 (MQ=255) gTTAAGAAATCGAC‑CCGTTTTTTTAATAGCTTTTTTTTATTAATTTGTCTAAAACGGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCt < 1:365817/150‑1 (MQ=255) tGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCtt > 2:664979/1‑149 (MQ=255) cAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTc > 2:816356/1‑149 (MQ=255) aaaTCGACCCGTTTTTTTT‑AAAGTTTTTTTTTATAAAATTGTTTTAACCCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCAt < 2:959487/150‑1 (MQ=255) aaTCGACGCGTTTTTTTA‑ATAGCTTATTCTTATAAATTTGTCTAAACCCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATc < 2:167231/151‑1 (MQ=255) cGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCAt > 2:263264/1‑151 (MQ=255) gACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCAt < 1:249074/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTTTTTT‑ATATCTTATTCTTATTAAATTGTCTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGc < 2:1126538/151‑1 (MQ=255) gcgtttttttt‑AAAGCTTATTTTTATAAAATTGTCTTAACCCGC‑AAAATAAAAATCCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCAtt < 2:83988/144‑1 (MQ=255) cttttttttt‑ATAGTTTTTTCTTATTAATTTGTCTAAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTg < 2:930384/145‑1 (MQ=255) gTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttt > 1:934853/1‑151 (MQ=255) ttttttt‑ATAGCTTATTCTTATTAATTTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCttttt > 1:77493/1‑151 (MQ=255) ttttttt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCttttt > 1:380229/1‑151 (MQ=255) ttttttt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGAAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCttttt > 1:942020/1‑151 (MQ=255) tttttt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAACAAATCCCGTCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGGGCAATTTACAAAAGATTTCTGCCTGATCTGGAAATCGTCGAGGGATTTTACTTCCTCATCCATTGCtttttt > 2:40750/1‑151 (MQ=255) tttt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttttt > 2:39675/1‑149 (MQ=255) tttt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTg > 2:347317/1‑150 (MQ=255) tt‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGAt < 1:542602/150‑1 (MQ=255) t‑ataGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGAtt > 2:642238/1‑150 (MQ=255) cttattcttattAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCt > 1:781453/1‑151 (MQ=255) ttttttttattaAATTGTCTTAACCCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGc < 2:1017235/143‑1 (MQ=255) tttttattaAATTGTTTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGc < 2:1052507/143‑1 (MQ=255) attaAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGCCGAGGGATTTACCCTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACgg > 1:23130/1‑151 (MQ=255) taaatttGTTTTAAACCGG‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTCGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACgg < 2:196120/145‑1 (MQ=255) aaaTTGTCTTAACCCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCt < 2:380218/151‑1 (MQ=255) aaTTGTCTTAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCtt < 2:934827/151‑1 (MQ=255) aaTTGTCTAAACCCGG‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCtt < 1:231885/151‑1 (MQ=255) tCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGcc > 1:531226/1‑150 (MQ=255) aaaCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAg < 2:886183/148‑1 (MQ=255) aCAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGttt < 1:1032135/150‑1 (MQ=255) aaTAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGtttt > 2:410324/1‑149 (MQ=255) | CCTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTT‑ATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGTTTT > NC_000913/1292311‑1292604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |