Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 41.3% | 119.1 / 10.5 | 64 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/7); new base C (0/26); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376357‑1376655 | cTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACAcc > 1:765511/1‑151 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACAcc < 2:739559/150‑1 (MQ=255) tACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACAccc < 2:698689/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACTCCCTc < 2:676866/151‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCt < 1:769658/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCt < 1:361403/150‑1 (MQ=255) cgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGc > 1:744321/1‑151 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACCCCCTCGCCGAt < 2:985170/151‑1 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATg > 2:279354/1‑151 (MQ=255) gACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGcc < 2:662676/151‑1 (MQ=255) cgccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccgccg > 2:1236/1‑151 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTTCCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 1:1062363/1‑150 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 2:43934/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc > 1:389741/1‑151 (MQ=255) tAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc > 2:203193/1‑151 (MQ=255) ggAGGGCGACCGAAAAATGGTGAGTGATCCCCGGCGCGTACTGAAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGAACCCGTTGTTTATCCCGACCCGTAAA‑C‑CCC‑CTATCAG‑GATATTATTATAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtcg < 1:323768/149‑1 (MQ=255) gACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaa > 1:187415/1‑150 (MQ=255) ggccaccaaaaaaGGGGGAGTATTTCCCGGCGCGTACGGGAACGGGTCCCCGCGCGTCCCGGACCGGTGGTTTATCCCGAACCTTAAA‑C‑CCG‑TTATCGG‑GTTAATATGATCACCCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 2:520447/141‑1 (MQ=255) ggCGCCCGAAAAATGGGGAGTGATCCCCTGCGCGTACTGAAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTTTATCTC‑AACCCTTAA‑ACCCG‑CTATCAG‑GATCATATAATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc < 1:676361/150‑1 (MQ=255) ggCGCCCGAAAAAGGGTGAGTGTTCCCGTGCGCGTACTGAAACAGGCCCCCGCGCGTCCCGAACCGGGGGTGTATCTCAAACCGTAAA‑C‑CCG‑TTACAGG‑GATAATATAACAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaaa < 2:1027197/148‑1 (MQ=255) ggCGACCGAAAAATGGTGAGTGTTCCCCTGCGCGTACTGGAACGGGTCGCCGCGCGTACCGGACCCGTGGTTTATCTCGAACCGTTAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATAATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaaaa < 1:334333/149‑1 (MQ=255) gccaCCGAAAAATGGGGAGTGATCCCCGGCGCGTACGGAAAGAGGCCGCCGCGCGTACCGGACCCGTGGTGTATCTCGAACCGTAAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATAATAAACCCCCCCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACg < 1:1110723/147‑1 (MQ=255) cGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGAt > 2:175479/1‑151 (MQ=255) cGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGAt > 1:931919/1‑151 (MQ=255) cGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACTGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt > 2:769350/1‑150 (MQ=255) aaaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 2:853048/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACAt > 1:572023/1‑151 (MQ=255) gtgaTCCCCTGCGCGTACGGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGGAACGGGGGTGTATCTCGAACCGTAAA‑C‑CCG‑CTATAAG‑AATAATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGa < 1:822385/150‑1 (MQ=255) taaTTCCCTGCGGGTAGTGGAGAAGGCCGCCGCGCGTACGGAAGCGGTGGTGTATCTCGACCCTTAAA‑A‑CCG‑TTCGAGG‑TATAATATGATCAACCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACa < 2:681918/145‑1 (MQ=255) tccccTGCGCGTAGTGGAACAGGTCGCCGCGCGTCCGGGACCCGTGGTGTATCTCGAACGGTAAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTa < 1:373598/147‑1 (MQ=255) cccTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCgg > 2:480269/1‑151 (MQ=255) gcgTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAtt > 1:65571/1‑150 (MQ=255) tACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt > 1:481835/1‑150 (MQ=255) tGGAGCAGGCCGCCGCGGATGCGGTAACGGTGTTGT‑TCCCGAACCATTAACA‑CGC‑CTACAAG‑GAACGTTTGACAAACACCCCCGCAGTGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTc < 2:656752/146‑1 (MQ=255) aCAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 2:854919/1‑151 (MQ=255) cggggcgTACGGGACCGTTGGTTTTTCTCGAACC‑TTAA‑A‑CCGCCTATGAG‑AATCAAAAGACAACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAatat < 2:757624/144‑1 (MQ=255) ccgcGGGTACCGGACCGGTGTTGTACCTAAAACCGTTAA‑C‑CCG‑TTACAGG‑GATAATATGACAACCCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAatat < 2:698414/148‑1 (MQ=255) cgcgctTCCCGGACCCGTGGTTTACCTCAACCCGTAAA‑C‑CCC‑TTATCAG‑TTTCATATTACAACCCCCCTCCCCGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCga < 1:38556/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCga > 1:921590/1‑150 (MQ=255) tACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:890019/1‑147 (MQ=255) aCCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGGCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAagaaga > 1:1114293/1‑149 (MQ=255) cGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAAc > 2:280855/1‑151 (MQ=255) accggtggtgTACCTCGATCTGTTAA‑C‑CCC‑CTACAAG‑GATCATATGAACACCCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAAc < 1:769372/144‑1 (MQ=255) acccGTGGTGTATCTCAACCCTTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt < 1:526675/148‑1 (MQ=255) acccGTGGTGTATCCCGACCCGATAA‑C‑CCG‑TTA‑CAGAGATAATAGGATCAACCCCCTCGCCTATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATaa < 1:707355/145‑1 (MQ=255) tggtgTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcgc > 2:309678/1‑150 (MQ=255) ggtgTACCTCAACCCTTTAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATAATATGACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCa < 1:1236/150‑1 (MQ=255) tttATCCCGAACCTTAAA‑C‑CCG‑CTATAAG‑GATAATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTg < 1:1124004/141‑1 (MQ=255) tgttccccGACCCGTTAA‑C‑CCG‑TTAAAAG‑AATCAAATAAACAACCCCCCCGCAGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAgg < 2:142242/143‑1 (MQ=255) tgtATCCCGACCCTTTAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATAAACCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAgg < 1:478509/150‑1 (MQ=255) tgtACCTCAACCCGTAAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGACCAACCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAgg < 1:992065/150‑1 (MQ=255) tacctcaacccGTTAA‑T‑CCT‑TTATCAG‑GTTAATAGGATAAACCCCCTGGCGAATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcg < 1:503388/141‑1 (MQ=255) tATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcgc > 1:156531/1‑151 (MQ=255) ctcGACCCTTAAA‑C‑CCG‑CTATCAG‑AATCATATAAACAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc < 1:1077737/146‑1 (MQ=255) gAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATg > 1:791061/1‑151 (MQ=255) aCCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGAc > 1:528316/1‑151 (MQ=255) cG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 1:274912/1‑151 (MQ=255) cTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTg > 2:663067/1‑151 (MQ=255) cTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTg > 2:1108458/1‑151 (MQ=255) gaacaatatGAACACCACCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt < 2:424933/146‑1 (MQ=255) gaaTCATATGAACAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc < 2:389706/146‑1 (MQ=255) tatGACAAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt < 1:43934/148‑1 (MQ=255) tCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCatat > 2:288823/1‑151 (MQ=255) aaCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCa < 1:327349/146‑1 (MQ=255) acCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCgg > 1:341129/1‑151 (MQ=255) | CTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAA‑A‑CCG‑CTATCAG‑GATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376357‑1376655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |