Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,781,645 | 0 | A | C | 43.7% | 124.8 / 13.1 | 72 | V361G (GTT→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/2); new base C (0/31); total (38/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.17e-18 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCC > NC_000913/2781500‑2781791 | tataATTGTTTTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACcccc < 2:917550/150‑1 (MQ=255) ttgtGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATc > 2:212507/1‑151 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGt > 2:421315/1‑151 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGt > 2:82439/1‑151 (MQ=255) ttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg > 1:666826/1‑151 (MQ=255) ccccGCCGTTTTTGATTTTTGTCGTTCCGTTGTTGATTTTGGTGCTTGGGGCTGTGCTATAATTATTAATTCTTTGTGTTCCCCTATTAATTAGTATTTTTGCCTCTTTCCTTGAACCACCCATCCCCCCGCCATTATCTATTCGGGTc < 2:1040821/148‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg > 2:362337/1‑147 (MQ=255) gccgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATc > 2:912698/1‑150 (MQ=255) ttttatttttttGCTTTCTGTTTTTGATATTGGCGCCTGTGCCTTTGCTATAATTATAAATATTTTGTGCCCCACCATTAATTTTGGTTTTTGTCGTGTTTCCGGCAACTTCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCtt < 2:978702/142‑1 (MQ=255) tttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 2:921030/1‑150 (MQ=255) ttGATTTTTTGCGTTCCGTTGTTGATATTGGTGCCTTTGGCTATCCCATATTTATAAATTTTCTGTGTCCCCCCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTa < 2:372115/150‑1 (MQ=255) ttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 2:899877/1‑149 (MQ=255) gATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGc > 2:1012326/1‑150 (MQ=255) ttttGCGTTCCGCTTTTGATTTTGGTGCCTGTGGTTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCGGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCAtt < 2:878593/149‑1 (MQ=255) ttttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCTTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCATTAATTAGGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCAAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTg < 1:457014/150‑1 (MQ=255) tttGCGTTCCTTTTTTGATTTTGGTGCTTGTGCCTATCCCATATTTTTTAATTTTCTGTGTCCCCCCTTTATTTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg < 2:611030/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTa > 2:915870/1‑150 (MQ=255) gCGTCCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATATTTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt < 1:613335/149‑1 (MQ=255) gTTCCGCTTTTGATATTGGTCCCTGTGTCTTTTCCATAATTATTAATATTTTGTGGGCCTCAATTAATTTTGTTTTTTGGCGTTTTCCTTGCAACACCCACACCACCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTa < 1:904554/148‑1 (MQ=255) tCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt > 2:577407/1‑151 (MQ=255) ccGCTGTTTATTTTGTTCCCTGTGTTTATGCCATATTTATAAATATTCTTTGTCCCCCCATTAATTTGGTTTTTTGTCGCTTTCCCCGCAACATCAAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaa < 2:1005697/146‑1 (MQ=255) ccGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg > 1:299026/1‑151 (MQ=255) cTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGAc > 1:432752/1‑150 (MQ=255) tGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt > 2:201410/1‑151 (MQ=255) ttGATTTTGGTGCTTGGGGCTATGCCTTATTTATAAATTTTCTGTGTCCCCCCATAATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt < 2:25363/144‑1 (MQ=255) tGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGt > 1:102100/1‑151 (MQ=255) tatTGGTGCCTGTGGTTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCTTTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTc < 2:299016/150‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCt < 1:943507/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTa < 1:82441/151‑1 (MQ=255) tGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc > 2:193443/1‑151 (MQ=255) ccTGTGGTTATGCATTATTTATTAATATTCTGGGTCCCACCTTTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc < 1:753655/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt > 1:593570/1‑151 (MQ=255) ccTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt > 2:839778/1‑151 (MQ=255) ggCTTTGCTATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCCCCATTAATTATGTTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaat < 2:414263/150‑1 (MQ=255) ggCTATCCCATAATTATAAATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCttt < 1:506361/147‑1 (MQ=255) tATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATc > 2:495101/1‑151 (MQ=255) aTGCCATAATTATTATTATTCTGTGTCCCACTTTTAATTATGTTTTTGGTGGCTTTCCCACCAACTCCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTaataat < 1:639014/149‑1 (MQ=255) gCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTc > 1:903162/1‑151 (MQ=255) attattAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt > 2:174748/1‑151 (MQ=255) ttattaATTTTCTGTGTGCCACCATTATTTATGGTATTTGTCGCTTTCCCTGCAAAATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 1:982807/150‑1 (MQ=255) ttataaATTTTCTGTGCGCCACTATTAATTATGGTTTTTGCTGCTTTTCTTCAATCACCCATAGCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 1:1054789/150‑1 (MQ=255) ttaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTTTGTTTTTTGTCGTTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGc < 2:270007/149‑1 (MQ=255) taATATTTTGTGCCCCCCCATAAATTTTGGTTTTTGTGGCGTTTCCCCCTCAATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCTCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCg < 2:1004383/150‑1 (MQ=255) taATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTCTCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCg > 2:921545/1‑150 (MQ=255) tatTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAcc > 1:431414/1‑151 (MQ=255) tgtgtcCCCCCTTTATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCTTTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCatat < 1:1087603/150‑1 (MQ=255) tgtgCCACCATTTTTTTGGGTTTTTGCCCCTTTTCCTGCAACATAAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATg < 2:1047716/149‑1 (MQ=255) tgtcCCACAATTAATTATGGTTTTTGTCGGTTTCCCTGCAACACCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCatat < 1:899902/148‑1 (MQ=255) tcccccccctttaattaTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGc < 2:9658/140‑1 (MQ=255) gttcccaccaTTAATTATGTTTTTTGTCCTTTTTCCTCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATg < 2:1087286/145‑1 (MQ=255) tgCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGtt > 1:455365/1‑151 (MQ=255) gCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGttt > 1:996855/1‑151 (MQ=255) ccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt > 1:661648/1‑151 (MQ=255) ttaattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 2:562697/1‑150 (MQ=255) taattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTa > 1:476761/1‑150 (MQ=255) atttaTGGTATTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTaa < 1:374823/148‑1 (MQ=255) aattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTaa > 1:1094565/1‑150 (MQ=255) tGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGac > 2:689924/1‑150 (MQ=255) cgcgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 1:33522/1‑151 (MQ=255) gcgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 2:584656/1‑150 (MQ=255) cgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 1:714977/1‑149 (MQ=255) tttCCTGCAACTCCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt < 2:546709/144‑1 (MQ=255) tttCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc < 1:913772/147‑1 (MQ=255) tttCCGGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAg < 2:992062/149‑1 (MQ=255) ccTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCaa < 1:212507/149‑1 (MQ=255) cTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAacac > 1:126147/1‑151 (MQ=255) cTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAacac > 1:472310/1‑151 (MQ=255) aaCATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTg > 2:715308/1‑151 (MQ=255) tCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTg > 2:620290/1‑151 (MQ=255) ccATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTg < 2:151578/146‑1 (MQ=255) aTACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGc < 1:983297/149‑1 (MQ=255) tAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGcc > 2:334517/1‑149 (MQ=255) aCCCCGCCATTATCTATTCGGGGCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAAGAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACTCATGGTCt < 2:713254/144‑1 (MQ=255) | TATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCC > NC_000913/2781500‑2781791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |