Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,186,605 | A→C | H419P (CAC→CCC) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,186,605 | 0 | A | C | 97.3% | 267.8 / ‑3.0 | 74 | H419P (CAC→CCC) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (50/21); total (51/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 |
GGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGT > NC_000913/4186471‑4186752 | ggAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGa < 1:514762/149‑1 (MQ=255) aGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCg > 1:434682/1‑151 (MQ=255) gTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTg < 2:1116888/149‑1 (MQ=255) aaaCCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCg > 1:92851/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGActct > 2:54528/1‑151 (MQ=255) cATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCa < 1:492771/150‑1 (MQ=255) tACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGGCGGTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGt > 2:606966/1‑150 (MQ=255) aCGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCt < 1:601626/151‑1 (MQ=255) cAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGt > 1:315043/1‑151 (MQ=255) aaGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTa < 2:265743/151‑1 (MQ=255) cTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATcc > 1:469874/1‑151 (MQ=255) tGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATcc > 1:921191/1‑150 (MQ=255) ggAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAg < 2:448801/151‑1 (MQ=255) aCTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGc > 1:950267/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGc > 1:1059003/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCAttt < 2:814551/151‑1 (MQ=255) cGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTg > 2:956525/1‑151 (MQ=255) tGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGa > 2:937993/1‑150 (MQ=255) cTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTAc > 1:587862/1‑150 (MQ=255) tACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTg > 2:392566/1‑151 (MQ=255) accaccATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACt < 1:645496/149‑1 (MQ=255) gccaTTAAAGCTGTGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACGCTCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGTACCGTCTGGGTATCCAGGCATTGCAACCGGTaat < 2:725045/145‑3 (MQ=255) accaTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCg < 2:345641/151‑1 (MQ=255) ccaTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCg > 2:344896/1‑150 (MQ=255) ccaTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCg > 1:889975/1‑150 (MQ=255) caTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGa > 1:499084/1‑150 (MQ=255) caTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGa > 2:521840/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGa > 1:682242/1‑149 (MQ=255) ttAAAGGTGCGAAGAAAATGGTTGACCGCGAAGAAGCTGTCGATTGGGATATCCTGGACGAGGTTATCTGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCATCGTCTGGGAATCCGGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAg > 2:25352/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGt > 2:777192/1‑151 (MQ=255) tAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTCGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAgg > 1:266111/1‑150 (MQ=255) gCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAg < 2:112037/151‑1 (MQ=255) cTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGc > 2:594306/1‑151 (MQ=255) cTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGc > 2:560011/1‑151 (MQ=255) gCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCt < 2:375646/150‑1 (MQ=255) gaaAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAg < 2:1023014/151‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAg < 2:260683/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGc < 2:950242/151‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGc > 2:1052784/1‑151 (MQ=255) aaaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCTTTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCt > 1:340482/1‑151 (MQ=255) aaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCt > 2:913042/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTg > 2:185966/1‑151 (MQ=255) aaTGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTg > 1:566547/1‑151 (MQ=255) ggTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCAc > 2:673205/1‑151 (MQ=255) tGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCg > 2:928368/1‑151 (MQ=255) gAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCg < 1:775876/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCg > 1:523997/1‑150 (MQ=255) aGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCt > 1:130278/1‑151 (MQ=255) gaagaaGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCTTTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGttt > 1:423377/1‑151 (MQ=255) cTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGc > 2:699439/1‑151 (MQ=255) gTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCat < 1:247187/151‑1 (MQ=255) gTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCat > 2:558346/1‑151 (MQ=255) gTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCat > 1:76313/1‑151 (MQ=255) cGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCatat > 1:255231/1‑151 (MQ=255) tGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAAc < 2:1061720/150‑1 (MQ=255) tGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACg > 2:875673/1‑151 (MQ=255) gggATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACg < 2:526800/150‑1 (MQ=255) gATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCg > 2:1057509/1‑151 (MQ=255) atCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGAc < 2:434670/150‑1 (MQ=255) atCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACt > 1:726475/1‑151 (MQ=255) atCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACt > 1:70347/1‑151 (MQ=255) tCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACtt > 1:279916/1‑151 (MQ=255) cTGGACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCg > 2:405784/1‑151 (MQ=255) ggACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGa < 2:809045/150‑1 (MQ=255) ggACGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGAt > 1:1012415/1‑151 (MQ=255) aCGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATgg > 1:388962/1‑151 (MQ=255) cGAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGt > 2:450109/1‑151 (MQ=255) gAAGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTg > 2:533419/1‑151 (MQ=255) aGTTATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGAc < 1:152766/151‑1 (MQ=255) ttATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGAcc > 1:709010/1‑150 (MQ=255) tATCCGCGAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGAcc > 1:330228/1‑149 (MQ=255) gAACCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTg > 1:502722/1‑151 (MQ=255) aaCCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTg < 2:635470/150‑1 (MQ=255) aaCCCCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGt > 1:54726/1‑151 (MQ=255) | GGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGT > NC_000913/4186471‑4186752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |