| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,469,886 | IS1 (–) +9 bp | coding (756‑764/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 96 (1.270) | 75/298 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2469886 = | 0 (0.000) | coding (756/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
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AGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTT > NC_000913/2469737‑2470034 | agagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct > 2:192212‑M2/150‑150 (MQ=255)agagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct > 2:453922‑M2/150‑150 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTaa < 2:975802‑M2/3‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |