Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,701,310 | 0 | A | C | 41.4% | 111.4 / 11.2 | 71 | T118T (ACA→ACC) | malY | PLP‑dependent beta‑cystathionase and maltose regulon regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/11); new base C (0/29); total (30/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.38e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTTCTCGCGGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAATTATGCTCCTG > NC_000913/1701160‑1701460 | gTTTCTCGCGGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCcacaca < 2:801631/151‑1 (MQ=255) ttCTCGCGGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACAcc > 2:122402/1‑151 (MQ=255) tctcGCGGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACAccc > 1:279714/1‑151 (MQ=255) cgcgGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCg < 1:817555/149‑1 (MQ=255) cgcgGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGc < 2:382804/150‑1 (MQ=255) gcgGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCt < 2:208987/151‑1 (MQ=255) gcgGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCt > 1:862106/1‑151 (MQ=255) gcgGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCt > 2:490135/1‑151 (MQ=255) ttGCCCATTGGTTTTCCCCCCAGCATTCCCCCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGTTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGGGTGGTGACCCACACACCCGCCTATGACg < 2:259331/150‑1 (MQ=255) ttGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGc > 1:1128308/1‑151 (MQ=255) tGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGc > 2:911590/1‑150 (MQ=255) ccACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCAttt > 1:795304/1‑151 (MQ=255) tttcCCCCCCAGCATTACCCCGCCATCGTTTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGTTTTCAGAACTGTTTCGTGAGGGGGCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGGGTCCCACCCGCCCGCCTATGACGCATTTTACAAg < 1:206770/150‑1 (MQ=255) tttCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGc > 1:378542/1‑151 (MQ=255) tttCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTAAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGGGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCAAACACCCGCCTATGACGCATTTTACaa > 1:574224/1‑148 (MQ=255) ttCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGcc > 2:628707/1‑151 (MQ=255) ccccccAGCATTACACCGCCATGGTTTCTCAGAGGGTGGTGTAGGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGACCTGTTTCGTCAGTGGTCTAAAACGGGTGAAGGCGTGGTGACCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCAt < 2:157905/148‑1 (MQ=255) ccACCCATCATTACCCCCCCATCGATTCTCAGACGGTGGTTTATGCCCCTTTTGTCATCTATGTGTTTCCAGAACTGTTTCGCCAGTGGTCTAAAACGGGTGAGGGCGTGTTGATCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAgg < 2:257492/147‑1 (MQ=255) cACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCAtt > 2:106402/1‑151 (MQ=255) aCCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTg > 2:530423/1‑151 (MQ=255) ccacgCATTACCCCCCCATCGATTCTCAGAGGGGGGTGTATGGCCCTTCTGTCATTTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGGGGTCTAAAACAGGTGAGGGGGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGa < 2:1087071/147‑1 (MQ=255) ccAGCTTTCCCCCGCCATCGTTTCTCAGAGGGTGGTGTAGGGCCTTTCTGTCTTCTATATGTTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACGGGTGAGGGCGTGGTAACCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGaa < 2:1108668/151‑1 (MQ=255) cATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGt > 1:23428/1‑150 (MQ=255) aTTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTa > 2:382900/1‑150 (MQ=255) ttcccccGCCATCGTTTCTCGGGGGGTGGTGTAGGGCCCTTCTTTCATCTATATGTTTTAAGAACTGATCCGTCGGGGGTCTGAAACAGGGGAGGGGGGGGAGCTCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTaa < 2:1105729/145‑1 (MQ=255) cccccccATCGTTTCTCAGGGGGTGGTTAAGGGCCCTTCTGTCATCTATAGGTTTTAAAAACTGTTTCGTCGGTGGTCTAAAACAGGTAAGGGCGTGGGAACCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCa < 2:845059/145‑1 (MQ=255) ccccGCCATCGATTCTCAGAGGGTGGTGTAGGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTAAGAACTGATTCGTCAGTGGTTTGAAAGGGGTGAGGGCGTGGTAATCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCa < 1:757750/148‑1 (MQ=255) ccccccATCGATTCTCAGACGGTGGTGTAGGCCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAAAACTGATTCGTCAGTGGTCTAAAACAGGTGAGGGGGTGGTTACCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAgc < 1:658258/147‑1 (MQ=255) cGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAgcg > 1:170392/1‑150 (MQ=255) gATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGCGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGCCGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAg > 2:879016/1‑148 (MQ=255) ctcAGGCGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAGGGCGTGGTGATCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAAt < 2:573106/148‑1 (MQ=255) agagGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATTTATTTGTTTTCAAACCTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGGGACCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATg < 2:909511/146‑1 (MQ=255) gACGGTGGTTTATGCCCCTTCTTTCTTCTATATGTTTTCAGAACTTTTTCGTCAGTGGTCTAAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACCCACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGtt < 1:126932/151‑1 (MQ=255) gACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGtt > 2:542942/1‑151 (MQ=255) ggtgttGTATGGCCTTTCGGTCTTCTTTATGTTTTCAAAACTGATTCGTCGGTGGTCTGAAACAGGTAAAGGCGTGGTTACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCt < 1:525012/151‑1 (MQ=255) gtggtgTATGGCCCTTCTGTCATTTATATGGTTTCAGAACTGTTTCGTCAGTGTTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCtt < 1:1140890/151‑1 (MQ=255) gtggtgTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCtt > 2:962303/1‑151 (MQ=255) ggtgTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCtt < 2:454988/149‑1 (MQ=255) ggtgTAGGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAAAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACGGGTGAGGGCGTGGTGATCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCttt < 1:240516/150‑1 (MQ=255) tATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTag > 2:922997/1‑148 (MQ=255) aTGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCA‑TTTAAAAGGCCCTTGAAGGTAACCCGCGCACCGGAAAGCCCGGTGCTTTAGaaaa > 2:461597/1‑150 (MQ=255) cctttCTGTAATCTATATGGTTTAAAAACTGTTTCGCCAGTGGTCTAAAAGAGGTGAGGGGGGGGTAACCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGaa < 2:313616/144‑1 (MQ=255) cccTTTTGTTTTCTATTTGTTTTCAGACCTTTTTCGTCATTGGTCTGAAACGGGGGAAGGCGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTaga < 1:636332/144‑1 (MQ=255) cccTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGCCAGTGGTCTAAAACGGGTGAAGGGGTGGTGATCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCa < 2:1078333/150‑1 (MQ=255) tGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGAt > 2:998591/1‑151 (MQ=255) gtaatttataTGGTTTAAGACCTGATTCGTCAGTGGTCTAAAACAGGTGAAGGGGTGGTAATCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGa < 2:335119/143‑1 (MQ=255) tttatGTTTTAAAACCTGATCCGTAAGGGGTTTGAAAAAGGTGAGGGCGTGGTGATCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGAtggt < 1:41782/145‑1 (MQ=255) tatGTTTTCAAAACTAATTCGTCAGTGGTCAAAAACAGGTGAGGGCTTTGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGAtggt < 2:733224/145‑1 (MQ=255) tatGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGttt > 2:416081/1‑151 (MQ=255) atGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGtttt > 1:371133/1‑151 (MQ=255) gttttCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTAAAACAGGTGAGGGGGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATggttggtt < 1:853832/145‑1 (MQ=255) ggTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGc > 2:316337/1‑151 (MQ=255) gtttgagaccgttttCGTCAGTGTTCGAAAACAGGTGAAGGGTTGGTGACCCCACCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGtttt < 1:1029629/135‑1 (MQ=255) ttCAAAACTGTTTCTTTGGTGTTCTGAAAAGGGTGAGGGTGTGGTAACCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGa < 1:1146738/150‑1 (MQ=255) accTGTTTCGGCGGTGTTCTGAAACAGGTGAGGGGGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATggg < 2:565712/149‑1 (MQ=255) aaCTTATTCGTCATTGGTCTAAAACGGGTGAGGGGGTGGTAACCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATgg < 2:99144/150‑1 (MQ=255) gATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCa > 2:729827/1‑149 (MQ=255) ttCGTCAGTGGTCTAAAACAGGTGAAGGCGTGGTGACCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAg < 1:490150/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCTGAAACGGGGAAGGGCGTGGGGCCCAACCCACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTg < 1:998613/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGa > 1:900483/1‑150 (MQ=255) gtgtTCTGAAAGGGGTGAGGGCGTGGTAACCCACCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGcc < 1:1116070/151‑1 (MQ=255) ggTCTAAAAGAGGTGAAGGCGTGGGGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCgt < 2:648819/151‑1 (MQ=255) tCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCgtgt > 1:556021/1‑151 (MQ=255) aaaCAGGTGAAGGCGTGGTAACCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTgg < 2:585356/150‑1 (MQ=255) aCAGGTGAGGGTGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACGAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGa < 1:311112/151‑1 (MQ=255) ggggaggggggggtgACCCCCCCCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGaaa < 2:128/139‑1 (MQ=255) ggTGAAGGCGGGGTAACCCCCACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGaa < 1:921056/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAAcc > 1:265670/1‑148 (MQ=255) gggtggtgACCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATg < 1:220367/149‑1 (MQ=255) gCGTGGTGACCCACACCCCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATg < 1:857705/151‑1 (MQ=255) gacccccacccCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAAtt < 1:911612/145‑1 (MQ=255) aTCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAAtt > 1:572758/1‑150 (MQ=255) tCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAATTAt > 2:338860/1‑151 (MQ=255) acCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGCAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAATTATGCTCCtg > 1:624958/1‑151 (MQ=255) | GTTTCTCGCGGCTATTGCCCACTGGTTTTCCACCCAGCATTACACCGCCATCGATTCTCAGACGGTGGTGTATGGCCCTTCTGTCATCTATATGGTTTCAGAACTGATTCGTCAGTGGTCTGAAACAGGTGAAGGCGTGGTGATCCACACACCCGCCTATGACGCATTTTACAAGGCCATTGAAGGTAACCAGCGCACAGTAATGCCCGTTGCTTTAGAGAAGCAGGCTGATGGTTGGTTTTGCGATATGGGCAAGTTGGAAGCCGTGTTGGCGAAACCAGAATGTAAAATTATGCTCCTG > NC_000913/1701160‑1701460 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |