Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,481,804 | 0 | G | A | 40.8% | 109.2 / 31.1 | 71 | P125S (CCA→TCA) | emrY | putative multidrug efflux system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/6); new base A (0/29); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCT > NC_000913/2481654‑2481954 | atatCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTgg > 2:163810/1‑151 (MQ=255) atCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGaa < 2:1171454/151‑1 (MQ=255) ccAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑Gc < 2:319896/151‑1 (MQ=255) aGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑Gccc > 1:941786/1‑151 (MQ=255) aGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑Gccc > 2:832703/1‑151 (MQ=255) aGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑Gccc > 1:136932/1‑151 (MQ=255) cTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCg > 1:988845/1‑151 (MQ=255) aaaGTTATCACAAATATACCCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAC‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGcc < 1:636959/151‑1 (MQ=255) aaGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGcc > 2:1255657/1‑150 (MQ=255) aaGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCa < 1:1214219/151‑1 (MQ=255) ttATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCAtt > 2:856316/1‑150 (MQ=255) atatAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGa > 1:13545/1‑150 (MQ=255) tataACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAAc > 1:207956/1‑151 (MQ=255) tataACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAAc > 2:801564/1‑151 (MQ=255) tCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAatat > 1:983567/1‑151 (MQ=255) ggCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATc > 1:549545/1‑150 (MQ=255) ccaaaatatGGGAGCAATAACCAGGTTAATTACCAATAATGCAAAACAAATTTTTTTTTTTTCGGGGGGATATTTCTTAAAAAAAAAC‑CTCT‑GTGAAAGAGAAATAACCG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAat < 2:824702/140‑1 (MQ=255) ccACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGc > 1:1268893/1‑150 (MQ=255) caTATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACAt > 1:276499/1‑151 (MQ=255) atatGGGAGAGATAATCCCGGTCATTGACAATAATGCAAGAGAATATGTTTTTTTTTCGGGGGAATAATTCTTAAAAAATAAC‑CTCT‑GTGAAAGAAAAATCAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGcac < 2:413114/148‑1 (MQ=255) tatCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATc > 1:304552/1‑150 (MQ=255) atCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCa > 1:1297456/1‑150 (MQ=255) gAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAGTAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCACCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGAACATCCAGAtt > 2:80605/1‑151 (MQ=255) gCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTgg > 1:331004/1‑151 (MQ=255) gCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTgg > 1:1197640/1‑151 (MQ=255) aTAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCg > 2:218722/1‑151 (MQ=255) aaTCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGCCTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGa > 2:788428/1‑150 (MQ=255) accgcGGTTATTAACCATAAGCCAAGAACAATTTTTTTTTTTTCGGGCGAATAATCCCTAAAAAAAAAA‑CTCT‑GAGACGGTGAAATTAGCG‑CCACCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATa < 1:479767/147‑1 (MQ=255) aCGGTCATTGACCAAAATGCCAGAGCAATTTTTTTTTTTTCGGGGGGATAATTCTTAAATAAAAAA‑CTCT‑GTGAAAGTGAAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATa < 1:879253/148‑1 (MQ=255) ttGACCATAATGCAAGACAAATTTTTTTTTTTTCGGGCGGATAATT‑CTTAAAAAAAAA‑CCCTGGTAAAAGTGAAATTACCG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTaca < 1:575067/148‑1 (MQ=255) tcaCCAAAATCCAAGAGAAATTTTTTTTTTTTCTGGGGAATATTTCCTAAATAAAAAA‑CTCT‑GTAACGGTGAAATAAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAt < 1:19823/148‑1 (MQ=255) tGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt > 1:392259/1‑151 (MQ=255) gACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt > 1:362433/1‑150 (MQ=255) aCCATAATGCCAGAGAAAATGTTCTTTTTTCGGGCGGATATTTCCTAAAAAAAAAA‑CTCG‑GTGAAAGTGAAATAAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAAGCTaca < 1:440596/145‑1 (MQ=255) ccATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTaa < 1:150283/150‑1 (MQ=255) caaTAATCCAAGAGAAATTTTTTTTTTTCCTGGC‑GAAAATTTCTTAAAAAAAAACCTCT‑GTAAAAGTAAAATTACCG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt < 2:867057/146‑1 (MQ=255) cATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATg > 1:971270/1‑151 (MQ=255) aaTGCCAGAGAAATTTTTTTTTTTTCGGGCGAATAATTCTTTAATAAAAAC‑CTCT‑GGGACAGGGAAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAg < 1:673635/151‑1 (MQ=255) aTGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GGGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGa > 2:846629/1‑148 (MQ=255) aTGCCAAAGAAAATTTTTTTTTTTCGGGCGGATAATTCCTTAAAAAAAAA‑CTCT‑GAAACAGTGAAATAAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGa < 2:1074476/151‑1 (MQ=255) ccAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGa > 2:402161/1‑148 (MQ=255) agagaatttGTTTTTTTTTCTGGCGATTATTTCCTTAATAAAACC‑CTCT‑GTGAAAGTGAATTTACCG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACa < 2:1228098/140‑1 (MQ=255) gataaaaTGTTTTTTTTTCGGGCGTATATTCCATTAATAAGACA‑TTCT‑TTAAAGGTGAAATTACCG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGAc < 1:485389/142‑1 (MQ=255) 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aaaTTTTTTTTTTTCGGGCGAATAATTCTTTAAAAAAAAC‑CTCT‑GTGACAGTGAAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaa < 1:584103/149‑1 (MQ=255) aaaTGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaaa > 2:1218445/1‑150 (MQ=255) ttCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAg > 2:612126/1‑150 (MQ=255) tttCTGGGGGATATTTCTTAAAAAAAAAC‑CTCG‑GTGACAGTGAAATAAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTg < 1:232478/150‑1 (MQ=255) tttCTGGCGAATAATTCCTAAAAAAAAAC‑CTCT‑GTGAAAGTGAAATAAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTg < 2:1106564/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGaa > 2:666503/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGaa > 2:219255/1‑149 (MQ=255) tCCTTAAAAAAAAACCTCG‑GTAACAGTGAAATAAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTaa < 1:408290/143‑1 (MQ=255) ttAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTa > 1:120766/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAAAAT‑CTCG‑GTGAAAGAGAAATTAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaataat < 2:1006607/146‑1 (MQ=255) aaaaataaA‑CTCT‑GGGACAGGGAAATTAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCtt < 1:1123531/144‑1 (MQ=255) taataaA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg > 2:212860/1‑151 (MQ=255) aaaaaa‑CTCT‑GTGATAGTAAAATTAAGG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg < 2:647456/147‑1 (MQ=255) aaaaaa‑CTCT‑GGGACAGGGAAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg < 1:626758/147‑1 (MQ=255) aaaaacctct‑GTGAAAGTAAAATTACCG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg < 2:1262446/144‑1 (MQ=255) aaa‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCt > 1:1387272/1‑150 (MQ=255) aaa‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCt > 1:503646/1‑150 (MQ=255) aaa‑CTCT‑GTGACAGTAAAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTa < 1:1039477/151‑1 (MQ=255) a‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTAtt > 2:843671/1‑151 (MQ=255) ctct‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTc > 1:1231101/1‑151 (MQ=255) tctggaagagggAAATAACGCGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTAt < 2:535652/138‑1 (MQ=255) gtgAGAGTGAATTTAGCG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCttt < 1:913694/150‑1 (MQ=255) gtgAAAGGGAAATTAACG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCt < 2:13546/148‑1 (MQ=255) aaaGTGAAATTACCG‑CCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCttt < 2:1197612/145‑1 (MQ=255) tGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGTCTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGCGACTGAAAGTACAAATAATCTTAATTCGCTTATTGTTTGTGCCa > 2:476524/1‑149 (MQ=255) gAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCt > 2:1024974/1‑151 (MQ=255) gAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCt > 2:103685/1‑151 (MQ=255) | ATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAA‑CTCT‑GTGACAGTGGAATTAACG‑GCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCT > NC_000913/2481654‑2481954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |